#工大速递#【生命学院本科生在生物信息类国际顶级期刊发表论文】近日,生命学院2018级生物技术专业(全英文授课国际班)学生罗力恒以第一作者在生物信息类国际顶级期刊《Briefings in Bioinformatics》(IF=11.622)发表题为“Bibliometric review of ATAC-Seq and its application in gene expression”综述论文。
https://t.cn/A666rTph
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#brainnews[超话]#
Cell Research:灵长类神经节隆起进化保守性与非保守性的发育特征
来源:brainnews
神经节隆起(Ganglionic eminence, GE)是胚胎大脑发育阶段一个短暂存在的结构,几乎所有非原位生成的中间神经元都起源于此。神经节隆起可被分为三个亚区:外侧神经节隆起(LGE),中间神经节隆起(MGE)和尾侧神经节隆起(CGE),这些亚区所产生的中间神经元的形态、去向和功能均不相同,这些中间神经元与兴奋性神经元一起,共同构成了大脑的神经调控网络,对维持大脑的兴奋/抑制平衡起到重要作用。
大脑神经元兴奋/抑制平衡失调会导致多种神经发育疾病如自闭症和精神分裂症。同时,灵长类与啮齿类动物在神经节隆起发育时的差异,也对物种间中间神经元数量以及大脑体积与功能的差异起到至关重要的作用。
2022年3月10日,中科院遗传发育所许执恒课题组在Cell Research发表了题为Evolutionarily conservative and non-conservative regulatory networks during primate interneuron development revealed by single-cell RNA and ATAC sequencing的研究成果,描绘灵长类神经节隆起进化保守性与非保守性的发育特征及调控网络。
Cell Research:灵长类神经节隆起进化保守性与非保守性的发育特征
来源:brainnews
神经节隆起(Ganglionic eminence, GE)是胚胎大脑发育阶段一个短暂存在的结构,几乎所有非原位生成的中间神经元都起源于此。神经节隆起可被分为三个亚区:外侧神经节隆起(LGE),中间神经节隆起(MGE)和尾侧神经节隆起(CGE),这些亚区所产生的中间神经元的形态、去向和功能均不相同,这些中间神经元与兴奋性神经元一起,共同构成了大脑的神经调控网络,对维持大脑的兴奋/抑制平衡起到重要作用。
大脑神经元兴奋/抑制平衡失调会导致多种神经发育疾病如自闭症和精神分裂症。同时,灵长类与啮齿类动物在神经节隆起发育时的差异,也对物种间中间神经元数量以及大脑体积与功能的差异起到至关重要的作用。
2022年3月10日,中科院遗传发育所许执恒课题组在Cell Research发表了题为Evolutionarily conservative and non-conservative regulatory networks during primate interneuron development revealed by single-cell RNA and ATAC sequencing的研究成果,描绘灵长类神经节隆起进化保守性与非保守性的发育特征及调控网络。
#studyaccount[超话]#
20220310
这周进度还是好水[单身狗]本想一鼓作气把新数据全部跑完,结果发现signac不支持这种输入,只能从预处理开始做了。折腾半天又发现并不是用ATAC-seq的流程,打算摆烂后还是找到了大概可以用的脚本,结果从头开始建环境现在还没建完,希望这周大家都不要太努力
20220310
这周进度还是好水[单身狗]本想一鼓作气把新数据全部跑完,结果发现signac不支持这种输入,只能从预处理开始做了。折腾半天又发现并不是用ATAC-seq的流程,打算摆烂后还是找到了大概可以用的脚本,结果从头开始建环境现在还没建完,希望这周大家都不要太努力
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