#BioArt分享# #科学抗击疫情# #COVID-19# 【SARS-CoV-2 furin位点侧面的缺失突变】2020年4月2日,广东省CDC在bioRxiv上上传了一篇研究,发现SARS-CoV-2 furin位点侧面的缺失突变很普遍。此前英国布里斯托曾发现了SARS-CoV-2 furin位点的缺失突变株 。本研究中作者在68个临床样本中的3个和22个体外分离的毒株中的一半发现了furin位点侧面的缺失突变,作者认为侧面QTQTN的缺失可能有利于SARS-CoV-2的复制和感染因而被纯化选择留了下来,感染机制可能发生改变,更详细的阐述需要进一步研究。该结果为S蛋白的研究和病毒的进化以及疫苗的研发提供了宝贵的的线索。https://t.cn/A6ZRwWiZ
【河北工大研究团队科研抗疫:“诱捕”病毒,阻断“新冠”感染】“对抗‘新冠’,除了疫苗,我们还可以通过研发药物分子,占据病毒与宿主细胞结合位点,制备纳米粒子‘诱捕’病毒,双管齐下阻断病毒感染细胞过程,降低病毒对人体的危害。”河北工业大学生物物理研究所所长安海龙介绍。
新冠疫情发生以来,世界各国科研人员都在争分夺秒,与病毒赛跑,加快新型疫苗研制进程,加紧不同防治方法的研究。安海龙教授团队迅速反应,基于多年从事细胞膜蛋白靶标创新药物研发积累的经验,与美国、加拿大科研团队和国内中吉智药组成联合攻关团队,开展新冠疫情的防治工作。目前该团队已从中药有效成分中发现以新冠病毒Spike蛋白和人体宿主细胞ACE2蛋白为作用靶点的药物分子,并开始制备细胞膜纳米粒子,模拟细胞“诱捕”病毒,实现阻断病毒与靶细胞结合的双效合一,达到最大限度高效杀灭病毒的目的。
“疫苗主要针对一种或几种类型病毒有效免疫,如果病毒变异,疫苗的作用就很难发挥。”安海龙说,该团队的研究分两个方向:一是给健康细胞穿一层“防护服”,病毒来了,找不到感染的缝隙;一是给健康细胞穿一层“防护服”,病毒来了,找不到感染的缝隙;二是给健康细胞准备好“替身”,诱导病毒结合后,被人体自行清除,“双管齐下,事半功倍,即便病毒变异,只要感染模式不变,我们的方法就会一直有效。”
“作为一种全新的病毒,人们对新冠病毒几乎一无所知,对人体感染病毒后产生的应激反应更是知之甚少。”团队成员屈畅博士说,我们与加拿大维多利亚大学张学奎博士合作采用生物信息学的手段,基于新冠病毒同家族SARS和MERS病毒感染转录组测序结果,进行数据挖掘和整理,发现数百个基因在病毒感染以后会出现异常表达现象,个别离子通道也出现差异性,这对我们找到表达新的药物靶点,提出新的诊疗方案非常重要。
“这两个月,我们一直聚焦病毒感染人体和复制过程,基于中药天然化合物进行新冠病毒药物研发。”团队核心成员陈娅斐博士说,考虑到新冠病毒感染人体的前提是病毒S蛋白和人体ACE2两种膜蛋白的相互识别,团队将成熟的膜蛋白药物筛选平台用于新冠病毒创新药物研发。与美国乔治华盛顿大学曾辰教授联合开展研究,通过筛选可以特异性结合病毒S蛋白或细胞ACE2蛋白的中药天然化合物、制备肺上皮细胞膜包裹的纳米粒子两种手段,尝试阻断病毒与宿主细胞的相互识别过程,进而降低病毒感染人体的可能性。目前,已经完成S蛋白和ACE2蛋白的建模和对中药有效成分的虚拟筛选工作,发现20种候选药物分子,进一步抗病毒活性实验正在检测过程中。
除此以外,团队还采用重组慢病毒和转基因动物模型,建立了细胞和动物新冠病毒药效服务平台。考虑到新冠病毒的高致病性和致命性,团队联合中吉智药(北京)有限公司,在细胞和实验动物两个层面,开发服务于第三方的模拟新冠病毒的抗病毒药物药效评价系统,从启动子、密码子和furin序列三个方向进行优化,提高新冠病毒全长S蛋白高水平表达。“该系统建立后,没有P3实验室的研究团队,也可通过虚拟病毒感染过程,实验验证理论成果的有效性。”团队成员付静璇博士说。
“团队目前在加快研发进程,药物研制成功后,还需启动临床实验。”安海龙说。(记者 姜凝)
新冠疫情发生以来,世界各国科研人员都在争分夺秒,与病毒赛跑,加快新型疫苗研制进程,加紧不同防治方法的研究。安海龙教授团队迅速反应,基于多年从事细胞膜蛋白靶标创新药物研发积累的经验,与美国、加拿大科研团队和国内中吉智药组成联合攻关团队,开展新冠疫情的防治工作。目前该团队已从中药有效成分中发现以新冠病毒Spike蛋白和人体宿主细胞ACE2蛋白为作用靶点的药物分子,并开始制备细胞膜纳米粒子,模拟细胞“诱捕”病毒,实现阻断病毒与靶细胞结合的双效合一,达到最大限度高效杀灭病毒的目的。
“疫苗主要针对一种或几种类型病毒有效免疫,如果病毒变异,疫苗的作用就很难发挥。”安海龙说,该团队的研究分两个方向:一是给健康细胞穿一层“防护服”,病毒来了,找不到感染的缝隙;一是给健康细胞穿一层“防护服”,病毒来了,找不到感染的缝隙;二是给健康细胞准备好“替身”,诱导病毒结合后,被人体自行清除,“双管齐下,事半功倍,即便病毒变异,只要感染模式不变,我们的方法就会一直有效。”
“作为一种全新的病毒,人们对新冠病毒几乎一无所知,对人体感染病毒后产生的应激反应更是知之甚少。”团队成员屈畅博士说,我们与加拿大维多利亚大学张学奎博士合作采用生物信息学的手段,基于新冠病毒同家族SARS和MERS病毒感染转录组测序结果,进行数据挖掘和整理,发现数百个基因在病毒感染以后会出现异常表达现象,个别离子通道也出现差异性,这对我们找到表达新的药物靶点,提出新的诊疗方案非常重要。
“这两个月,我们一直聚焦病毒感染人体和复制过程,基于中药天然化合物进行新冠病毒药物研发。”团队核心成员陈娅斐博士说,考虑到新冠病毒感染人体的前提是病毒S蛋白和人体ACE2两种膜蛋白的相互识别,团队将成熟的膜蛋白药物筛选平台用于新冠病毒创新药物研发。与美国乔治华盛顿大学曾辰教授联合开展研究,通过筛选可以特异性结合病毒S蛋白或细胞ACE2蛋白的中药天然化合物、制备肺上皮细胞膜包裹的纳米粒子两种手段,尝试阻断病毒与宿主细胞的相互识别过程,进而降低病毒感染人体的可能性。目前,已经完成S蛋白和ACE2蛋白的建模和对中药有效成分的虚拟筛选工作,发现20种候选药物分子,进一步抗病毒活性实验正在检测过程中。
除此以外,团队还采用重组慢病毒和转基因动物模型,建立了细胞和动物新冠病毒药效服务平台。考虑到新冠病毒的高致病性和致命性,团队联合中吉智药(北京)有限公司,在细胞和实验动物两个层面,开发服务于第三方的模拟新冠病毒的抗病毒药物药效评价系统,从启动子、密码子和furin序列三个方向进行优化,提高新冠病毒全长S蛋白高水平表达。“该系统建立后,没有P3实验室的研究团队,也可通过虚拟病毒感染过程,实验验证理论成果的有效性。”团队成员付静璇博士说。
“团队目前在加快研发进程,药物研制成功后,还需启动临床实验。”安海龙说。(记者 姜凝)
#bioart分享# #COVID-19# #科学抗击疫情# 【布里斯托的SARS-CoV-2毒株S蛋白的类Furin位点发生缺失突变】2020年3月24日,布里斯托大学在bioRxiv上上传了一篇研究,研究使用牛津纳米孔MinION进行直接RNA测序识别在Vero E6细胞中生长的SARS-CoV-2转录本,使用最近开发的以ORF为中心的管道分析,揭示了病毒转录的模式。在编码S蛋白的亚基因组mRNA中检测到24 nt的删除。这一现象在超过一半的基因图谱中被识别,可能导致Furin位点的移除。Furin位点在病毒进入细胞的过程中对 S 蛋白的裂解起重要作用,而S蛋白的裂解是人畜共患病冠状病毒传播的障碍,影响病毒致病性。结合串联质谱仪分析,鉴定了500多个病毒肽和44个磷脂肽,几乎覆盖了SARS-CoV-2基因组预测编码的所有蛋白质,包括被删除的基因组特有的S蛋白变体。在S蛋白的Furin位点发现明显的缺失。鉴于对S蛋白是潜在的主要疫苗靶点,以及Furin位点可能对这种病毒的发病机制和人畜共患病具有作用,本研究的发现具有明显的意义。病毒基因组序列应在病毒种群的生长过程中仔细监测,有利于动物模型的研究,另外这种变化也可能会导致不同程度的毒性、发病率和死亡率。https://t.cn/A6ZhJa1s
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