【昆明动物所在精神分裂症遗传调控研究中获进展】
精神分裂症是严重的、高度遗传性的精神疾病。目前，全基因组范围内的关联研究（GWAS）已报道了200多个与精神分裂症显著相关的风险基因座，而这些基因座内的风险变异如何影响疾病发生知之甚少。为了鉴别风险基因座内的功能变异，中国科学院昆明动物研究所研究员罗雄剑团队前期利用功能基因组学（Functional genomics）方法，鉴别到132个打断与转录因子结合的风险遗传变异（Nature Communications，2019）。前期功能基因组学研究表明，位于22q13.2区域的错义遗传变异（missense）rs1801311影响了与转录因子POLR2A、TAF1（TATA Box binding Protein Associated Factor 1）和YY1 （Yin-Yang1）的结合，提示rs1801311或是潜在的致病遗传变异。
为了进一步阐明rs1801311在精神分裂症中的作用和机制，罗雄剑团队对rs1801311的调控机制开展了系统研究。系列功能实验（包括报告基因实验、转录因子敲低，ChIP-qPCR、CRISPR-Cas9介导的基因组编辑等）表明，rs1801311是具有调控功能的风险变异。表达数量性状基因座（eQTL）分析表明，rs1801311在人类大脑中与NAGA表达的相关性最显著。染色质长程相互作用数据表明rs1801311与NAGA有染色质相互作用，提示rs1801311可能通过长程调控NAGA表达介导精神分裂症风险。进一步研究发现，rs1801311的风险等位基因（G）通过减少YY1结合影响NAGA表达。
研究表明，精神分裂症可能是由于神经发育异常导致。因此，罗雄剑团队深入探究了NAGA在神经发育中的潜在作用，发现其调节神经干细胞增殖和分化。转录组测序结果表明，NAGA调控与神经发育和分化相关的通路，提示NAGA可能通过影响神经发育介导疾病风险。此外，罗雄剑团队在中国人群样本中（N=12138）独立证实了rs1801311与精神分裂症间的关联性。该研究利用大规模遗传关联分析、功能基因组学、表观基因组学、报告基因、基因组编辑以及神经干细胞增殖分化等系列实验，表明了错义变异rs1801311可能通过调控远端基因NAGA介导精神分裂症风险。研究揭示了错义遗传变异的调控功能（即其可能通过调控远端基因表达，而非通常所认为的错义遗传变异，主要影响其所在蛋白的结构或功能）及潜在的调控机制，为疾病机制研究提供了新视角。
相关研究成果以A missense variant in NDUFA6 confers schizophrenia risk by affecting YY1 binding and NAGA expression为题，发表在Molecular Psychiatry上。昆明动物所博士研究生李一凡为论文第一作者，罗雄剑为论文通讯作者。研究工作得到国家自然科学基金、云南省科技厅创新研究团队及云南省杰出青年项目的资助。
论文链接：https://t.cn/A6V2sMpg
（来源：中科院昆明动物所）
精神分裂症是严重的、高度遗传性的精神疾病。目前，全基因组范围内的关联研究（GWAS）已报道了200多个与精神分裂症显著相关的风险基因座，而这些基因座内的风险变异如何影响疾病发生知之甚少。为了鉴别风险基因座内的功能变异，中国科学院昆明动物研究所研究员罗雄剑团队前期利用功能基因组学（Functional genomics）方法，鉴别到132个打断与转录因子结合的风险遗传变异（Nature Communications，2019）。前期功能基因组学研究表明，位于22q13.2区域的错义遗传变异（missense）rs1801311影响了与转录因子POLR2A、TAF1（TATA Box binding Protein Associated Factor 1）和YY1 （Yin-Yang1）的结合，提示rs1801311或是潜在的致病遗传变异。
为了进一步阐明rs1801311在精神分裂症中的作用和机制，罗雄剑团队对rs1801311的调控机制开展了系统研究。系列功能实验（包括报告基因实验、转录因子敲低，ChIP-qPCR、CRISPR-Cas9介导的基因组编辑等）表明，rs1801311是具有调控功能的风险变异。表达数量性状基因座（eQTL）分析表明，rs1801311在人类大脑中与NAGA表达的相关性最显著。染色质长程相互作用数据表明rs1801311与NAGA有染色质相互作用，提示rs1801311可能通过长程调控NAGA表达介导精神分裂症风险。进一步研究发现，rs1801311的风险等位基因（G）通过减少YY1结合影响NAGA表达。
研究表明，精神分裂症可能是由于神经发育异常导致。因此，罗雄剑团队深入探究了NAGA在神经发育中的潜在作用，发现其调节神经干细胞增殖和分化。转录组测序结果表明，NAGA调控与神经发育和分化相关的通路，提示NAGA可能通过影响神经发育介导疾病风险。此外，罗雄剑团队在中国人群样本中（N=12138）独立证实了rs1801311与精神分裂症间的关联性。该研究利用大规模遗传关联分析、功能基因组学、表观基因组学、报告基因、基因组编辑以及神经干细胞增殖分化等系列实验，表明了错义变异rs1801311可能通过调控远端基因NAGA介导精神分裂症风险。研究揭示了错义遗传变异的调控功能（即其可能通过调控远端基因表达，而非通常所认为的错义遗传变异，主要影响其所在蛋白的结构或功能）及潜在的调控机制，为疾病机制研究提供了新视角。
相关研究成果以A missense variant in NDUFA6 confers schizophrenia risk by affecting YY1 binding and NAGA expression为题，发表在Molecular Psychiatry上。昆明动物所博士研究生李一凡为论文第一作者，罗雄剑为论文通讯作者。研究工作得到国家自然科学基金、云南省科技厅创新研究团队及云南省杰出青年项目的资助。
论文链接：https://t.cn/A6V2sMpg
（来源：中科院昆明动物所）
今日听Mentor的Application Enginnner的产品介绍时，自己一个想法：
chip verification中，现有的emulation与simulation是脱耦部署的两个分立环境，internnected verification由于driver一侧存在太多clocking block以及large memory load的需求，使得emulation加速比往往并不如工程师所期望，但single processor verification是个极佳的加速应用场景。值得注意的是，在co-simulation的整个工具链中，无论是采用非解释型的语言、代码风格调优、解释器优化，以及定制化的双端通信协议，本质上都是为了满足高效地喂饱emulator的需求。有趣的是，工具厂商提供了一个定制化的api，可以在允许的时间粒度内控制双端通信频率，并且设置的参数支持在运行时被动态捕获，simulation-emulation通信频率直接决定了由于emulation端被阻塞产生的时间成本，通信频率过高会导致加速比下降，通信频率过低会导致喂不饱emulator，加速比也会下降。此api提供了给了验证工程师的一个机会，使得其能够通过自适应地调整通信频率以适应不同指令流用例场景，以提升emulation效率。
chip verification中，现有的emulation与simulation是脱耦部署的两个分立环境，internnected verification由于driver一侧存在太多clocking block以及large memory load的需求，使得emulation加速比往往并不如工程师所期望，但single processor verification是个极佳的加速应用场景。值得注意的是，在co-simulation的整个工具链中，无论是采用非解释型的语言、代码风格调优、解释器优化，以及定制化的双端通信协议，本质上都是为了满足高效地喂饱emulator的需求。有趣的是，工具厂商提供了一个定制化的api，可以在允许的时间粒度内控制双端通信频率，并且设置的参数支持在运行时被动态捕获，simulation-emulation通信频率直接决定了由于emulation端被阻塞产生的时间成本，通信频率过高会导致加速比下降，通信频率过低会导致喂不饱emulator，加速比也会下降。此api提供了给了验证工程师的一个机会，使得其能够通过自适应地调整通信频率以适应不同指令流用例场景，以提升emulation效率。
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而同样mini的腮红盘和果汁唇釉也不能错过哦，腮红的粉质很细腻，基本怎么刷都不会出错。两个色号可选，分别是 03Blueberry chip和07pear chip，特别好掌控，可以轻松打造元气的少女感。水水的果汁唇釉，上嘴的一刻还是被惊艳到了，嘴巴好像甜甜的樱桃软糖，超级显白。而且唇妆看起来非常清透，不显唇纹，真是毫无抵抗力啊。
图源：sugarose_motd hyoni_m_up LINE FRIENDS
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