# 腾讯新闻 # 浩浩耗:河北最早2例新冠病毒样本测序结果首次公布:病毒变异情况传播性产生影响吗?

中国疾病预防控制中心周报昨日公布了河北疫情最早发现的两个新冠病例(A:石家庄病例,B:邢台病例)体内的病毒样本测序结果。A,B病毒序列同源性很高(图2,黄色高亮),只有一个碱基序列的差异,所以几乎可以断定,这两个病例虽然在异地发现,但应该是源自同一感染路径。
此外,目前在数据库(GISAID, GenBank)里能找到的,跟A,B病毒序列最接近的是,去年7月份上传的3株最早在俄罗斯发现的病毒序列(图2,紫色高亮),但仍然有10个碱基序列的差异。所以判断,这次河北的疫情可能源于俄罗斯的境外输入,但中间经历了如何的传播途径,是人传人,还是物传人(冷链),目前还不得而知,全面的排查工作还在紧张的进行中。

那河北这两例病毒的变异情况,会对病毒的传播性产生影响吗?

根据公布的结果,与最早在武汉发现的新冠病毒序列相比(EPI_ISL_ 402119),在两种毒株共发生了22处序列突变,其中有7个变异位点与欧洲的L1病毒株系一样。但仍然有另外15个独特的变异位点,(T2392C, C6354T, T7075C, C10747T, A11794G, C15342T, C15360T, G15666A, C16733T, C21727T, T22020C, C25416T, C27213T,  C29835T,T23227C(邢台病毒特有))。

那么这些变异的名字有什么含义呢? 大家高中生物课上应该都学过,DNA的结构很简单,是由四种碱基组成:分别是A(腺嘌呤)、T(胸腺嘧啶,在RNA上被U尿嘧啶取代)、G(鸟嘌呤)、C(胞嘧啶)。由于新冠病毒最早的序列是来源于武汉的,所以目前通常都把最早的病毒序列作为参照,新的病毒型,凡是跟参照序列不一样的地方,我们就认为是一个序列突变。那么变异的命名格式有两种:

I. 参考病毒碱基序列-序列位置(第几个碱基对)-突变病毒碱基序列:比如 G15666A,就是参考病毒序列的第15666个碱基对,由原本的G鸟嘌呤变成了A腺嘌呤

II. 参考病毒氨基酸序列-序列位置(第几个氨基酸)-突变病毒氨基酸序列:比如臭名昭著的D614G,就是参考病毒序列的第614个氨基酸,由原本的D天冬氨酸呤变成了G甘氨酸。

根据以往的经验,往往造成病毒传播性提升的变异都发生在新冠S蛋白区域,而前面提到的15个独特变异中只有三个落在这个区间。我做了个大概的分析:C21727T根据密码子对照,为同义突变,突变前后都编码脯氨酸,不会影响蛋白结构。T22020C, 会把甲硫氨酸变为苏氨酸,可能会影响蛋白结构。T23227C都编码丝氨酸,也是同义突变。加上目前还没有其它相关报道,所以个人判断这次发现的病毒,在传播性上不会出现明显的提升。 https://t.cn/A6qgXvez 来自@腾讯新闻

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