【短短四个月基因组60%变了 实验显示果蝇惊人的演化速度】
说到生物演化,很多人印象中这是一个缓慢、渐进的过程,可能需要以成千上百年为时间尺度才能理解生物如何通过遗传变异适应环境的变化。然而,顶尖学术期刊《科学》刚刚发表的一篇论文,也许会改变你对演化时间尺度的想法。
在这项新研究中,美国宾夕法尼亚大学的研究人员通过一项巧妙设计的田间实验,追踪果蝇在自然环境条件变化过程中发生的变化,观察到了令人惊奇的适应速度:在短短四个月的实验过程中,研究人员就在果蝇基因组中超过60%的地方记录到了变异!
果蝇的寿命通常为两三个月,寿命短、繁殖快的优势正是它们成为生物科学家“实验宠儿”的重要原因。即便如此,它们的演化速度到底有多快,以前没有人直接观察到过。用这项研究的共同通讯作者、生物学教授Paul Schmidt的话说,要建立一个新的范式,直接观察动物种群如何持续地适应环境条件的快速变化,按过去对演化时间尺度的认知,是很难测出来的。
然而Schmidt教授和同事们观察果园中的果蝇时,注意到生长季节伊始出现的果蝇,与丰收季节密集出现的果蝇,在压力耐受性、生殖适应性甚至色素沉着等方面有很大不同。这一现象提示,这些动物种群随季节变化产生的适应性或许速度超出人们原来的想象。
不过要确认这一点,需要严格地控制研究条件。于是,他们在果园中搭建起实验大棚,在现实生活环境条件下(刮风下雨、寒冷、炎热等)研究果蝇。
一开始,他们往十个大棚里各投放了1000只果蝇,除了提供相同的食物外,其余任果蝇自我发展。它们在里面飞快繁殖,高峰期每个大棚里的种群数量可达10万只。
此后的每个月,研究人员从每个大棚里采集一些果蝇个体和数千枚虫卵,分析六种代表适应性的身体特征,包括繁殖成功率、发育速度、耐寒性、耐旱性等,这些特征在过去很多研究中已经知道受多个基因控制。同时,研究人员还会每个月从每个大棚里随机选择100只果蝇,通过基因组测序,高度准确地知道基因组中不同位置上等位基因频率随着时间推移发生的变化。
春去秋来,整个实验过程大约覆盖了10代果蝇。研究人员收集并分析的身体特征和基因组数据给出了清晰的证据:果蝇一直在演化,以适应不断变化的自然环境,而且演化速度比以往任何人测量的都要快。
适应幅度出乎意料的大,超过60%的基因组在发生直接或间接的变化!研究人员解释,这不是说进化选择作用在大半部分的基因组上,而是在“遗传牵连效应”(genetic draft)过程中一部分DNA发生变化“牵连”了另一部分DNA。
说到生物演化,很多人印象中这是一个缓慢、渐进的过程,可能需要以成千上百年为时间尺度才能理解生物如何通过遗传变异适应环境的变化。然而,顶尖学术期刊《科学》刚刚发表的一篇论文,也许会改变你对演化时间尺度的想法。
在这项新研究中,美国宾夕法尼亚大学的研究人员通过一项巧妙设计的田间实验,追踪果蝇在自然环境条件变化过程中发生的变化,观察到了令人惊奇的适应速度:在短短四个月的实验过程中,研究人员就在果蝇基因组中超过60%的地方记录到了变异!
果蝇的寿命通常为两三个月,寿命短、繁殖快的优势正是它们成为生物科学家“实验宠儿”的重要原因。即便如此,它们的演化速度到底有多快,以前没有人直接观察到过。用这项研究的共同通讯作者、生物学教授Paul Schmidt的话说,要建立一个新的范式,直接观察动物种群如何持续地适应环境条件的快速变化,按过去对演化时间尺度的认知,是很难测出来的。
然而Schmidt教授和同事们观察果园中的果蝇时,注意到生长季节伊始出现的果蝇,与丰收季节密集出现的果蝇,在压力耐受性、生殖适应性甚至色素沉着等方面有很大不同。这一现象提示,这些动物种群随季节变化产生的适应性或许速度超出人们原来的想象。
不过要确认这一点,需要严格地控制研究条件。于是,他们在果园中搭建起实验大棚,在现实生活环境条件下(刮风下雨、寒冷、炎热等)研究果蝇。
一开始,他们往十个大棚里各投放了1000只果蝇,除了提供相同的食物外,其余任果蝇自我发展。它们在里面飞快繁殖,高峰期每个大棚里的种群数量可达10万只。
此后的每个月,研究人员从每个大棚里采集一些果蝇个体和数千枚虫卵,分析六种代表适应性的身体特征,包括繁殖成功率、发育速度、耐寒性、耐旱性等,这些特征在过去很多研究中已经知道受多个基因控制。同时,研究人员还会每个月从每个大棚里随机选择100只果蝇,通过基因组测序,高度准确地知道基因组中不同位置上等位基因频率随着时间推移发生的变化。
春去秋来,整个实验过程大约覆盖了10代果蝇。研究人员收集并分析的身体特征和基因组数据给出了清晰的证据:果蝇一直在演化,以适应不断变化的自然环境,而且演化速度比以往任何人测量的都要快。
适应幅度出乎意料的大,超过60%的基因组在发生直接或间接的变化!研究人员解释,这不是说进化选择作用在大半部分的基因组上,而是在“遗传牵连效应”(genetic draft)过程中一部分DNA发生变化“牵连”了另一部分DNA。
记录九月的最后一天:早上英语课嘻嘻闹闹,下午英语测试还是嘻嘻闹闹(团结互助的感觉真好,就是差点迟到,晚上喝酒的时候每个人都登陆看看有多少分,韦同学真是不负众望高踞榜首,感觉下节课的英语宠儿已经诞生哈哈哈哈哈哈哈哈),6点半下课后,不想去实验室了,翘吧。到了才知道,原来翘的不止我一个哈哈哈哈哈哈哈哈,只剩下可伶的焦同学只能留在实验室看师兄新买的鱼乌龟龙虾蛤蟆打架哈哈哈哈哈哈哈,晚上11点和老j去实验室打个晚卡(师姐看到我们两个都懵了哈哈哈哈哈哈,焦同学直言你们旷工在外买醉居然不带我,,,,
七十斤的啤酒(这啤酒真的好好喝!)也不是闹的,十十五二十小姐牌逛完三园人是真的晕,一群人压马路推车回的宿舍
这群人啊,就觉得快放假了(可惜一个个的导师都没批假哈哈哈哈哈哈哈哈,不过还是想狂嗨,计划着去各市县哪哪玩,喝到11点半散了,回去说想开黑,结果组织者鲁班先睡着了(鲁班上楼的时候走路都是s形的[二哈])。。。为了体现出明天是国庆假期,这群人居然想5点半去海边看日出(并且他们做到了,还去吃了个早茶,他们怎么那么有活力呢),静静5点半醒的时候,我还是惊醒了一下,并佩服了一下她的毅力就继续睡了(没办法9点还有实验呢[苦涩])。我不能理解的是半夜一点半睡的人,居然还能8点扣我去实验室[苦涩],果然人类的悲喜是不相通的(他还刺激我国庆他能回家我不能回[单身狗])
第二天人还有懵的,做实验都没精力,幸好队友都是靠谱的
七十斤的啤酒(这啤酒真的好好喝!)也不是闹的,十十五二十小姐牌逛完三园人是真的晕,一群人压马路推车回的宿舍
这群人啊,就觉得快放假了(可惜一个个的导师都没批假哈哈哈哈哈哈哈哈,不过还是想狂嗨,计划着去各市县哪哪玩,喝到11点半散了,回去说想开黑,结果组织者鲁班先睡着了(鲁班上楼的时候走路都是s形的[二哈])。。。为了体现出明天是国庆假期,这群人居然想5点半去海边看日出(并且他们做到了,还去吃了个早茶,他们怎么那么有活力呢),静静5点半醒的时候,我还是惊醒了一下,并佩服了一下她的毅力就继续睡了(没办法9点还有实验呢[苦涩])。我不能理解的是半夜一点半睡的人,居然还能8点扣我去实验室[苦涩],果然人类的悲喜是不相通的(他还刺激我国庆他能回家我不能回[单身狗])
第二天人还有懵的,做实验都没精力,幸好队友都是靠谱的
自19世纪初以来,黑皮诺在加州的葡萄酒酿造中一直只是扮演着配角。但在过去的20年里,借着著名电影《杯酒人生》(SIDEWAYS)的东风,黑皮诺一跃成为加州葡萄园的宠儿。
当然,通过不断在不同的土壤上实验种植,加州的一些地区也成功酿造出了平衡、内敛、层次分明的黑皮诺。在索诺玛郡(Sonoma County),温暖的俄罗斯河谷(Russian River Valley)地区出产果味突出风格的黑皮诺。卡内罗斯(Carneros)和索诺玛海岸由于气候凉爽,其出产的黑皮诺更倾向于明快的风格。而南部的圣巴巴拉郡(Barbara County),包括圣玛丽亚谷(Santa Maria valley)、圣伊内斯山谷(Santa Ynez Valleys)以及圣丽塔山(Sta. Rita Hills)这几个地区出产的黑皮诺,被认为很好体现了黑皮诺内敛和泥土芳香的特征,还带着辨识度极高的丰富果脯香气。
当然,通过不断在不同的土壤上实验种植,加州的一些地区也成功酿造出了平衡、内敛、层次分明的黑皮诺。在索诺玛郡(Sonoma County),温暖的俄罗斯河谷(Russian River Valley)地区出产果味突出风格的黑皮诺。卡内罗斯(Carneros)和索诺玛海岸由于气候凉爽,其出产的黑皮诺更倾向于明快的风格。而南部的圣巴巴拉郡(Barbara County),包括圣玛丽亚谷(Santa Maria valley)、圣伊内斯山谷(Santa Ynez Valleys)以及圣丽塔山(Sta. Rita Hills)这几个地区出产的黑皮诺,被认为很好体现了黑皮诺内敛和泥土芳香的特征,还带着辨识度极高的丰富果脯香气。
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