【追踪胚胎发育有了“高精度导航图”!新研究在单细胞水平上绘制4D蛋白质图谱】生命伊始,精子和卵子相结合,产生受精卵,细胞开始分裂,生命的画卷自此展开,潜滋暗长形成各种功能完备的组织器官。在此过程中,细胞是如何沿着既定的“命运轨道”发展的?

为打开胚胎发育的“暗箱”,中科院遗传与发育生物学研究所(以下简称遗传发育所)杜茁研究组在单细胞水平上绘制了一份蛋白质图谱,它就像一张高精度导航图一样,揭示了胚胎发育过程中细胞实时调控的奥秘。相关成果https://t.cn/A6fgd32K月26日发表于《自然—方法学》。

△ 一份了解胚胎发育的分子图谱

生命体的构建始于胚胎发育,其调控动态复杂。

“发育图式如何建立,即受精卵产生的各个细胞如何获得特定命运,并建成形态功能完备的组织器官,是胚胎发育的核心问题。”遗传发育所研究员、论文通讯作者杜茁对《中国科学报》说。

上世纪七八十年代,发育生物学先驱John Sulston通过绘制秀丽线虫全部体细胞的发育起源和谱系关系,首次揭示了一个多细胞动物整个发育过程的细胞图谱,在单细胞水平系统刻画了发育图式建立过程。线虫也因此成为高精度解析发育动态调控的先导模式动物。

然而,参与发育的细胞的分子特征尚未完全阐明,其内部的分子动态调控过程研究仍有待深入。

“一个切入点是阐明各个细胞在各个时刻的基因表达和调控。”长期从事基因时空动态表达与发育调控相关研究的杜茁表示,当前单个细胞的转录组测定已成为可能,但如何将转录组与细胞身份精确对应,达到单细胞注释精度仍十分困难。如何进一步提高表达分析的时间精度和维度,实现原位、实时、连续解析蛋白的动态变化也有待探索。

利用蛋白质融合荧光报告系统和四维实时成像技术,杜茁研究组绘制了一份蛋白质图谱,就像GPS实时导航图一样,它包含了线虫胚胎发育期间几乎所有细胞谱系中数百个转录因子的原位动态表达。基于此,研究者在转录因子单细胞蛋白动态表达和命运图式建立调控规律解析方面取得新进展。

△ 动态揭示细胞“命运”

在胚胎发育过程中,细胞究竟是如何走上不同的“命运轨道”、发育成不同的器官、发挥不同作用的呢?

通过聚焦发育调控关键基因——转录因子,杜茁研究组在新研究中构建了数百个可指示蛋白动态表达的荧光报告品系,综合活体成像、细胞鉴定、实时谱系追踪、单细胞荧光定量分析,在原位、4D、单细胞水平解析了转录因子在各个细胞中的蛋白动态表达。

作者采用非损伤方式,通过成像和细胞追踪对细胞身份予以精确判定,并系统整合多个蛋白的单细胞表达水平,实现了真正意义上的单细胞注释精度的蛋白动态表达解析。

“这是一篇非常优质的论文,描述了266个转录因子蛋白的表达模式。关键是,这些基因报告器是由fosmid(质粒克隆)重组或CRISPR插入内源性位点产生的,绿色荧光蛋白直接与转录因子蛋白融合。”一位审稿人评价称,“这对科学界的相关研究有着巨大价值。”

利用该图谱,作者首先从多维度解析了细胞命运图式建立的分子调控框架。研究发现,转录因子在四个层级——谱系来源、体轴定位、细胞类型、发育时间,通过时间和空间的部分重叠和交错组合,逐步赋予不同细胞各异的调控状态。

“每个层次的区分均涉及多个表达部分相似的不同转录因子,赋予调控过程高度稳固性。”论文共同第一作者、杜茁研究组助理研究员马雪华说,计算模拟显示,去除数十个转录因子仅对图式建立的精确度造成有限影响。该结果初步揭示了错综复杂的命运图式逐级建立过程的调控逻辑。

为理解转录因子发育功能,研究整合了单细胞表达相似性和基于实验数据的转录因子—靶基因信息,构建了时空特异性调控回路,涵盖161个发育时空模块中8000多个转录因子间的调控关系,并基于此揭示了经典调控基因的新功能和新发育调控过程。

对此,另一位审稿人指出,作者之所以能够识别出胚胎发育的调节因子,是因为运用了许多先进的研究方法,该蛋白图谱可进一步与单细胞测序、ChIP-Seq(可在全基因组范围内对蛋白质结合位点进行高效准确筛选与鉴定的方法)、功能实验等相结合。由此获得的单细胞蛋白动态表达图谱“还可以被进一步用于推导出可被实验验证的新假说”。

△ 引领发育调控新认知

不只是绘制“地图”,研究者还希望“按图索骥”,为模拟和解析细胞调控状态与细胞命运的动态关系提供帮助。

基于高时空精度的分子与细胞图谱的整合,研究者系统探究了细胞调控状态的多样性和复杂性。结果发现,调控状态随谱系展开呈现出高度差异化,尽管同类组织细胞在随后发生趋同,但仍呈现高度依赖于谱系来源的状态多样性。

“因此,细胞的发育历史对其最终功能的塑造有着不可忽略的影响,而谱系的组织方式决定了同类细胞状态及功能的多样性。”论文共同第一作者、博士研究生赵志广说。

研究进一步发现,细胞调控状态随发育持续变化直至终末分裂,其转变轨迹高度非定向,提示沃丁顿发育地貌蜿蜒曲折,细胞历经多个中间状态,通过长时间的 “绕路” 到达终点。

作者表示,该研究为解析胚胎发育的分子调控规律提供了完整、精确和标准化的参考信息,为“表达启示型”基因发育功能研究、调控状态—功能定量生物学研究、单细胞—全胚胎—多维度系统生物学研究奠定基础。

“对于‘高等’模式动物,单细胞分析或为一新兴领域,而线虫发育生物学进入单细胞时代已逾四十载。”杜茁说,“我们的研究提示,即便是仅由千余个细胞构成的 ‘简单’生物,人类对其发育调控动态性、多样性和复杂性的认知也才刚刚开始。”https://t.cn/A6fgd32N

支持菲律宾青年就业
亚行批准4亿美元新贷款
亚洲开发银行(ADB)周二表示,它已经批准了一笔4亿美元(201亿比索)的贷款,用于促进菲律宾年轻人的就业和技能项目。
  
亚行在一份声明中表示,该资金将帮助促进青年从学校到工作过渡项目子项目3,帮助「处于风险」的菲律宾年轻人更快地找到工作。
  
它说,该资金也将惠及劳工部的公共就业服务办公室(PESOs)项目,如劳动力市场项目,工作场所技能发展和创造一个健康工作环境的努力。
  
亚行表示,该贷款支持的其它改革包括创建一个10亿比索的帮助就业奖学金基金、一项失业保险计划和首次求职者法案。
  
亚行东南亚公共管理、金融部门和贸易主任扶西说,「大流行已经导致许多部门,特别是年轻人失业。迫切需要通过创新的劳动力市场项目和技能发展计划来帮助菲律宾年轻人找到工作。」

他说,「这笔新贷款反映了我们的长期承诺,即确保年轻人找到工作,从而改善他们的生活,并为大流行后的经济增长创造更广泛的就业基础。」

2020年4月,由于COVID-19大流行,菲律宾的失业率大幅上升。该银行称,大流行也导致了低质量的工作。
亚行表示,这个子方案是继2017年和2019年批准的两笔贷款后。
  
亚行东南亚主要金融部门专家史蒂芬说,「这笔贷款将帮助年轻求职者,尤其是女性,获得培训机会,并提高她们的技能开发。它将加强劳动市场政策,并通过集体生计和创业项目,帮助因大流行在海外失去工作的回流菲律宾工人。」
  
亚行表示,它正在为2022年「更大力支持」劳动力部门做准备。

菲6月国际收支逆差3.12亿美元
菲律宾中央银行(BSP)周二说,本国在6月底录得3.12亿美元的国际收支逆差。
  
央行表示,这相比去年同期录得的8千万美元的BOP顺差发生了逆转。
  
央行表示,「2021年6月的BOP逆差主要反映了中央政府提取它在央行的外汇存款以偿还其外汇负债和各种支出,以及央行净外汇操作造成的外流。」
  
不过央行补充称,央行海外投资收入的流入和这些部分抵消。

6月的逆差使今年上半年的累计BOP逆差达到19.4亿美元,相比去年同期41.1亿美元的顺差发生逆转。
  
央行表示,「根据初步数据,这累计的国际收支逆差部分归因于商品贸易逆差扩大。」
  
这个逆差也意味着本国的国际储备毛额(GIR)从2021年5月底的1072.5亿美元降至2021年6月底的1057.6亿美元。这也低于年初的1101.2亿美元。

央行说,「这最新的GIR水平代表了外部流动性缓冲绰绰有余,相当于12个月的商品进口、服务支付和主要收入。此外,按初始期限计算,这也是本国短期外债的7.7倍左右,按剩余期限计算,是5.1倍。」
  
惠誉信评早些时候说,菲律宾的外部融资仍保持着信贷实力,因为外汇储备保持在高位,外债总额保持在可控水平。

政府支出再次超过收入
菲6月预算赤字1499亿比索
国库局周二表示,由于政府支出再次超过收入,菲律宾6月份录得预算赤字1499亿比索。

6月的赤字将上半年的总赤字推高至7161亿比索,比去年同期高出27.8%。但国库局也指出,这仍比计划的同期赤字1.018万亿比索低29.7%。
  
国库局称,「6月总收入下滑至2456亿比索,较去年的3510亿比索减少了30%或1054亿比索。」
  
但是,由于税收的增加,上半年的收入为1.49万亿比索,比去年同期增加了2.6%,或370亿比索。该机构表示,这也比修正后的1.422万亿比索的预测高出4.8%。
  
与此同时,6月份的中央政府支出达到3954亿比索,比去年同期增长13.2%。这些资金主要用于基础设施项目、军队现代化、海外菲人紧急遣返、高等教育委员会智能校园项目,以及选举署为2022年选举准备活动的支出。
  
国库局表示,截至2021年6月底的总支出为2.206万亿比索,也比上年的实际支出高出9.6%,但比修订后的2.44万亿比索减少9.6%。
  
菲律宾一直在为应对新冠肺炎疫情以及雄心勃勃的基础设施项目大量支出和借贷。

FINEX呼吁总统:
立法悬而未决的「亲商」议案
一个商业团体周二表示,杜特尔特总统应该确保关键的「亲商」议案在他任期结束前通过立法,从而吸引更多的投资。
  
菲律宾金融高管研究所(FINEX)在一份声明中表示,该团体希望杜特尔特在明年卸任前批准资本市场发展议案、外国投资法案修正案、公共服务议案和零售贸易自由化法案。

FINEX会长弗朗西斯·林说,「我们期待出台更多有利于商业的立法。」
  
他补充说,「我们热切希望总统在他执政的剩余日子里向世界证明菲律宾实行法治,因为这对本国吸引更多的投资同样重要。」

FINEX指出,政府的贡献,特别是经商便利法案、TRAIN和CREATE税法以及大米关税法的通过「是需要政治意愿才能通过的」。
  
该团体表示:「总的来说,这些立法是结构性的和改变游戏规则的,将有助于在这个充满挑战的时期为我们的人民迅速创造就业,并从长远来看对国家有益。」
  
由于新型COVID-19变种的威胁,2020年萎缩9.6%的菲律宾经济仍在艰难地复苏。
  
该团体表示,商业相关法律以及普及高质量高等教育法案和医疗法案「都是我们的人民将铭记的杜特尔特总统的优秀遗产。」
  
杜特尔特在其第六次也是最后一次国情咨文中呼吁国会加快通过三项优先议案,即外国人投资法案、公共服务法案和零售贸易与自由化法案。
  
参议员安牙拉早些时候表示,这些议案「全都处于立法的后期阶段」。

7年期国库券利率略涨
周二,七天期国库券(T-boond)利率继续横盘变动。
  
该债券的平均利率从之前的3.576%上升到3.651%。
  
国库局(BTr)发行该债券350亿比索,而拍卖委员会悉数决标。
  
投标总额几乎翻了一番,达到697.58亿比索,因此,BTr利用持续发售机制再发行10亿比索。
  
国家司库黎礼旺认为,该债券处于曲线最佳点是拍卖期间「投标量强劲」和「利率合理」的原因。
  
她在Viber短信中告诉记者,「它处于曲线最佳点,剩余期限为6年又8个月。」

菲律宾与日本最后落实
大马尼拉地铁一期贷款第二批
外交部(DFA)周二说,本国和日本已经最后落实了大马尼拉地铁项目一期23亿美元贷款的第二批。

DFA说,外交部长洛钦和日本大使Koshikawa交换了文件,最后落实通过日本国际协力机构的贷款的第二批。
  
洛钦说,「大马尼拉地铁将是验证菲律宾和日本之间深厚友谊的一个闪亮纪念碑,一个一流的工作系统。」
  
这个3500亿比索的项目预计将于2025年竣工。大约85%的费用来自日本贷款,预期将分40年偿还,宽限期12年,利息0.1%。
  
交通部长杜牙地较早前说他们计划于今年年底时开放该地铁的部份运作,「最坏情况下」延后到明年一月或二月。
  
该项目于2014年获批,并于2019年2月动工。

NEDA署长表示
疫情期间增加就业岗位220万
社会经济企划部长蔡荣富说,本国的就业岗位比大流行前的水平增加220万个。
  
蔡部长在周一晚国情咨文(SONA)后接受采访时说,通过风险管理和实施细粒状封锁,本国在2019新冠肺炎(COVID-19)期间创造了更多的就业。
  
也是国家经济与发展署(NEDA)署长的蔡部长说,「今天,我们比COVID前增加了220万个就业岗位。」    
  
来自菲律宾统计署(PSA)劳力调查(LFS)的数据显示,2020年1月受雇佣的国人4250万。
  
在2021年5月的最新LFS中,受雇佣的国人总人数为4472万,比2020年1月的数字高出5%,或222万。
  
蔡部长说,「我们实现了史上最低的平困率、就业不足率-意味着有工作单希望增加收入的那些-以及有史以来最低失业率,因此当我们迈入2020年,人们的状况已经显著好转。」
  
不过,由于2020年3月开始的封锁,多数商业企业被关闭,而且大流行带来的各种挑战造成一些企业家关闭他们的商业并裁员。
  
根据PSA说,2021年5月失业国人373万。
  
该NEDA主管补充说,「我们在过去几个季度已经注意到,只要我们能够控制风险并识别最高风险和封锁或限制,我们就能安全地开放余下的经济,因此工人们能够回返。」
  
蔡部长对本国能够通过加强抗击COVID-19的努力和通过并实施将吸引更多投资并为国人创造更多九月的关键经济改革立法而于明年回到大流行前的水平是乐观的。
  
他也强调需要加快推广全国的COVID-19疫苗接种方案。

逢低买入助股市涨2.35%
比索对美元汇率贬值7仙
周二,逢低买入提振了本地股交所,但是比索对美元或率以下跌收官。
  
菲律宾股票交易所指数(PSEi)上涨2.35%,或149.97点,报6,522.58点。
  
全股指跃升1.88%,或74.6点,报4,039.75点。
  
所有类股都收高,地产以3.94%的涨幅领涨。
  
随后是矿业与石油,3.31%;服务,2.43%;金融,1.94%;控股公司,1.75%;和工业,1.46%。
  
成交量总计11.7亿股,成交额43亿比索。
  
上升股以155比43领先下降股,而29种不变。
  
与此同时,相比前一天收市的50.35,比索对美元汇率贬至50.42。
  
它开市报50.27,并在50.425和50.265之间交易。
  
当天平均在50.338。
  
成交额从一天前的9.4437亿美元下降到8.4213亿美元。

从一进入高中开始,似乎考上一个本科学校就成为了每一个学生所必须完成的使命与任务,一旦没能成功考上本科仿佛就大家口中的学渣代表。本科生仿佛无论走到哪里都自带光环,相比之下专科生的处境就黯淡了许多,甚至常常被质疑是不是大学生,久而久之,专科生自己也开始怀疑了。所以大专生究竟算不算大学生呢?“专科生”到底算不算大学生?多数人都不清楚每年高考的结束,都有一批新的学生迈入大学的校园,大家都经历了统一的高等学... https://t.cn/A6f3Vl55


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