9月底10月初在美国白宫所传播的新型冠状病毒SARS-CoV-2序列被研究人员披露,研究发现这一毒株是一种在美国很罕见的毒株,纽约时报进行了深入报道。
今年大选的10月惊奇是美国总统确诊COVID-19,但是白宫对这一事件讳莫如深。纽约时报联合我多次提及的Fred Hutch研究所著名病毒生物信息学专家Trevor Bedford报道了这次聚集传播事件的病毒序列和序列比对,Bedford在Nextstrain上传了这些序列,并撰写了研究论文草稿。
10月初白宫出现了50人感染的聚集传播事件,而这项研究获得了在这次传播事件中的两名记者Shear和Drago的样品。Shear在空军一号与总统有过近距离接触,而Drago参加了Barrett大法官提名庆典。两人均授权了该研究。研究发现这两名记者的毒株高度同源,由此确认了这两人感染的病毒来源相同,被称为白宫株(WH1/2)。但这一毒株的序列与目前全球16万个病毒序列具有较大差异。这一毒株具有5个特征性核苷酸突变,这5个突变分别为3037T,7936T,16260T,20402T和28821A。7936T和20402T尤为罕见,在所有病毒序列中,分别只有0.04%和0.02%具有该突变。因此这一具有5个突变位点的病毒序列与目前流行的病毒序列相比具有显著特异性。
有意思的是,通过序列比对,研究发现这一毒株与目前美国流行的毒株具有共同的祖先(20C),这一祖先是春季在美国(康涅狄格和纽约株)、加拿大和新西兰的流行毒株,但在5月之后这一毒株逐渐减少。而白宫株WH1/2的演变则是完全隐匿的。
研究由此指出,虽然Nextstrain中有美国全境的35000个病毒序列,但是依然可能有遗漏的病毒序列没有被检测出来,这些病毒的传播链可能未被发现从而在民间持续传播;与此同时,美国大部分地区已放弃contact tracing。但由于白宫株序列的稀有性和独特性,因此则会较容易判断从白宫发源的后续传播链的流行情况。
今年大选的10月惊奇是美国总统确诊COVID-19,但是白宫对这一事件讳莫如深。纽约时报联合我多次提及的Fred Hutch研究所著名病毒生物信息学专家Trevor Bedford报道了这次聚集传播事件的病毒序列和序列比对,Bedford在Nextstrain上传了这些序列,并撰写了研究论文草稿。
10月初白宫出现了50人感染的聚集传播事件,而这项研究获得了在这次传播事件中的两名记者Shear和Drago的样品。Shear在空军一号与总统有过近距离接触,而Drago参加了Barrett大法官提名庆典。两人均授权了该研究。研究发现这两名记者的毒株高度同源,由此确认了这两人感染的病毒来源相同,被称为白宫株(WH1/2)。但这一毒株的序列与目前全球16万个病毒序列具有较大差异。这一毒株具有5个特征性核苷酸突变,这5个突变分别为3037T,7936T,16260T,20402T和28821A。7936T和20402T尤为罕见,在所有病毒序列中,分别只有0.04%和0.02%具有该突变。因此这一具有5个突变位点的病毒序列与目前流行的病毒序列相比具有显著特异性。
有意思的是,通过序列比对,研究发现这一毒株与目前美国流行的毒株具有共同的祖先(20C),这一祖先是春季在美国(康涅狄格和纽约株)、加拿大和新西兰的流行毒株,但在5月之后这一毒株逐渐减少。而白宫株WH1/2的演变则是完全隐匿的。
研究由此指出,虽然Nextstrain中有美国全境的35000个病毒序列,但是依然可能有遗漏的病毒序列没有被检测出来,这些病毒的传播链可能未被发现从而在民间持续传播;与此同时,美国大部分地区已放弃contact tracing。但由于白宫株序列的稀有性和独特性,因此则会较容易判断从白宫发源的后续传播链的流行情况。
【陪玩:23种早教游戏清单】
这是我和好朋友Bolin根据新西兰Te Whāriki早教理念,整理出来的早教游戏清单,适合2-9岁小朋友家庭,分享给大家~当不知道跟孩子怎么做早教更高效时,可以多回顾看看哦!
这23种早教游戏包括:废品大冒险、搭积木、读书和讲故事「听说读写」、木工、黏土、拼贴画……等等,大家记得戳图阅读啊~
戳右回顾文章:https://t.cn/A6GvGCz6
#微博亲子季# #向上吧小书包#
这是我和好朋友Bolin根据新西兰Te Whāriki早教理念,整理出来的早教游戏清单,适合2-9岁小朋友家庭,分享给大家~当不知道跟孩子怎么做早教更高效时,可以多回顾看看哦!
这23种早教游戏包括:废品大冒险、搭积木、读书和讲故事「听说读写」、木工、黏土、拼贴画……等等,大家记得戳图阅读啊~
戳右回顾文章:https://t.cn/A6GvGCz6
#微博亲子季# #向上吧小书包#
今天下午在朋友家摘果子的时候,收到大学室友需要换汇的消息[可爱]
后来就闲聊一通,得知她已经结束了新西兰&澳大利亚打工度假之旅了。我晚她一年来新西兰,我来时她已离开!其实当初会选择来新西兰WH有一部分原因是因为她吧!真的蛮勇敢的啊,一毕业就去到异国他乡的南半球!
突然感概时间过得好快,我们都认识快8年了,原来我们上大学都是八年前的事情了啊!也是真的毕了业就再也没见过面!
当然最后还是跟她换了,虽然最近不怎么用RMB[兔子][兔子][兔子]
虽然毕业多年自己混得很浑[允悲][允悲]但是希望大家都好好的呀⊙▽⊙ https://t.cn/RJPlzwB
后来就闲聊一通,得知她已经结束了新西兰&澳大利亚打工度假之旅了。我晚她一年来新西兰,我来时她已离开!其实当初会选择来新西兰WH有一部分原因是因为她吧!真的蛮勇敢的啊,一毕业就去到异国他乡的南半球!
突然感概时间过得好快,我们都认识快8年了,原来我们上大学都是八年前的事情了啊!也是真的毕了业就再也没见过面!
当然最后还是跟她换了,虽然最近不怎么用RMB[兔子][兔子][兔子]
虽然毕业多年自己混得很浑[允悲][允悲]但是希望大家都好好的呀⊙▽⊙ https://t.cn/RJPlzwB
✋热门推荐