东亚人易感长新冠!全球首个全基因组测序找到易感基因https://t.cn/A60qEZvS

近日,科学家首次在基因中找到了问题的可能答案:在肺部和免疫细胞中均很活跃的FOXP4基因附近DNA片段,与患长新冠的几率高出约1.6倍相关,且东亚人相关等位基因频率全球最高。

导语:新冠感染后果,因人而异,与易感基因密不可分。目前,已知长新冠与200多种症状有关,包括严重疲劳、肺功能障碍、神经疼痛以及注意力和记忆力困难。但是,导致长新冠发展的生物学机制仍不清楚。近日,科学家首次在基因中找到了问题的可能答案:在肺部和免疫细胞中均很活跃的FOXP4基因附近DNA片段,与患长新冠的几率高出约1.6倍相关,且东亚人相关等位基因频率全球最高。

据世界卫生组织定义,长新冠(Long COVID)指新冠感染者在感染3个月后还有症状,且症状至少持续2个月,且无法用其他情况解释。研究显示长新冠发病率差异很大,估计从10%到70%不等,异质性很强,病因不明,发病机制不同,且症状会随着时间的推移而衰减。自感长新冠症状严重的患者,在检查后却没有临床指标与症状对应。张文宏认为医学界尚未对长新冠形成统一的科学概念,尚未找到统一的特征和标记。

据张文宏介绍,长新冠主要来自奥密克戎,奥密克戎R0值如此之高,可能已达到病毒进化的极限,再超过数值也许就违反了碳基生命的生物学规律。在奥密克戎诞生前,人类历史上出现的传播力最强的病毒是麻疹,其R0值达到18,但奥密克戎家族的R0值高达20-22。R0值是指在没有干预的情况下,在一个全部是易感人群的环境中,平均一名患者可以传染的人数。

为了解长新冠的根本原因,科学家们把目光聚焦在基因上。新冠肺炎宿主遗传学倡议(HGI)(https://t.cn/A60qEZva) 是一个国际性的合作倡议,旨在通过研究人类基因与新冠病毒感染之间的关系,深入了解新冠肺炎的遗传学基础。三年疫情以来,HGI一直在寻找与严重 COVID-19风险相关的基因。目前,HGI已鉴定出51个与COVID-19危重症、住院和感染相关的全基因组重要位点。这些变异主要涉及病毒进入、气道粘膜防御和I型干扰素反应的典型途径。

近日,斯德哥尔摩卡罗林斯卡研究所进行了全球首项基于HGI的专门针对长新冠的全基因组关联研究(GWAS)。此项研究囊括16个国家进行的24项研究数据,纳入6450名被诊断为长新冠的患者和1093995名对照者。最终在FOXP4基因座发现了长新冠的第一个全基因组显著关联。FOXP4与新冠肺炎严重程度、肺功能和癌症相关,这表明肺功能障碍和新冠肺炎严重程度,在长新冠的病理生理学中具有更广泛的作用。

1、FOXP4基因座的遗传变异与长新冠相关

最常见的长新冠症状是疲劳、呼吸急促以及记忆力和注意力问题。GWAS荟萃分析在FOXP4基因上游的6号染色体上发现了与长新冠的全基因组显著关联,rs9361706-C等位基因与长新冠风险增加1.63倍有关。

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图1 对长新冠的11项GWAS研究荟萃分析显示FOXP4位点存在关联(图源:[1])

2、FOXP4位点长新冠易感基因变异频率因血统而异

FOXP4位点上rs93617106-C等位基因频率在不同的人群中差异很大,其中东亚最高达36%,非芬兰裔欧洲人为1.6%,芬兰裔欧洲人为7.1%。芬兰人为7.1%,混血美国人为19%。研究对象主要是欧洲人后裔,FOXP4变体有显著关联。这是由于等位基因频率较高,因此在这些队列中检测与rs9361706变异相关性的统计能力较大。

3、FOXP4在肺部表达较高,并与 COVID-19严重程度相关

在长新冠相关变异基因100 kb窗口内,rs12660421-A等位基因欧洲血统的长新冠风险等位基因rs9367106-C相关,且与肺部和下丘脑中FOXP4表达的增加相关。FOXP4在2型肺泡细胞中的表达最高,从而参与肺部的免疫调节。FOXP4在粒细胞中几乎同样高表达,这些粒细胞同样参与先天性免疫反应的调节。

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图2 FOXP4在肺中的表达(图源:[1])

4、FOXP4变异与肺癌相关,且与其他多种疾病存在关联

由于长新冠风险等位基因频率在东亚最高,研究人员特别关注了日本Biobank数据。全表型关联 rs9367106与日本Biobank中所有表型的全表型关联研究显示,长新冠风险等位基因与肺癌相关,rs9367106与肺癌的关联具有相同的遗传信号。

长新冠与失眠、抑郁、风险承受能力、哮喘、糖尿病和SARS-CoV-2感染之间存在正相关遗传关系,而与红细胞和白细胞计数呈负相关。基因预测较早开始吸烟、每天吸烟更多、较高水平的高密度脂蛋白和较高的体重指数是长新冠显著的因果危险因素。

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图3 长新冠与潜在危险因素、生物标志物和疾病之间的遗传相关性和孟德尔随机因果估计(图源:[1])

5、FOXP4不能简单地用急性COVID-19的严重程度来解释

早期研究表明,COVID-19的严重程度可能是长新冠的风险因素。研究人员通过双样本MR探索COVID-19住院与长新冠之间的关系。在因果关系方面,发现长新冠和COVID-19住院是同一潜在感染的两个结果,难以将COVID-19住院作为因果暴露解释。FOXP4与长新冠的相关性比预期的更强,这意味着不能简单地用其与易感性或严重性的关联来解释。

此项研究提供了直接的遗传学证据,证明肺部病理生理在长新冠的发展中发挥了不可或缺的作用,FOXP4基因座内的遗传变异是长新冠的风险因素。与以前的长新冠流行病学和临床报告相一致,长新冠与其他病毒后病症类似,是一种多基因遗传病。长新冠是一种异质性疾病,个体遗传变异和环境风险因素都可能导致疾病风险。

英国爱丁堡大学医学生物信息学教授Chris Ponting表示:“人们的各种弱点都会导致未能从新冠感染中恢复过来。虽然很复杂,但也很重要。长新冠对个人健康和社会经济带来巨大压力。只有清楚地了解原因,才有助于治疗更易患上长新冠的患者,并有可能预防长新冠。”

【陆沉×你】匆匆赶到兔子小姐身边共度二周年纪念日的陆沉[陆沉]
#光与夜之恋陆沉[超话]##陆沉##光与夜之恋#
祝各位兔子小姐/未婚妻/萧小五/笨鸟/姐姐二周年快乐[陆沉][查理苏][萧逸][齐司礼][夏鸣星]
:图源应该是是光头的官方头像图,但我不太确定(i mean会不会是哪位太太修复过的)我从别人那里收来的,也没看到有水印,所以麻烦清楚的宝宝们帮我标一下,谢谢捏
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当手机上的数字跳到零点,这是你和陆沉迎来二周年的通知讯号。

给陆沉发了条“两周年快乐”的短讯后,你开始犹豫是否应该给他打个电话。工作的原因,陆沉今天并不在你身边。不得不承认还是有些失落的。但从等待零点的那一刻开始,你便安慰着自己,时间不过是人类给宇宙定义的尺度,而你和爱人的联系则为永恒。

但当数字刚跳到零点一分时,你接到了来自陆沉的视频通话。

他看起来有些疲惫,眼下微微乌青,这是他没有与你分享过的,脆弱的陆沉。他的眼皮原本有些惺忪,懒洋洋耷拉着。在你接通电话,兴奋而惊喜的脸出现在手机屏幕上的那一刻,勃艮第红的眼睛似乎被阳光照耀,立马弯成一个温和可爱的弧度。

“两周年快乐,我的兔子小姐。”陆沉那边传来些许嘈杂,而你只听到了挂念了一整天的陆沉的声音。你很高兴,随即察觉到他的疲惫。

其实你清楚,陆沉的行程一向紧凑而繁琐,正因为这样,担心打扰到他休息才没有第一时间打去电话。当你接到他电话的那一刻,率先感到欣喜,随后是疑惑,在看到爱人脸庞的那一刻又转化为担忧。

“还没有休息吗?今天是不是很累?”来不及回应陆沉的祝词,此刻你只想让陆沉躺下休息。但这时你才开始观察他身影以外的背景,还有那些嘈杂的人声,行李的碰撞声,还有空姐的欢迎语。

“你在飞机上?又要赶去下一个地方开会吧,辛苦你了。”陆沉盯着你被昏黄灯光照亮的脸,想象出你趴在床头和他视频的样子。陆沉想,你这时肯定已经洗完了澡,皮肤摸起来柔滑而细腻,应该还残留些沐浴露的香气。你的头发软软地垂落在耳边,如果这时从背后拥抱你,可以将自己的脸深深埋进你的脖颈,那是比商务舱柔软温馨无数倍的家乡。

“没错,现在要赶去一个很重要的地方。”还是不告诉她了吧,人们都喜欢惊喜,尤其是你。陆沉构想着,如果在你睡醒之前就赶到你身边,当你清晨睁开眼的时候,应该会惊得跳起来,再用力抱紧自己的肩膀,用柔软的脸颊蹭蹭自己的脸。那会是这些天的劳累之后,最好的褒奖。

“好吧……那你要好好睡一觉,一定要注意安全。”如果我能在你身边就好了,我能在你身边的话,或许你就可以短暂安睡。你彻底悟晰到,为什么人们大多不希望异地。

这种隔着手机屏幕,只能用言语表达关心与爱意的无力感,会时刻敲打着你的内疚。文字是有力量的,可是无法化为力量的文字,也不过是横折撇捺的搭建。除了向对面发出一声虚无缥缈的呐喊之外,只能收获微弱模糊的回音。

挂断电话后,你将手机甩远,不再面对被你设置成壁纸的约会行程。你埋进陆沉那一侧的被子,大口呼吸着微弱残存的他的气息。还不够,你又翻出陆沉的衬衫,揉成一团再狠狠埋进去。

好想念他。似乎周围的空气都化作冰冷的海水,而衬衫上的气息是你唯一仅存的氧气罐。思念是海水,陆沉是你的救生舰。你在等待陆沉从激流的航程中退返,将你从思念的裹挟中捞起。

其实这样的异地并不罕见,或者说,在你们之间,这应该算是家常便饭了。可是这不一样。没有谁不期待在纪念日时可以和爱人紧紧相拥。早在几周前,你已经开始构思各种计划,希望陆沉可以在那一天不用顾虑任何事情。然而现在,陆沉此刻在飞机上,你在陆沉的衬衫里。

应该责怪命运还是应该责怪运气,你不清楚,只觉得上帝应该是个刻薄又固执的老人,将你的期待全部撕碎,再留你一个人静立在碎片的雨里,忧虑,愤怒,无所适从。

好想念他。你突然感觉衬衫变得有些潮湿,原来是自己呼出的蒸气。嗯,一定是自己呼出的蒸汽,陆沉又不是不会回来,有什么好哭的呢,这就是蒸汽。这么想着,慢慢地,眼前的黑暗逐渐扩大,将你包裹起来,直至你完全置身其中。你睡着了。

心疼。这是陆沉轻悄悄走进卧室后,看清房间内容的第一反应。自己的衬衫被你围在身边,最常穿的那一件被你紧紧攥在手里。你蜷缩得小小的,睡在自己常待的那一侧,昏黄的床头灯照映着你蹙起的眉毛。看来你睡得并不安稳。

陆沉去另一个房间里,将自己一身的风尘和薄雾洗去,再返回昏黄的房间。

你似乎感觉到一些床垫的塌陷,随后隐隐闻到陆沉的味道。是他的衣服吧,你迷迷糊糊地想。但当你转身触碰到一个温热的身躯时,便从混沌中惊起。

是陆沉?你不可思议地紧盯着撑起头,垂眼朝你微笑的男人。昏黄的灯光平铺在他脸上,看起来温暖而祥和,仿佛他置身于黄昏。“陆沉?”你的声音还带着惊醒的沙哑,伸手触碰到他的脸,你的手指甚至有些颤抖。

“是陆沉。”你和陆沉的声音交织响起。陆沉似乎预判到你的动作,在你搂上他脖颈的那一刻,他的手臂便缠绕上你的后背,将你紧紧贴在他的胸膛上。

你感受到陆沉的心跳从胸腔传至自己的耳膜,再通往你的眼睛,一声一声,击打着泪腺。你的思念从海水变为黄昏。陆沉终于将你从思念中捞起,而你大口呼吸着陆沉,那件衬衫早被遗留在海水当中了。

房间内,是一个寂静的黄昏。你和陆沉没有说话,也无需说话,贪婪地享受这静谧安详的时刻,共同期待黎明的到来。

#活着不易:威胁生命的因素又多了一个#
天文学家们研究发现,对像地球这样孕育了生命的行星来说,宇宙威胁又多了一个:来自爆炸恒星的强烈X射线可以影响100光年以外的行星。这一结果对研究系外行星及其宜居性具有重要意义。
当恒星爆炸时,它会产生大量的X射线。X射线将在爆炸后数月至数年内到达一颗类似地球的行星(如图中左下角所示),这一过程可能持续几十年。如此强烈的辐射可能会导致星球上的生物灭绝。
新研究观测了31颗超新星及其余波的X射线,结果显示,距离爆炸恒星160光年远的行星都可能受到致命剂量的辐射。
当X射线的“洪流”扫过行星,随之而来的辐射可能会严重改变星球上的大气化学。对于一颗类地球行星来说,这可能会消灭相当一部分臭氧,而臭氧正是保护生命免受其宿主星危险紫外线辐射的大功臣。辐射还可能导致生物的消亡,特别是食物链“塔基”海洋生物的消亡,从而导致生物灭绝。
经过多年致命X射线的照射,以及宿主星紫外线辐射的影响,这颗行星还可能会产生大量的二氧化氮,导致大气中出现褐色雾霾,进而威胁着植物生存,侵蚀着陆地上的苍茫绿色。
尽管就潜在的超新星爆发而言,地球和太阳系目前还处于一个安全的空间,但银河系中的许多其他行星却没有那么幸运。这项新研究有效地缩小了银河宜居带的范围,并再次告诉我们生命多么来之不易。相关研究已发表在The Astrophysical Journal上。
图片来自NASA/CXC/Univ. of Illinois/I. Brunton et al。
来源:https://t.cn/A6pzb7wb
图源:https://t.cn/A6pzb7wq


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