【人类基因组计划第一份草图发布20周年!中国科学家系统梳理古DNA中人类演化史】今年是人类全基因组草图发表20周年。1990年,人类基因组计划启动,2001年,长达30亿碱基对的人类基因组草图绘制完成。这不仅是人类历史上的一项壮举,也是分子生物学领域的一个巨大里程碑。

近日,《科学》杂志邀请国际上与其相关领域前沿团队撰写在人类基因组计划出现后的重要进展,其中,中科院古脊椎动物与古人类研究所研究员付巧妹受邀领衔关于古DNA领域的发展以及前沿研究综述。综述系统梳理了过去十余年来古人类基因组学研究的发展,于9月24日在《科学》特刊-人类基因组计划第一份草图发布20周年上发表。

上世纪80年代,通过获取的一些小的古DNA片段,分子古生物学家对古DNA有了一些初步的认识。21世纪初期,受益于人类全基因组的发表和高通量测序技术的发展,古DNA领域开始蓬勃发展。2010年,以人类全基因组为参考序列,分子古生物学家发表了三个古人类的基因组草图:一个尼安德特人、一个丹尼索瓦人,以及一个古爱斯基摩人。至此,古基因组研究新纪元正式开启。

古老型人类及早期现代人格局

2010年,对尼安德特人和丹尼索瓦人这两种古老型人类的全基因组的成功测序,从分子生物学角度揭示了这两个现代人“近亲”的遗传信息。

尤其是丹尼索瓦人,由于当时化石形态证据的缺乏,他是第一个,也是目前唯一一个,仅仅由古DNA证据揭示的新古老型人类。他们在约55万年前与现代人分离后,陆续又与除了非洲人群外(近来有研究提出非洲人群可能也存在与古老型人群的混合)的现代人群发生了多次混合。

混合的结果不仅导致多个现代人群基因组中不同程度地残留有古老型人类的DNA片段,还使得尼安德特人的线粒体基因组和Y染色体在约37万-22万年前被现代人取代。

古DNA研究还发现了数个现代人和古老型人类混合后不久产生的后代,以及一个丹尼索瓦人和尼安德特人“夫妻”的孩子。这些发现让我们明确,至少在人类漫漫五十万年的历史长河中,这些古老型人类和现代人其实比我们预想得更加亲近且交流更加频繁。

尽管遗传学证据支持现代人起源于非洲,但目前还没能构建出统一的模型。在摩洛哥发现的、距今约31.5万年的化石是目前最古老的具有部分现代人形态特征的人类化石。约25万至20万年前,五个非洲人群在短时间内分离,为非洲的狩猎采集者、农业游牧人群以及非洲外人群提供了祖源成分。大约在8万-6万年前,东非、西非和非洲外人群的祖源人群之间发生了一系列的分离事件。

在欧亚地区分布的早期现代人群存在多个支系。有些人群对现代的人群没有可检测到的遗传贡献,还有些人群和现代的人群有关。发现于西伯利亚中部等个体对当今人群没有可检测的遗传贡献;而在中国发现的田园洞人和AR33K个体、在比利时发现的Goyet Q116-1和俄罗斯发现的Kostenki 14个体、在俄罗斯发现的Mal’ta和Yana个体则分别代表了古东亚人,古欧洲人和古北西伯利亚人。

随着时间的推移,这些人群发生交流、迁徙,形成更精细的人群结构。

尽管科学家对欧亚早期现代人群的认知还较为有限,但古DNA研究不断充实着这些人群历史的细节。比如2017年一项研究发现来自中国4万年前的田园洞人和远在比利时3.5万年前的GoyetQ116-1个体存在遗传联系。这个发现有些出人意料,因为一般来说,距离相隔较远的人群直接发生基因交流可能性不大,所以可能性更大的情况是,他们之间存在第三个人群,将两者联系了起来。四年之后,一项新发表的研究发现了一个生活在保加利亚的古老现代人群和两个人群都存在遗传联系,验证了之前的猜想。

末次盛冰期及近万年演化史

末次盛冰期是距今最近的极寒冷时期,在这段时期的欧亚大陆发生了一系列的人口变化。在欧洲,以比利时约3.5万年前的Goyet Q116-1个体为代表的的遗传成分可能在大区域被取代,在末次盛冰期快结束时重新扩张。

在亚洲,田园洞人和AR33K的遗传成分曾广泛存在,然而末次盛冰期之后,早期东亚北方人的遗传成分开始出现(AR19K),这说明东亚北部有些人群可能在此期间发生了更替。

在北亚,也发生了晚期人群遗传成分的变化。除此之外,人类也在逐步适应这段严寒环境。例如,使东亚人产生区别于欧洲人特征的EDAR基因的变异最晚从末次盛冰期末开始出现并且频率升高,支持了该变异可能可以在低紫外线环境中增加母乳中的维生素 D以提高幼儿的存活率的假说。

近万年来,气候变得温暖而稳定。全球出现了更为活跃的人群活动,包括快速的扩散、迁徙、互动和更替等。这些世界范围的人群迁徙与互动,以及后续相关历史事件的影响,逐步形成了全球人群的大致格局。

论文全面梳理了全球各大版块的主要人群遗传历史事件,以下主要介绍东亚和东南亚地区内容。

在万年前,东亚和东南亚已存在多样化的人群,其中至少包括以新石器时代山东人群为代表的古北方成分人群、东南亚的古老现代人群——和平文化人群、以福建奇和洞人和广西隆林人为代表的两种不同的东亚古南方人群、日本的绳纹文化人群。而东亚南北方人群至少在1.9万年前出现遗传差异。

随着时间的推移,“古北方人群成分”和 “古南方人群成分”在南北方人群之间发生了流动和变化,说明南北方人群在不断发生交流与融合。现今南方人主要是大量古北方人成分和下降的古南方成分混合。1.4万年前的黑龙江人群可能是与美洲原住民最相关古北亚人群的东亚成分来源。

另外,早在东亚南方及东南亚出现农业之前,东亚南方人群就和东南亚人群存在交流。蒙古地区人群在新石器时期几乎只携带东亚人群的遗传成分,后来大约在5千年前受到草原人群影响,到3千多年前引入了草原人群和欧洲农业人群的遗传成分。

这些古基因组学证据不仅揭示了种种人群历史事件,还为一些考古和文化上的争议提供了新的证据。

目前,古基因组数据已达到6千余个,只能让我们初步了解人类演化史。

不久前发表的超过一百万年的古DNA数据,极大地增加了研究人员用古DNA探索更大时间尺度演化历史的信心。高效的DNA捕获技术甚至能在沉积物中捕获古代人类和动物的基因组片段,而古蛋白质组、古微生物组、古甲基化组技术以及针对古DNA设计优化的生物信息学工具也为我们提供了更为全面详实的古分子信息。

该研究由中国科学院、国家自然科学基金委、腾讯科学探索奖及美国霍华德·休斯医学研究所资助。https://t.cn/A6MbxXEa

【暴雨追踪】上午十时起一直到傍晚,河南中北部遭遇较强降水,霸占全国小时降水量排行榜。降水中心目前已经由河南转移到山东,山东雨势逐渐增大。根据河南气象消息:今天白天(05时至17时),洛阳局地出现大暴雨,新乡、焦作、郑州、许昌、开封、商丘、周口、南阳局地出现暴雨,有364个雨量站降水量超过50毫米,其中大于100毫米的有3个,最大降水量出现在洛阳市栾川县老君山140.1毫米。最大小时雨强出现在开封市杞县板木64.1毫米。

本轮副高北侧切变线降雨较稳定,但是也有猛烈的对流短时强降雨。预计未来十天四川盆地黄淮等地仍多降雨,累计降雨量较常年同期明显偏多,局地偏多2倍以上。今天20时至明天20时 ,四川东北部、陕西南部、山西南部、河南中东部、山东、苏皖北部等地部分地区有大到暴雨,其中,山东中南部等地局地有大暴雨(100~120毫米)。
#天气##暴雨##河南暴雨#

济南的未来之城按下快进键

近日,济南通过了《关于加快济南新旧动能转换起步区建设的意见》,明确了五年成形、十年成势、十五年成城的“三步走”发展目标。

济南起步区位于山东济南北部,包括8个街道及相关沿黄街道部分区域,总面积798平方公里,将逐步建成“一纵一横两核五组团”的空间布局。目前,起步区已进入大规模施工阶段,到2025年,起步区综合实力大幅提升,现代化新城区框架基本形成;到2030年,起步区核心优势基本塑成,城市综合功能基本完善;到2035年,起步区现代产业体系基本形成,绿色智慧宜居新城区基本建成。

《意见》提出,高标准编制起步区规划,立足“山泉湖河城”浑然一体的自然禀赋,彰显“城即园林”的城市特质,突出动能转换、产城融合的发展定位,坚持未来眼光、国际标准、黄河特色,科学确定国土空间格局,合理构建空间布局,精心设计总体城市形象,注重塑造风貌特色,加快完善规划体系,确保一张蓝图干到底,精心推进不留历史遗憾;聚力打造黄河流域生态保护样板,牢固树立“山水林田湖草沙是生命共同体”理念,修复生机盎然的自然生态系统,建设优美自然的绿色生态廊道,打造天蓝地绿水清的生态环境,构筑长久稳固的黄河安澜防线;全力构建具有国际竞争力的现代产业体系,聚焦高端高质高效、集聚集群集约的产业发展方向,加快打造科技创新引擎,大力发展战略性新兴产业,做大做强先进制造业,培育壮大高端现代服务业,深入挖掘黄河文化时代价值,构建形成以科技创新为核心动力、以战略性新兴产业为引领、以先进制造业为主体、以现代服务业为支撑、以文化产业为重要内容的现代产业体系,打造黄河流域高质量发展核心增长极。

济南起步区将打造成黄河流域生态保护和高质量发展的新示范、山东新旧动能转换综合试验区的新引擎、高水平开放合作的新平台、绿色智慧宜居的现代化新城。


发布     👍 0 举报 写留言 🖊   
✋热门推荐
  • 而top 100排名的高低与否直接关乎这首歌能蹭到多少韩国本土的路人盘,首页的新歌榜也是如此。收听量就是靠这么一点点拾起的水滴最终汇聚成河流的发这个贴一是科普,
  • #MileApo[超话]# #mileapo# 【20230517】Mile Twi更新GNcr: milephakphum•┈┈┈┈ ℳℯ❤️ℴ ┈┈┈┈•数
  • 这款霜就是有才心安的存在,首先就是她很适合敏感期换季或者医美时候用,其次总有犯懒的时候,这一瓶顶了精华➕面霜,现在天气热了,就只用这个就行了,吸收也很快。看图
  • #BounPrem[超话]#20230516相关BetweenUs澳门fm官宣啦[打call]“Between US”— Close to you 巡回见面会澳
  • 」※关西地区#GENERATIONS##GENE_集合起来躁动起来联系起来##GENE_日本点点##DREAMERS##generations[超话]#2023
  • 日式姜麻西兰苔:想着总得点些素菜吧,调了个比较特别的,第一次吃,有点像西兰花和油菜的结合体[笑cry]。香草素鸡块:调味和质地都挺真实的,蘸着番茄酱,真有种在吃
  • #朴智旻[超话]##朴智旻致命魅力##朴智旻圈饭诱发者# 往罗浮山下梅花村,玉雪为骨冰为魂。 . . 【经验tt】我就说这个造型我
  • #刘宇宁魏劭# | #刘宇宁折腰# | #摩登兄弟[超话]#遇见你是故事的开始,走到底是余生的欢喜@摩登兄弟刘宇宁刘宇宁魏劭[给力]刘宇宁折腰刘宇宁宁远舟[给力
  • 被拯救了 我要感叹洪社长真的很会选人 最后一个他选出来的cube团 娃每个人的音色都很特殊 看到有4000个人和我一起看live真的很开心kkkk 小狐狸的实力
  • #跟段宜恩游世界# ☀️ #段宜恩晚安# Hospital day… So, there was only a brunch for today. It wa
  • #南宁天气[超话]#【大风天气提示】受暖低压发展影响,16日下午以来,我市部分乡镇(街道)已出现大于10m/s的偏南大风,最大出现在横州市江南水库13.4m/s
  • 在莫奈的经销商保罗(Paul Durand-Ruel)的支持下,莫奈得以在桥段附近居住,因而他创作了很多户外的作品。油画中,莫奈淡化了画面的具体轮廓,并以鲜艳的
  • 我也是有点毒奶属性的[跪了]这站的新后悬架这就无了。*之前看到马丁在这一站也不会有重要升级,而是小步改进。
  • A true definition of a fan to me is no matter what your record is and how you’re
  • [憧憬][憧憬]客房装潢复古浪漫,有多种房型供你选择,有些客房还能看到格但斯克老城和摩特拉瓦河(Motława)河上的风景。阳光明媚的时候,波波十分推荐你到酒店
  • 彩色相机 20220330kingandprince_j ⁡真ん中で廉と俺に挟まれてる⁡カイトは2768gで元気に生まれました。小さい頃はガキ大将という意味でな
  • Cëvol 珠宝春季新品生而闪曜 BELIEVE SHINE 钻石,寓意永恒与尊贵,在浓郁鲜活中迸发生命的磅礴律动。★ Cëvol Sunlight 光影系列以
  • 心爱的茶叶找不到,翻遍了家里也无果,极度混乱的一晚上[衰],可能被我随某个箱子当成垃圾扔掉了……。罢了,就当喝完了吧[失望][跪了]以后遇任何事,不能太极端,譬
  • #电影ManSuang[超话]##ManSuangInCannes2023##ปลาน้อยของต๋อง##tongthk##tongaquarium##Mi
  • 这款BP 材质的1/32 比例雌性暴龙解剖雕塑,相比 EVO 之前的解剖雕塑作品,打印精度有所提升,作品重量更轻,以便于教学展示和艺术赏玩03.JP3-Male