【宁波高校教师绘制人类疾病并发症网络】
精准预判疾病并发症并做好针对性治疗方案，一直是当下临床实践中的迫切需求。日前，宁波财经学院蒋雄飞博士与宁波市第二医院郑建军教授团队以及浙江大学郑波教授团队合作在非线性物理国际知名期刊 Chaos，Solitons and Fractals发表的文章《人类并发症网络的结构与动力学》（Structure and dynamics of human complication-disease network），详细介绍了运用复杂系统和临床数据来研究生物网络的非线性动力学行为，对疾病并发症进行量化建模。这为未来临床的疾病预防、诊断和治疗提出了新的方案。
“我们从临床医学知识数据库中收集了6715种疾病，疾病的并发症从数据库中的疾病描述中提取。一个节点表示一种疾病，节点之间将存在有向链接。”蒋雄飞介绍，据此，他们绘制了一个名为人类疾病并发症网络（HDCN）的有向图，用以代表上游疾病和其下游并发症之间的因果关系。“言简意赅地说，通过大量临床样本的分析，我们现在将各个疾病对应的并发症设置了链接关系，只要样本数据不断扩充，我们就可以从中找出并发症在不同条件下的规律和顺序，有针对性地匹配给不同患者。”
该研究团队多次对肺炎和慢性肺心病等呼吸道疾病的并发症进行了计算。他们发现，上消化道出血和多器官衰竭等看似与呼吸道没有关联的疾病，其实都是呼吸道疾病的并发症。“这些症状的原因及其关系极为复杂，因此，预测并发症对患者和医生在临床实践中至关重要。”论文的共同通讯作者之一、宁波市第二医院郑建军教授介绍，这些并发症与公众认知中的呼吸道并发症相去甚远，如果能够有效预判预警，则会对临床治疗有很大帮助。
据了解，当前该研究将分为多个阶段开展，研究者已绘制了人类疾病并发症网络并研究其拓扑特征、标记了疾病模块、进一步用布尔动力学模拟了疾病网络的动力学行为，能够详细地揭示模体在疾病系统中具有潜在功能。
郑建军介绍，下一步将进一步扩大样本规模，不断提升模型决策的精准度，“我们将对异质性节点的大型网络动力学进行全面的研究，并采用异步更新规则，还希望发展一个定量框架，从当前发现的疾病追溯到可能的原始疾病，并且让预测准确率再上新台阶”。（中国教育报-中国教育新闻网 记者 史望颖 通讯员 徐凯阳）
作者：史望颖 徐凯阳
精准预判疾病并发症并做好针对性治疗方案，一直是当下临床实践中的迫切需求。日前，宁波财经学院蒋雄飞博士与宁波市第二医院郑建军教授团队以及浙江大学郑波教授团队合作在非线性物理国际知名期刊 Chaos，Solitons and Fractals发表的文章《人类并发症网络的结构与动力学》（Structure and dynamics of human complication-disease network），详细介绍了运用复杂系统和临床数据来研究生物网络的非线性动力学行为，对疾病并发症进行量化建模。这为未来临床的疾病预防、诊断和治疗提出了新的方案。
“我们从临床医学知识数据库中收集了6715种疾病，疾病的并发症从数据库中的疾病描述中提取。一个节点表示一种疾病，节点之间将存在有向链接。”蒋雄飞介绍，据此，他们绘制了一个名为人类疾病并发症网络（HDCN）的有向图，用以代表上游疾病和其下游并发症之间的因果关系。“言简意赅地说，通过大量临床样本的分析，我们现在将各个疾病对应的并发症设置了链接关系，只要样本数据不断扩充，我们就可以从中找出并发症在不同条件下的规律和顺序，有针对性地匹配给不同患者。”
该研究团队多次对肺炎和慢性肺心病等呼吸道疾病的并发症进行了计算。他们发现，上消化道出血和多器官衰竭等看似与呼吸道没有关联的疾病，其实都是呼吸道疾病的并发症。“这些症状的原因及其关系极为复杂，因此，预测并发症对患者和医生在临床实践中至关重要。”论文的共同通讯作者之一、宁波市第二医院郑建军教授介绍，这些并发症与公众认知中的呼吸道并发症相去甚远，如果能够有效预判预警，则会对临床治疗有很大帮助。
据了解，当前该研究将分为多个阶段开展，研究者已绘制了人类疾病并发症网络并研究其拓扑特征、标记了疾病模块、进一步用布尔动力学模拟了疾病网络的动力学行为，能够详细地揭示模体在疾病系统中具有潜在功能。
郑建军介绍，下一步将进一步扩大样本规模，不断提升模型决策的精准度，“我们将对异质性节点的大型网络动力学进行全面的研究，并采用异步更新规则，还希望发展一个定量框架，从当前发现的疾病追溯到可能的原始疾病，并且让预测准确率再上新台阶”。（中国教育报-中国教育新闻网 记者 史望颖 通讯员 徐凯阳）
作者：史望颖 徐凯阳
【抑制PIM1可能是葡萄膜炎的一种新的潜在疗法】中国科学报：近日，《自然—通信》以研究论文的形式发表了中山大学中山眼科中心教授苏文如团队最新研究成果。他们在国家自然科学基金优秀青年项目的支持下，研究揭示了PIM1（一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶）可能是葡萄膜炎的重要调控因子之一，其可能成为潜在的治疗靶点。
葡萄膜炎是一种涉及睫状体、玻璃体、脉络膜和视网膜的自身免疫性眼病，是导致失明的主要原因，其特征是反复发生眼内炎症。葡萄膜炎也是一种中枢神经系统（CNS）自身免疫性疾病，由于CNS的相对免疫特权，它不同于其他器官或组织的自身免疫性疾病。目前，由于发病机制不明，葡萄膜炎的治疗仍面临挑战。
各种免疫细胞的异常是葡萄膜炎中自身免疫破坏的关键因素。其中，Th17细胞主导EAU发病机制。自身反应性Th17细胞的转移可在幼稚小鼠中诱导EAU。此外，越来越多的证据支持B细胞在EAU中的疾病促进作用。
然而，缺乏对CD4+T细胞和B细胞的调节以及与葡萄膜炎进展相关的变化的清晰描述。淋巴结（LN）对自身免疫过程至关重要。作为各种免疫细胞，特别是T细胞、B细胞和树突状细胞（DC）之间相互作用的部位，LNs促进抗原呈递、免疫细胞激活和自身免疫反应启动。颈部引流淋巴结（CDLN）是促进大分子和免疫细胞从中枢神经系统有效引流的主要淋巴结。
在该项研究工作中，研究人员在不同时间点（第0、7、14和21天）从EAU小鼠的CDLNs构建了一个全面的免疫细胞单细胞图谱，描绘了随着疾病进展免疫细胞组成和基因表达的变化。特别是，单细胞数据表明PIM1在EAU期间优先在Th17细胞、Th1细胞、Treg细胞和浆细胞（PC）中上调。抑制PIM1可减少Th17/Treg细胞和PC分化的不平衡，抑制PIM1会降低Th17的致病性。
此外，在人葡萄膜炎患者中，CD4+ T细胞和浆细胞中PIM1的同样是上调的，抑制PIM1会减少患者外周血CD4+ T 和B细胞的扩张。这些证据表明，靶向PIM1激酶可能是葡萄膜炎的一种新的潜在疗法。
“该研究发现，为进一步探索葡萄膜炎疾病的新机制提供了新的见解。同时，为葡萄膜炎的治疗提供了新的治疗靶点。”苏文如表示，深入解析葡萄膜炎的免疫动力学机制，有望为进一步阐明葡萄膜炎的发病机制和潜在的治疗靶点，以开发针对葡萄膜炎的特异性、安全和有效的治疗方案。
中山大学中山眼科中心、眼科学国家重点实验室为该论文第一单位，苏文如教授、郑颖丰教授、柳夏林教授为共同通讯作者，博士研究生李贺、硕士研究生谢利辉、朱蕾、李钊淮、王榕为共同第一作者。
葡萄膜炎是一种涉及睫状体、玻璃体、脉络膜和视网膜的自身免疫性眼病，是导致失明的主要原因，其特征是反复发生眼内炎症。葡萄膜炎也是一种中枢神经系统（CNS）自身免疫性疾病，由于CNS的相对免疫特权，它不同于其他器官或组织的自身免疫性疾病。目前，由于发病机制不明，葡萄膜炎的治疗仍面临挑战。
各种免疫细胞的异常是葡萄膜炎中自身免疫破坏的关键因素。其中，Th17细胞主导EAU发病机制。自身反应性Th17细胞的转移可在幼稚小鼠中诱导EAU。此外，越来越多的证据支持B细胞在EAU中的疾病促进作用。
然而，缺乏对CD4+T细胞和B细胞的调节以及与葡萄膜炎进展相关的变化的清晰描述。淋巴结（LN）对自身免疫过程至关重要。作为各种免疫细胞，特别是T细胞、B细胞和树突状细胞（DC）之间相互作用的部位，LNs促进抗原呈递、免疫细胞激活和自身免疫反应启动。颈部引流淋巴结（CDLN）是促进大分子和免疫细胞从中枢神经系统有效引流的主要淋巴结。
在该项研究工作中，研究人员在不同时间点（第0、7、14和21天）从EAU小鼠的CDLNs构建了一个全面的免疫细胞单细胞图谱，描绘了随着疾病进展免疫细胞组成和基因表达的变化。特别是，单细胞数据表明PIM1在EAU期间优先在Th17细胞、Th1细胞、Treg细胞和浆细胞（PC）中上调。抑制PIM1可减少Th17/Treg细胞和PC分化的不平衡，抑制PIM1会降低Th17的致病性。
此外，在人葡萄膜炎患者中，CD4+ T细胞和浆细胞中PIM1的同样是上调的，抑制PIM1会减少患者外周血CD4+ T 和B细胞的扩张。这些证据表明，靶向PIM1激酶可能是葡萄膜炎的一种新的潜在疗法。
“该研究发现，为进一步探索葡萄膜炎疾病的新机制提供了新的见解。同时，为葡萄膜炎的治疗提供了新的治疗靶点。”苏文如表示，深入解析葡萄膜炎的免疫动力学机制，有望为进一步阐明葡萄膜炎的发病机制和潜在的治疗靶点，以开发针对葡萄膜炎的特异性、安全和有效的治疗方案。
中山大学中山眼科中心、眼科学国家重点实验室为该论文第一单位，苏文如教授、郑颖丰教授、柳夏林教授为共同通讯作者，博士研究生李贺、硕士研究生谢利辉、朱蕾、李钊淮、王榕为共同第一作者。
#师大喜讯# 【我校王键吉教授团队在利用多孔材料对氨气捕集和选择性分离研究方面取得新进展[话筒]】近日，我校绿色化学研究团队王键吉教授联合华中科技大学冯光教授在国际顶尖化学学术期刊Angewandte Chemie-International Edition发表了学术论文https://t.cn/A6ocfhWX我校化学化工学院师资博士后史云磊博士为本文的第一作者，王键吉教授、冯光教授为通讯作者，河南师范大学为第一作者单位。详情请戳下图↓
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