10月11日资金流入较多的有甲醇、动力煤、焦煤、棉花、乙二醇等品种。
关于焦煤：作为产煤炭大省山西，连续降水和地质灾害也对当地煤炭产业带来影响。截至10月11日，根据山西省应急管理厅消息，此次汛情全省各地共转移人员54947人，停产煤矿60座、非煤矿山372座、危化企业14家，停工在建工程1035个。
部分煤矿因暴雨暂停关停，供应偏紧，焦企焦煤库存较低，节后补库意愿较强，焦煤供需格局难改，煤焦价格难以下跌。
关于动力煤：从动力煤现货来看，目前动力煤港口现货贸易商5500大卡主流价格报价已经到2000元/吨上方。动力煤2201合约贴水巨大。从现货供需来看，尽管近期国内煤炭供应有所上升，但产量增加的速度较为缓慢。需求方面，部分地区工厂限产，减少了煤炭的消耗，但尚未对电厂日耗形成实质冲击。市场对于冬季的季节性煤炭需求上升存在一定程度的忧虑，认为目前的低库存条件下，冬季的煤炭的供应可能存在一定风险，这使得港口价格继续走高。短期来看，港口动力煤价格强势很难改变。
关于燃油：在全球能源供应偏紧的当下，高硫燃料油的强势在于其作为发电燃料的经济性好于原油和低硫燃料油，需求扩张逻辑明确。此外，燃油仓单的持续注销和OPEC+无预期外的中、重质油增产也强化了燃油的强势格局。因此，只要全球能源供应依旧偏紧，燃油的强势格局就很难改变。燃油未来仍有上涨空间。
关于玻璃：国家环保督查组再次进驻沙河，能源端煤改气基本确定。供应端后期存在减产的可能，但目前没有实际落地。玻璃期货市场估值明显偏低。后期需要关注以下几个方面：1、玻璃大厂降价幅度以及市场反应程度；2、地产成交恢复程度；3、冬奥会以及能耗双控是否会影响河北、湖北、山东等核心产地。上述3项因素都是触发玻璃反转的重要因素。尤其四季度如果能够出现地产成交明显好转以及玻璃厂减产，则玻璃将迎来大幅上涨。
马来西亚BMD毛棕榈油期货周一下跌，受10月出口疲弱拖累，但马来西亚棕榈油局(MPOB)数据显示供应趋紧，帮助限制跌幅。BMD基准12月毛棕榈油合约下跌13马币或0.26%，报每吨4,953马币。独立检验公司Amspec Agri周一发布的数据显示，马来西亚10月1-10日棕榈油出口量为500,381吨，较9月同期的540,915吨减少7.5%。船运调查机构Intertek Testing Services发布的数据显示，马来西亚10月1-10日棕榈油产品出口量为528,901吨，较9月1-10日出口的572,345吨减少7.6%。马来西亚棕榈油局(MPOB)周一公布的数据显示，马来西亚9月末棕榈油库存环比减少6.99%至175万吨。9月毛棕榈油产量环比下滑0.39%至170万吨；棕榈油出口环比攀升36.83%至160万吨。Palm Oil Analytics联合创始人Satia Varqa表示，在产量持平、国内使用量和出口飙升的情况下，库存下降的速度超过预期。孟买植物油经纪商Sunvin Group研究主管Anilkumar Bagani表示，黄金周假期后中国恢复购买是目前棕榈油市场的主要催化剂。棕榈油受其他相关植物油价格走势影响，因他们在全球植物油市场竞争份额。
豆油咨询：龙口香驰10月11日一级豆油现货10550元/吨，目前企业仍间歇停机。厂家有一条大豆压榨生产线，一条精炼生产线，日压榨大豆5000吨，日精炼豆油1000吨。
10月11日，青岛渤海厂家两条压榨线，日压榨量11000吨。油厂报价：一级豆油10550元/吨，脱胶10450元/吨，限量成交。
10月11日，日照凌云海2条大豆压榨生产线，日压榨大豆产能4000吨。油厂报价：一级豆油01+760元/吨。
10月11日，博兴香驰油厂日压榨大豆产能2000吨。油厂报价：一级豆油一口价现货10530元/吨。
10月11日，路易达孚（天津）工厂日压榨大豆产能4000吨，精炼1200吨，罐容12万吨，一级罐容2万吨。油厂报价：5-7月提货Y2205+480元/吨。
截至2021年10月8日（第40周），全国重点地区豆油商业库存约93.05万吨，较38周增加3.65万吨，增幅4.08%。
根据美国农业部最新数据，美豆库存处于2013-2014年以来的偏低位置是不争的事实，短期预估数据可能与市场预期有所偏差，但整体紧张的库存水平为豆油乃至整体油脂市场奠定了上升基础，并且也造就了豆油脉冲式变化的走势特征。目前，美豆天气因素窗口已过，收割进度保持正常，巴西大豆种植进度备受关注。目前超高的大豆进口成本给予豆油价格一定的支撑。受国内生猪养殖、限电因素等影响，国内豆油和豆粕走势形成强弱对比，油粕比大幅提升。从宏观层面看，整个大宗商品的上涨对于豆油的刺激是存在的，这就容易形成豆油现货本身刺激利多因素有限，而外界因素作用更强的情况，并且从现货波动角度也容易构成反复、脉冲式振荡走势。国内豆油短期消费处于活跃态势，在饲料需求不振的情况下，油脂加工开工率受限，豆油无论从供应还是成本角度对于价格支撑作用仍存，但支撑的增量因素略显不足。由于明年春节偏早，元旦和春节旺季容易形成共振，豆油提前备货，行情持续强势有可能比预期还要提前，现货容易形成强预期，并且与期货升水拉大的可能。当前现货需求偏强支撑豆油价格走势，整体油脂市场上涨预期仍不变。
豆粕咨询：2021年第40周，全国主要油厂大豆库存及豆粕库存均下降，未执行合同增加。
开机情况：第39周（9月25日至10月1日）全国主要油厂大豆实际压榨量为159.12万吨，开机率为56.13%；第40周（10月2日至10月8日）全国主要油厂大豆实际压榨量为140.67万吨，开机率为49.62%。
2021年第39-40周（9月25日-10月8日）国内主要地区的油厂大豆到港约39.5船，(本次船重按6.5万吨计）约256.75万吨大豆。其中华东16.5船，山东及河南8船，华北6.5船，东北1.5船，广西4船，广东2.5船，福建0.5船。
10月11日全国主要油厂豆粕成交9.02万吨，较上一交易日增加8.13万吨，其中现货成交5.22万吨，远月基差成交3.8万吨。开机方面，全国开机率较前一交易日下降至53.14%，主要是山东，华北，广东，广西地区开机有所下滑。
农业咨询机构AgRural周一发布报告称，截至10月7日，巴西2021/22年度大豆播种进度已达到10%，较之前一周提高六个百分点，2020/21年度同期的大豆播种率仅为3%。AgRural表示，该国大部分地区，以及马托格罗索州和帕拉纳州等粮食主产区的降雨提振了播种，令播种进度取得进展。AgRural在声明中称：“上周巴西大部分地区有降雨，有利于地区耕作，播种取得进展，也允许在生产者等待较好湿度条件的地区开始播种。”农户曾在2020/21年度遭遇严重干旱，推迟大豆播种。该咨询机构称，降雨过多伤及巴西南部播种工作。
美国农业部（USDA）9月30日发布的季度库存报告有些出人意料，报告显示大豆库存高于市场预期。美国农业部10月作物供需报告将于北京时间周三零点公布。首先，主要关注的内容将是单产以及结转库存。当一切尘埃落定时，结转库存便成为影响价格的重要因素。不过，大家都对平均单产如何十分感兴趣。鉴于这是收割以来的第二份供需报告，也就显得尤为重要。预计大豆单产将被上调。之前少数大豆生产商对他们的大豆单产情况感到失望。实际上，许多豆农都报告称单产创纪录，所以实际上大豆的单产情况要比玉米好得多。贸易商对于大豆单产的预估区间为每英亩50.5-51.5蒲式耳，这一预估区间较为狭窄。对单产的最高预估为每英亩51.5蒲式耳，还有人估计大豆单产后续还将继续被上调。美国农业部9月对美国2021/22年度大豆年末库存预估为1.85亿蒲式耳，预计本月估值将被上调。鉴于出口和销售量不及去年同期，因此很难假设需求将好于9月预估。预计年末库存将为3.64亿蒲式耳，接近1.61-3.73亿蒲式耳预估区间的顶端。鉴于过去几周价格走势震荡，因此任何异常数据都值得留意。如果单产调整幅度大于预期，那么对市场的影响将得到凸显。生产者希望谷物价格能够突破阻力，但也应注意避免受到价格下跌影响。
美湾运转进度提高，驳船运费回到飓风袭击前水平，新奥尔良港目前的装船能力足以加速对驳船的卸船。本年度迄今累计出口销售量同比锐减1520万吨（5.58亿蒲)。业界焦急等待中国再次进入美豆市场，提振正在放缓的出口销售进度。在目前装船和出口销售进度滞后的情况下，若未来30天持续该情况，未来将难以追赶。
由于东部玉米带本周大部分时间降雨减缓了收割，驳船运费因现货需求减少而下降。西部玉米带到周六都保持干燥，但本周更多的农民已经从收割大豆转为收获玉米。美豆装载量正在加快，因为所有美湾升降机都在运行。
国庆节前豆粕库存连续四周下滑，整体水平不高，市场预计节后受限电政策影响油厂开机率继续下降，豆粕库存可能延续下滑。在未来的一段时间内，美豆新作单产逐渐确认后，产量题材即将落下帷幕，需求端将成为市场交易重点；南美新季生长期炒作也将成为市场交易重点之一。国内市场将围绕成本，买货进度以及终端需求展开，节奏上仍将会跟随美豆波动。新作的单产将会是市场接下来的重点关注因素。市场消息称中国依然在采购巴西11月船期大豆，供给增加以及出口担忧继续施压美豆，国内豆粕跟随美豆表现偏弱。后期看市场目前普遍预期美豆新作结转库存在2.5-3亿蒲，这个水平对应美豆价格在1150-1250区间波动，但是宏观上中美贸易协定执行有不确定性会使得市场波动不确定性增加。国内豆粕后期不确定因素较多，既要受美豆、贴水的影响还要受油脂波动以及宏观中美贸易协定的影响。
关于焦煤：作为产煤炭大省山西，连续降水和地质灾害也对当地煤炭产业带来影响。截至10月11日，根据山西省应急管理厅消息，此次汛情全省各地共转移人员54947人，停产煤矿60座、非煤矿山372座、危化企业14家，停工在建工程1035个。
部分煤矿因暴雨暂停关停，供应偏紧，焦企焦煤库存较低，节后补库意愿较强，焦煤供需格局难改，煤焦价格难以下跌。
关于动力煤：从动力煤现货来看，目前动力煤港口现货贸易商5500大卡主流价格报价已经到2000元/吨上方。动力煤2201合约贴水巨大。从现货供需来看，尽管近期国内煤炭供应有所上升，但产量增加的速度较为缓慢。需求方面，部分地区工厂限产，减少了煤炭的消耗，但尚未对电厂日耗形成实质冲击。市场对于冬季的季节性煤炭需求上升存在一定程度的忧虑，认为目前的低库存条件下，冬季的煤炭的供应可能存在一定风险，这使得港口价格继续走高。短期来看，港口动力煤价格强势很难改变。
关于燃油：在全球能源供应偏紧的当下，高硫燃料油的强势在于其作为发电燃料的经济性好于原油和低硫燃料油，需求扩张逻辑明确。此外，燃油仓单的持续注销和OPEC+无预期外的中、重质油增产也强化了燃油的强势格局。因此，只要全球能源供应依旧偏紧，燃油的强势格局就很难改变。燃油未来仍有上涨空间。
关于玻璃：国家环保督查组再次进驻沙河，能源端煤改气基本确定。供应端后期存在减产的可能，但目前没有实际落地。玻璃期货市场估值明显偏低。后期需要关注以下几个方面：1、玻璃大厂降价幅度以及市场反应程度；2、地产成交恢复程度；3、冬奥会以及能耗双控是否会影响河北、湖北、山东等核心产地。上述3项因素都是触发玻璃反转的重要因素。尤其四季度如果能够出现地产成交明显好转以及玻璃厂减产，则玻璃将迎来大幅上涨。
马来西亚BMD毛棕榈油期货周一下跌，受10月出口疲弱拖累，但马来西亚棕榈油局(MPOB)数据显示供应趋紧，帮助限制跌幅。BMD基准12月毛棕榈油合约下跌13马币或0.26%，报每吨4,953马币。独立检验公司Amspec Agri周一发布的数据显示，马来西亚10月1-10日棕榈油出口量为500,381吨，较9月同期的540,915吨减少7.5%。船运调查机构Intertek Testing Services发布的数据显示，马来西亚10月1-10日棕榈油产品出口量为528,901吨，较9月1-10日出口的572,345吨减少7.6%。马来西亚棕榈油局(MPOB)周一公布的数据显示，马来西亚9月末棕榈油库存环比减少6.99%至175万吨。9月毛棕榈油产量环比下滑0.39%至170万吨；棕榈油出口环比攀升36.83%至160万吨。Palm Oil Analytics联合创始人Satia Varqa表示，在产量持平、国内使用量和出口飙升的情况下，库存下降的速度超过预期。孟买植物油经纪商Sunvin Group研究主管Anilkumar Bagani表示，黄金周假期后中国恢复购买是目前棕榈油市场的主要催化剂。棕榈油受其他相关植物油价格走势影响，因他们在全球植物油市场竞争份额。
豆油咨询：龙口香驰10月11日一级豆油现货10550元/吨，目前企业仍间歇停机。厂家有一条大豆压榨生产线，一条精炼生产线，日压榨大豆5000吨，日精炼豆油1000吨。
10月11日，青岛渤海厂家两条压榨线，日压榨量11000吨。油厂报价：一级豆油10550元/吨，脱胶10450元/吨，限量成交。
10月11日，日照凌云海2条大豆压榨生产线，日压榨大豆产能4000吨。油厂报价：一级豆油01+760元/吨。
10月11日，博兴香驰油厂日压榨大豆产能2000吨。油厂报价：一级豆油一口价现货10530元/吨。
10月11日，路易达孚（天津）工厂日压榨大豆产能4000吨，精炼1200吨，罐容12万吨，一级罐容2万吨。油厂报价：5-7月提货Y2205+480元/吨。
截至2021年10月8日（第40周），全国重点地区豆油商业库存约93.05万吨，较38周增加3.65万吨，增幅4.08%。
根据美国农业部最新数据，美豆库存处于2013-2014年以来的偏低位置是不争的事实，短期预估数据可能与市场预期有所偏差，但整体紧张的库存水平为豆油乃至整体油脂市场奠定了上升基础，并且也造就了豆油脉冲式变化的走势特征。目前，美豆天气因素窗口已过，收割进度保持正常，巴西大豆种植进度备受关注。目前超高的大豆进口成本给予豆油价格一定的支撑。受国内生猪养殖、限电因素等影响，国内豆油和豆粕走势形成强弱对比，油粕比大幅提升。从宏观层面看，整个大宗商品的上涨对于豆油的刺激是存在的，这就容易形成豆油现货本身刺激利多因素有限，而外界因素作用更强的情况，并且从现货波动角度也容易构成反复、脉冲式振荡走势。国内豆油短期消费处于活跃态势，在饲料需求不振的情况下，油脂加工开工率受限，豆油无论从供应还是成本角度对于价格支撑作用仍存，但支撑的增量因素略显不足。由于明年春节偏早，元旦和春节旺季容易形成共振，豆油提前备货，行情持续强势有可能比预期还要提前，现货容易形成强预期，并且与期货升水拉大的可能。当前现货需求偏强支撑豆油价格走势，整体油脂市场上涨预期仍不变。
豆粕咨询：2021年第40周，全国主要油厂大豆库存及豆粕库存均下降，未执行合同增加。
开机情况：第39周（9月25日至10月1日）全国主要油厂大豆实际压榨量为159.12万吨，开机率为56.13%；第40周（10月2日至10月8日）全国主要油厂大豆实际压榨量为140.67万吨，开机率为49.62%。
2021年第39-40周（9月25日-10月8日）国内主要地区的油厂大豆到港约39.5船，(本次船重按6.5万吨计）约256.75万吨大豆。其中华东16.5船，山东及河南8船，华北6.5船，东北1.5船，广西4船，广东2.5船，福建0.5船。
10月11日全国主要油厂豆粕成交9.02万吨，较上一交易日增加8.13万吨，其中现货成交5.22万吨，远月基差成交3.8万吨。开机方面，全国开机率较前一交易日下降至53.14%，主要是山东，华北，广东，广西地区开机有所下滑。
农业咨询机构AgRural周一发布报告称，截至10月7日，巴西2021/22年度大豆播种进度已达到10%，较之前一周提高六个百分点，2020/21年度同期的大豆播种率仅为3%。AgRural表示，该国大部分地区，以及马托格罗索州和帕拉纳州等粮食主产区的降雨提振了播种，令播种进度取得进展。AgRural在声明中称：“上周巴西大部分地区有降雨，有利于地区耕作，播种取得进展，也允许在生产者等待较好湿度条件的地区开始播种。”农户曾在2020/21年度遭遇严重干旱，推迟大豆播种。该咨询机构称，降雨过多伤及巴西南部播种工作。
美国农业部（USDA）9月30日发布的季度库存报告有些出人意料，报告显示大豆库存高于市场预期。美国农业部10月作物供需报告将于北京时间周三零点公布。首先，主要关注的内容将是单产以及结转库存。当一切尘埃落定时，结转库存便成为影响价格的重要因素。不过，大家都对平均单产如何十分感兴趣。鉴于这是收割以来的第二份供需报告，也就显得尤为重要。预计大豆单产将被上调。之前少数大豆生产商对他们的大豆单产情况感到失望。实际上，许多豆农都报告称单产创纪录，所以实际上大豆的单产情况要比玉米好得多。贸易商对于大豆单产的预估区间为每英亩50.5-51.5蒲式耳，这一预估区间较为狭窄。对单产的最高预估为每英亩51.5蒲式耳，还有人估计大豆单产后续还将继续被上调。美国农业部9月对美国2021/22年度大豆年末库存预估为1.85亿蒲式耳，预计本月估值将被上调。鉴于出口和销售量不及去年同期，因此很难假设需求将好于9月预估。预计年末库存将为3.64亿蒲式耳，接近1.61-3.73亿蒲式耳预估区间的顶端。鉴于过去几周价格走势震荡，因此任何异常数据都值得留意。如果单产调整幅度大于预期，那么对市场的影响将得到凸显。生产者希望谷物价格能够突破阻力，但也应注意避免受到价格下跌影响。
美湾运转进度提高，驳船运费回到飓风袭击前水平，新奥尔良港目前的装船能力足以加速对驳船的卸船。本年度迄今累计出口销售量同比锐减1520万吨（5.58亿蒲)。业界焦急等待中国再次进入美豆市场，提振正在放缓的出口销售进度。在目前装船和出口销售进度滞后的情况下，若未来30天持续该情况，未来将难以追赶。
由于东部玉米带本周大部分时间降雨减缓了收割，驳船运费因现货需求减少而下降。西部玉米带到周六都保持干燥，但本周更多的农民已经从收割大豆转为收获玉米。美豆装载量正在加快，因为所有美湾升降机都在运行。
国庆节前豆粕库存连续四周下滑，整体水平不高，市场预计节后受限电政策影响油厂开机率继续下降，豆粕库存可能延续下滑。在未来的一段时间内，美豆新作单产逐渐确认后，产量题材即将落下帷幕，需求端将成为市场交易重点；南美新季生长期炒作也将成为市场交易重点之一。国内市场将围绕成本，买货进度以及终端需求展开，节奏上仍将会跟随美豆波动。新作的单产将会是市场接下来的重点关注因素。市场消息称中国依然在采购巴西11月船期大豆，供给增加以及出口担忧继续施压美豆，国内豆粕跟随美豆表现偏弱。后期看市场目前普遍预期美豆新作结转库存在2.5-3亿蒲，这个水平对应美豆价格在1150-1250区间波动，但是宏观上中美贸易协定执行有不确定性会使得市场波动不确定性增加。国内豆粕后期不确定因素较多，既要受美豆、贴水的影响还要受油脂波动以及宏观中美贸易协定的影响。
【科学家破译黄麻2个栽培种全基因组：“金色纤维”如何炼成】作为世界上最重要的长纤维作物之一，黄麻在全世界的产量和种植面积仅次于棉花，享有“金色纤维”之称，在麻纺工业中发挥了重要作用。中国是世界上最古老的黄麻生产国和起源地之一。
6月25日，福建农林大学麻类研究室联合该校基因组与生物技术中心在《植物生物技术杂志》（Plant Biotechnology Journal）率先发表了染色体级别的黄麻参考基因组图谱https://t.cn/A6f6MlIm。他们在此基础上解析了黄麻纤维品质的关键遗传位点，为黄麻的功能基因验证和分子设计育种奠定了基础。
▲ 率先公布染色体水平的黄麻基因组
黄麻，又称络麻、绿麻，一年生草本韧皮纤维作物。黄麻属有100多个种，其中具有栽培价值的有两个种，即圆果种黄麻和长果种黄麻，主要分布于热带及亚热带地区，我国、印度和孟加拉国都是黄麻的主要产地。在我国，黄麻最早记载于公元1061年的《图经本草》，其种植历史已有近千年。
根据联合国粮农组织的数据，目前全球黄麻纤维年产量为3422876吨，产值23亿美元。论文通讯作者、福建农林大学教授张立武说，黄麻具有纤维产量高、纤维质地柔软的特点。作为麻纺工业的重要原料，我国生产的黄麻纤维主要用于纺织麻袋、麻布、麻绳等包装用品。
近年来，由于黄麻纺织技术取得较大进展，黄麻纤维已能纯纺或混纺成高档布料，或可纺织成贴墙布、桌布、窗帘布等装饰布料。除了利用麻纤维，黄麻多功能用途还拓展到菜用、盐碱地修复用、茶用、重金属吸附用等。黄麻纤维细胞呈五角形或六角形，中空结构，具有良好的吸湿性和透气性。作为天然的植物纤维材料，黄麻可抑菌、可降解、抗静电、易染色，具有广阔的推广前景。
论文第一作者、福建农林大学博士研究生张力岚介绍，他们分别以圆果种黄麻优良品种“黄麻179”和长果种黄麻优良品种“宽叶长果”为材料，采用二代、三代测序策略，同时结合Hi-C染色体构象捕获技术，首次完成了黄麻染色体水平全基因组测序和组装工作。
该研究获得的圆果种黄麻和长果种黄麻的基因组大小分别约为336 Mbp和361 Mbp，contig N50分别为46 Mb和50 Mb，分别鉴定到25874个和28479个蛋白编码基因。
由于黄麻和雷蒙德氏棉都属于锦葵科，且均为二倍体的纤维作物，他们还比较了两个物种的形成时间。结果发现，黄麻属和雷蒙德氏棉之间的物种分化发生在3800万年前。
虽然圆果种黄麻和长果种黄麻表现出良好的共线性，但长果种黄麻基因组比圆果种多出25 Mbp，包含13个假定的倒位。张力岚告诉《中国科学报》，染色体倒位是染色体畸变的一种类型，推测这13个倒位可能是造成两种黄麻表型差异的重要原因。
▲ 黄麻的起源与驯化
为了从基因组水平剖析黄麻起源与驯化，他们对来自世界各地的242份圆果种黄麻、57份长果种黄麻和1份近缘种假黄麻，共300份不同的黄麻属材料进行了重测序。结果发现了黄麻驯化史上的一次种群瓶颈事件。
种群瓶颈又称“种群瓶颈效应”或“人口瓶颈”，是指某个种群的数量在演化过程中由于死亡或不能生育造成减少50%以上或者数量级减少的事件。
论文第一作者、福建农林大学马晓开博士说，种群瓶颈发生后，可能造成种群的灭绝，或种群恢复但仅存有限的遗传多样性。历史上种群规模的变化研究，可以通过黄麻基因组测序数据，利用经典遗传算法，开展种群历史有效群体大小的分析。黄麻在20000年前开始出现瓶颈事件。种群规模持续下降，说明此时黄麻种群受到了较大的自然选择或人工选择。
论文作者伊利诺伊大学香槟校区Ray Ming教授说，在末次盛冰期（Last Glacial Maximum, LGM）时，圆果种黄麻仅存在于亚洲南部，而长果种黄麻存在于非洲东部和亚洲南部。随着时间的推移，非洲的黄麻分布越来越少，而亚洲则越来越多。为证明长果种黄麻为起源于非洲东部并在亚洲东部经历第二次驯化的提供了依据。
论文第一作者、福建农林大学博士研究生徐益解释说，黄麻是一年生短日照作物，喜温暖湿润的气候。随着非洲气温升高和干旱加剧，而亚洲温度适宜、雨量充沛，非洲黄麻资源日趋匮乏，亚洲转而成为黄麻的主要生产国。“黄麻的分布情况受到亚非两地气候变化、人类文化交流以及人工选择的影响。”
▲ 黄麻纤维品质重要遗传位点的挖掘
“因为黄麻是韧皮部纤维作物，其最重要的经济产物就是韧皮纤维，所以我们期望挖掘与韧皮部纤维形成相关的重要基因，可为黄麻纤维改良提供理论基础和基因资源。”张立武说。
他们利用转录组测序技术，挖掘了黄麻韧皮部纤维形成相关基因，包括木质素和纤维素的合成途径参与调控的基因，以及影响纤维起始伸长的调控基因，并绘制了这些基因的表达谱。
全基因组关联分析GWAS分析，他们确定了数百个控制纤维细度、纤维素含量和木质素含量的纤维品质性状的重要位点。结合选择性清除分析发现，纤维细度QTL的微丝酶家族蛋白CcSFP1、蛋白质精氨酸甲基转移酶CcPRMT7等候选基因位于选择性清除区域，推测这些基因受到了驯化选择。利用竞争性等位基因特异性PCR（KASP）和转基因技术验证了控制黄麻纤维品质的候选基因CcCOBRA1和CcC4H1的功能。
COBRA基因能控制纤维素微纤丝在细胞壁中的正确位置和植物细胞的定向伸长。在水稻中，COBRA基因的突变会导致细胞壁厚度和纤维素含量降低，具有调控水稻茎秆机械强度的功能，被称为“脆杆基因”。在黄麻中，他们发现CcCOBRA1的表达水平随着纤维发育而增加，表明该基因是控制黄麻纤维品质、影响纤维积累的一个重要位点。C4H基因介导肉桂酸转化为对香豆酸，是调控植物木质素合成最重要的基因之一，其转录丰度可直接影响植物中黄酮类化合物和芳香族化合物的生物合成量。这些基因的挖掘，为黄麻纤维品质的遗传改良提供了基因资源。
中国农业科学院麻类研究所研究员粟建光说，该研究成果率先完成了黄麻染色体精确测序及基因结构分析，开展了基于全基因组测序分析的黄麻复杂性状全基因组关联分析，解析了黄麻纤维品质的关键遗传位点，系统鉴定了黄麻全基因组驯化选择位点，证明了长果种黄麻为起源于非洲东部并在亚洲东部经历第二次驯化，解开了黄麻驯化和起源之谜，为黄麻的功能基因验证和分子设计育种提供手段。
据了解，在全世界范围内首次破译黄麻2个栽培种的全基因组，标志着我国在麻类作物基因组与分子育种研究方面处于国际领先水平。https://t.cn/A6f6MlIu
6月25日，福建农林大学麻类研究室联合该校基因组与生物技术中心在《植物生物技术杂志》（Plant Biotechnology Journal）率先发表了染色体级别的黄麻参考基因组图谱https://t.cn/A6f6MlIm。他们在此基础上解析了黄麻纤维品质的关键遗传位点，为黄麻的功能基因验证和分子设计育种奠定了基础。
▲ 率先公布染色体水平的黄麻基因组
黄麻，又称络麻、绿麻，一年生草本韧皮纤维作物。黄麻属有100多个种，其中具有栽培价值的有两个种，即圆果种黄麻和长果种黄麻，主要分布于热带及亚热带地区，我国、印度和孟加拉国都是黄麻的主要产地。在我国，黄麻最早记载于公元1061年的《图经本草》，其种植历史已有近千年。
根据联合国粮农组织的数据，目前全球黄麻纤维年产量为3422876吨，产值23亿美元。论文通讯作者、福建农林大学教授张立武说，黄麻具有纤维产量高、纤维质地柔软的特点。作为麻纺工业的重要原料，我国生产的黄麻纤维主要用于纺织麻袋、麻布、麻绳等包装用品。
近年来，由于黄麻纺织技术取得较大进展，黄麻纤维已能纯纺或混纺成高档布料，或可纺织成贴墙布、桌布、窗帘布等装饰布料。除了利用麻纤维，黄麻多功能用途还拓展到菜用、盐碱地修复用、茶用、重金属吸附用等。黄麻纤维细胞呈五角形或六角形，中空结构，具有良好的吸湿性和透气性。作为天然的植物纤维材料，黄麻可抑菌、可降解、抗静电、易染色，具有广阔的推广前景。
论文第一作者、福建农林大学博士研究生张力岚介绍，他们分别以圆果种黄麻优良品种“黄麻179”和长果种黄麻优良品种“宽叶长果”为材料，采用二代、三代测序策略，同时结合Hi-C染色体构象捕获技术，首次完成了黄麻染色体水平全基因组测序和组装工作。
该研究获得的圆果种黄麻和长果种黄麻的基因组大小分别约为336 Mbp和361 Mbp，contig N50分别为46 Mb和50 Mb，分别鉴定到25874个和28479个蛋白编码基因。
由于黄麻和雷蒙德氏棉都属于锦葵科，且均为二倍体的纤维作物，他们还比较了两个物种的形成时间。结果发现，黄麻属和雷蒙德氏棉之间的物种分化发生在3800万年前。
虽然圆果种黄麻和长果种黄麻表现出良好的共线性，但长果种黄麻基因组比圆果种多出25 Mbp，包含13个假定的倒位。张力岚告诉《中国科学报》，染色体倒位是染色体畸变的一种类型，推测这13个倒位可能是造成两种黄麻表型差异的重要原因。
▲ 黄麻的起源与驯化
为了从基因组水平剖析黄麻起源与驯化，他们对来自世界各地的242份圆果种黄麻、57份长果种黄麻和1份近缘种假黄麻，共300份不同的黄麻属材料进行了重测序。结果发现了黄麻驯化史上的一次种群瓶颈事件。
种群瓶颈又称“种群瓶颈效应”或“人口瓶颈”，是指某个种群的数量在演化过程中由于死亡或不能生育造成减少50%以上或者数量级减少的事件。
论文第一作者、福建农林大学马晓开博士说，种群瓶颈发生后，可能造成种群的灭绝，或种群恢复但仅存有限的遗传多样性。历史上种群规模的变化研究，可以通过黄麻基因组测序数据，利用经典遗传算法，开展种群历史有效群体大小的分析。黄麻在20000年前开始出现瓶颈事件。种群规模持续下降，说明此时黄麻种群受到了较大的自然选择或人工选择。
论文作者伊利诺伊大学香槟校区Ray Ming教授说，在末次盛冰期（Last Glacial Maximum, LGM）时，圆果种黄麻仅存在于亚洲南部，而长果种黄麻存在于非洲东部和亚洲南部。随着时间的推移，非洲的黄麻分布越来越少，而亚洲则越来越多。为证明长果种黄麻为起源于非洲东部并在亚洲东部经历第二次驯化的提供了依据。
论文第一作者、福建农林大学博士研究生徐益解释说，黄麻是一年生短日照作物，喜温暖湿润的气候。随着非洲气温升高和干旱加剧，而亚洲温度适宜、雨量充沛，非洲黄麻资源日趋匮乏，亚洲转而成为黄麻的主要生产国。“黄麻的分布情况受到亚非两地气候变化、人类文化交流以及人工选择的影响。”
▲ 黄麻纤维品质重要遗传位点的挖掘
“因为黄麻是韧皮部纤维作物，其最重要的经济产物就是韧皮纤维，所以我们期望挖掘与韧皮部纤维形成相关的重要基因，可为黄麻纤维改良提供理论基础和基因资源。”张立武说。
他们利用转录组测序技术，挖掘了黄麻韧皮部纤维形成相关基因，包括木质素和纤维素的合成途径参与调控的基因，以及影响纤维起始伸长的调控基因，并绘制了这些基因的表达谱。
全基因组关联分析GWAS分析，他们确定了数百个控制纤维细度、纤维素含量和木质素含量的纤维品质性状的重要位点。结合选择性清除分析发现，纤维细度QTL的微丝酶家族蛋白CcSFP1、蛋白质精氨酸甲基转移酶CcPRMT7等候选基因位于选择性清除区域，推测这些基因受到了驯化选择。利用竞争性等位基因特异性PCR（KASP）和转基因技术验证了控制黄麻纤维品质的候选基因CcCOBRA1和CcC4H1的功能。
COBRA基因能控制纤维素微纤丝在细胞壁中的正确位置和植物细胞的定向伸长。在水稻中，COBRA基因的突变会导致细胞壁厚度和纤维素含量降低，具有调控水稻茎秆机械强度的功能，被称为“脆杆基因”。在黄麻中，他们发现CcCOBRA1的表达水平随着纤维发育而增加，表明该基因是控制黄麻纤维品质、影响纤维积累的一个重要位点。C4H基因介导肉桂酸转化为对香豆酸，是调控植物木质素合成最重要的基因之一，其转录丰度可直接影响植物中黄酮类化合物和芳香族化合物的生物合成量。这些基因的挖掘，为黄麻纤维品质的遗传改良提供了基因资源。
中国农业科学院麻类研究所研究员粟建光说，该研究成果率先完成了黄麻染色体精确测序及基因结构分析，开展了基于全基因组测序分析的黄麻复杂性状全基因组关联分析，解析了黄麻纤维品质的关键遗传位点，系统鉴定了黄麻全基因组驯化选择位点，证明了长果种黄麻为起源于非洲东部并在亚洲东部经历第二次驯化，解开了黄麻驯化和起源之谜，为黄麻的功能基因验证和分子设计育种提供手段。
据了解，在全世界范围内首次破译黄麻2个栽培种的全基因组，标志着我国在麻类作物基因组与分子育种研究方面处于国际领先水平。https://t.cn/A6f6MlIu
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