[测焦] PANGOLin的7月更新 (5/?)
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XBB家族(22F “狮鹫/Gryphon”)
XBB.1系列 “骏鹰/Hippogryph”
XBB.1.17.1的ORF1b:V2236I(G20173A)分支上，得到阶位S:K356T(A22629C)附带ORF1a:N1080D(A3503G), ORF1a:S2553F(C7923T)的分支被命名为GA.4(XBB.1.17.1.4)，可能源自尼日利亚，正在欧美扩散；同一分支上的nt:T23797C子分支被命名为GA.5(XBB.1.17.1.5)，主要来自欧洲；同一分支上的ORF1a:I2138V(A6677G), nt:G8785A子分支被命名为GA.6(XBB.1.17.1.6)，可能源自加纳，在欧洲扩散，后续获得热门趋同S:T478R(C22995G)附带ORF10:Q29*(C29642T), nt:A19767G的分支被命名为GA.6.1，主要来自大漂亮。
XBB.1.28.1的ORF1a:D2627N(G8144A), nt:C8140T, nt:T8141C, nt:A29320G分支被命名为FW.3(XBB.1.28.1.3)，主要来自俄罗斯和印尼。
XBB.1.42的nt:C6040T, nt:G9049A分支被定义为XBB.1.42.2，疑似田园株；后继获得趋同S:E583D(G23311C)以及nt:C2143T的分支被命名为HL.1(XBB.1.42.2.1)，主要来自加麻大。获得S:S929N(G24348A)附带ORF1a:P1950H(C6114A)的分支被命名为HL.2(XBB.1.42.2.2)，船新的田园株。
XBB.1.9系列 “土卫七/Hyperion”
FL.2.3(XBB.1.9.1.2.3)得到阶位S:K356T(A22629C)附带nt:A11188G, nt:C27128T的分支被命名为FL.2.3.1，船新的田园株，由于广东两个月没传测序，不知道该毒株的具体扩散情况。
FL.13(XBB.1.9.1.13)的nt:T19110C分支被命名为FL.13.3，后继获得ORF1a:M902V(A2969G), S:E154Q(G22022C)的分支被命名为FL.13.3.1，主要来自带嘤。
EG.5.1(XBB.1.9.2.5.1)的ORF1b:V1644I(G18397A)分支被命名为EG.5.1.2，主要来自小日子，香港有测序记录；ORF1a:R542C(C1889T), nt:C22570T分支被命名为EG.5.1.3，主要来自大漂亮；ORF1b:K2557R(A21137G)分支被命名为EG.5.1.4，国内有测序记录；ORF1a:L3293I(C10142A), ORF1b:T1274I(C17288T), ORF1b:L2349V(T20512G), nt:G199A, nt:C29870A小型跃迁分支被命名为EG.5.1.5，主要来自伊比利亚半岛；携带趋同突变S:F157L(C22033A)以及ORF1a:S1857L(C5835T)的分支被命名为EG.5.1.6，主要来自大漂亮。
田园株、现任毒王EG.5.1.1的S:G257V(G22332T)分支被命名为HK.1(EG.5.1.1.1)。说起来在欧洲流行的XBB.1.5.26的分支被命名为EU.1，在带嘤流行的XBB.1.5.46的分支被命名为GB.1，一定都是巧合啦；携带S:Q14H(G21604T)的分支被命名为HK.2(EG.5.1.1.2)；携带版本答案之一S:L455F(G22927T)的分支被命名为HK.3(EG.5.1.1.3)，成为又一款具备S:L455F与S:F456L强力组合的毒株；携带趋同S:T883I(C24210T)的分支被命名为HK.4(EG.5.1.1.4)；携带FCS邻近区段S:Q677H(G23593C)的分支被命名为HK.5(EG.5.1.1.5)。看到这些刚被命名的分支大概就能意识到为什么EG.5.1.1势头这么猛了，本身就强力的同时，后继分支抓到的都还是版本热门的强力增幅。
XBB.1.22系列 '参宿五/Bellatrix'
FY.2(XBB.1.22.1.2)改变了FCS的S:A684V(C23613T)，附带ORF1a:T1874I(C5886T), nt:A28699G的分支被命名为FY.2.1，主要来自东南亚，它的一个后续分支还获得了趋同S:A348S(G22604T)。
FY.4.1获得了趋同S:S704L(C23673T)的分支被命名为FY.4.1.1，源自肯尼亚，可能扩散到低测序密度地区，最近不时被机场抽检截获。
XBB.1.22.1的S:D228E(T22246G), S:G769A(G23868C), S:D1168E(C25066A), ORF3a:P42L(C25517T), nt:A8347G, nt:C11674T, nt:C24442T, nt:A25974G, nt:C27429T, nt:C28603T跃迁分支被命名为FY.7(XBB.1.22.1.7)，主要来自奥地利。
XBB.1.5家族 (23A “章鱼海怪/Kraken”)
nt:T17124C 分支
XBB.1.5.30的S:N481K(T23005A), ORF3a:L15F(G25437T), ORF7a:V74A(T27614C), nt:C17010T, nt:C24358A分支被命名为HM.1(XBB.1.5.30.1)，主要来自加麻大。自此H字头已经用掉一半了。
GN.1(XBB.1.5.73.1)被拆分，XBB.1.5.73的ORF1a:T3356I(C10332T), ORF3a:G18V(G25445T), nt:C7834T分支下的S:F456L(T22928C)被分割出来作为GN.1的定义。同一分支下的ORF3a:A99G(C25688G)被定义为GN.2(XBB.1.5.73.2)，主要来自秘鲁与加麻大。
GN.1(XBB.1.5.73.1)下的ORF1b:A1643V(C18395T)被定义为GN.1.1，秘鲁特产。
XBB.1.5.73的nt:C27143T分支被定义为GN.3(XBB.1.5.73.3)，秘鲁特产；ORF1a:Q3966L(A12162T)分支被命名为GN.4(XBB.1.5.73.4)，主要来自美洲；ORF1a:L1110I(C3593A), ORF1a:S4135F(C12669T)分支被命名为GN.5(XBB.1.5.73.5)，主要来自秘鲁与加麻大。
HD.1(XBB.1.5.93.1)得到阶位S:K356T(A22629C)的分支被命名为HD.1.1，来自多米尼加共和国。
nt:T17124C 分支的 nt:T10204C 子分支
FT.1(XBB.1.5.39.1)进行拆分，在XBB.1.5.39的ORF1a:S538L(C1878T)分支上，获得S:I197V(A22151G)的为拆分后的FT.1；同一分支上获得S:K1045N(G24697T), nt:A21390G的被命名为FT.2(XBB.1.5.39.2)，主要来自大漂亮。
XBB.1.5.39得到热门趋同S:Q52H(G21718T)的分支被命名为FT.3(XBB.1.5.39.3)；后续获得热门趋同S:T478R(C22995G)附带S:D1168H(G25064C), nt:C6628T, nt:A18366G的分支被命名为FT.3.1，该分支还有继续获得趋同S:A348S(G22604T)的后代，也是一个连续抓到版本答案的赌怪，主要来自北美。
XBB.1.5.39得到S:E180Q(G22100C)的分支被命名为FT.4(XBB.1.5.39.4)，与XBB.1.16携带的减益S:E180V(A22101T)不同，S:E180Q在XBB.1.5的骨架上，按照Bloom与Neher老师的预计能略微提升适应性。主要来自杈国。
XBB.1.16家族 23B '大角星/Arcturus'
XBB.1.16得到趋同S:E554K(G23222A)的分支被命名为XBB.1.16.17，源自印度，在纽村扩散。说起来印度最近公开的测序不多，在INSACOG上看到的毒株分布状况，BA.2*又开始回潮了，不知这是测序质量不行呢，还是又养出蛊了。
本期附赠XBB.1.9家族种子选手图谱。其中FL.2.3.1、FL.2.4、FL.4.2、FL.13.1、FL.13.2、FL.16、EG.4.2、EG.5.1.1、HK.1、HK.2、HK.3、HK.4、HK.5都是田园株，大部分都在天梯榜的前列。
#AnythingButCovid##新冠变种扩散跟踪##CovidDiversity##好日子在后头呢#
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XBB家族(22F “狮鹫/Gryphon”)
XBB.1系列 “骏鹰/Hippogryph”
XBB.1.17.1的ORF1b:V2236I(G20173A)分支上，得到阶位S:K356T(A22629C)附带ORF1a:N1080D(A3503G), ORF1a:S2553F(C7923T)的分支被命名为GA.4(XBB.1.17.1.4)，可能源自尼日利亚，正在欧美扩散；同一分支上的nt:T23797C子分支被命名为GA.5(XBB.1.17.1.5)，主要来自欧洲；同一分支上的ORF1a:I2138V(A6677G), nt:G8785A子分支被命名为GA.6(XBB.1.17.1.6)，可能源自加纳，在欧洲扩散，后续获得热门趋同S:T478R(C22995G)附带ORF10:Q29*(C29642T), nt:A19767G的分支被命名为GA.6.1，主要来自大漂亮。
XBB.1.28.1的ORF1a:D2627N(G8144A), nt:C8140T, nt:T8141C, nt:A29320G分支被命名为FW.3(XBB.1.28.1.3)，主要来自俄罗斯和印尼。
XBB.1.42的nt:C6040T, nt:G9049A分支被定义为XBB.1.42.2，疑似田园株；后继获得趋同S:E583D(G23311C)以及nt:C2143T的分支被命名为HL.1(XBB.1.42.2.1)，主要来自加麻大。获得S:S929N(G24348A)附带ORF1a:P1950H(C6114A)的分支被命名为HL.2(XBB.1.42.2.2)，船新的田园株。
XBB.1.9系列 “土卫七/Hyperion”
FL.2.3(XBB.1.9.1.2.3)得到阶位S:K356T(A22629C)附带nt:A11188G, nt:C27128T的分支被命名为FL.2.3.1，船新的田园株，由于广东两个月没传测序，不知道该毒株的具体扩散情况。
FL.13(XBB.1.9.1.13)的nt:T19110C分支被命名为FL.13.3，后继获得ORF1a:M902V(A2969G), S:E154Q(G22022C)的分支被命名为FL.13.3.1，主要来自带嘤。
EG.5.1(XBB.1.9.2.5.1)的ORF1b:V1644I(G18397A)分支被命名为EG.5.1.2，主要来自小日子，香港有测序记录；ORF1a:R542C(C1889T), nt:C22570T分支被命名为EG.5.1.3，主要来自大漂亮；ORF1b:K2557R(A21137G)分支被命名为EG.5.1.4，国内有测序记录；ORF1a:L3293I(C10142A), ORF1b:T1274I(C17288T), ORF1b:L2349V(T20512G), nt:G199A, nt:C29870A小型跃迁分支被命名为EG.5.1.5，主要来自伊比利亚半岛；携带趋同突变S:F157L(C22033A)以及ORF1a:S1857L(C5835T)的分支被命名为EG.5.1.6，主要来自大漂亮。
田园株、现任毒王EG.5.1.1的S:G257V(G22332T)分支被命名为HK.1(EG.5.1.1.1)。说起来在欧洲流行的XBB.1.5.26的分支被命名为EU.1，在带嘤流行的XBB.1.5.46的分支被命名为GB.1，一定都是巧合啦；携带S:Q14H(G21604T)的分支被命名为HK.2(EG.5.1.1.2)；携带版本答案之一S:L455F(G22927T)的分支被命名为HK.3(EG.5.1.1.3)，成为又一款具备S:L455F与S:F456L强力组合的毒株；携带趋同S:T883I(C24210T)的分支被命名为HK.4(EG.5.1.1.4)；携带FCS邻近区段S:Q677H(G23593C)的分支被命名为HK.5(EG.5.1.1.5)。看到这些刚被命名的分支大概就能意识到为什么EG.5.1.1势头这么猛了，本身就强力的同时，后继分支抓到的都还是版本热门的强力增幅。
XBB.1.22系列 '参宿五/Bellatrix'
FY.2(XBB.1.22.1.2)改变了FCS的S:A684V(C23613T)，附带ORF1a:T1874I(C5886T), nt:A28699G的分支被命名为FY.2.1，主要来自东南亚，它的一个后续分支还获得了趋同S:A348S(G22604T)。
FY.4.1获得了趋同S:S704L(C23673T)的分支被命名为FY.4.1.1，源自肯尼亚，可能扩散到低测序密度地区，最近不时被机场抽检截获。
XBB.1.22.1的S:D228E(T22246G), S:G769A(G23868C), S:D1168E(C25066A), ORF3a:P42L(C25517T), nt:A8347G, nt:C11674T, nt:C24442T, nt:A25974G, nt:C27429T, nt:C28603T跃迁分支被命名为FY.7(XBB.1.22.1.7)，主要来自奥地利。
XBB.1.5家族 (23A “章鱼海怪/Kraken”)
nt:T17124C 分支
XBB.1.5.30的S:N481K(T23005A), ORF3a:L15F(G25437T), ORF7a:V74A(T27614C), nt:C17010T, nt:C24358A分支被命名为HM.1(XBB.1.5.30.1)，主要来自加麻大。自此H字头已经用掉一半了。
GN.1(XBB.1.5.73.1)被拆分，XBB.1.5.73的ORF1a:T3356I(C10332T), ORF3a:G18V(G25445T), nt:C7834T分支下的S:F456L(T22928C)被分割出来作为GN.1的定义。同一分支下的ORF3a:A99G(C25688G)被定义为GN.2(XBB.1.5.73.2)，主要来自秘鲁与加麻大。
GN.1(XBB.1.5.73.1)下的ORF1b:A1643V(C18395T)被定义为GN.1.1，秘鲁特产。
XBB.1.5.73的nt:C27143T分支被定义为GN.3(XBB.1.5.73.3)，秘鲁特产；ORF1a:Q3966L(A12162T)分支被命名为GN.4(XBB.1.5.73.4)，主要来自美洲；ORF1a:L1110I(C3593A), ORF1a:S4135F(C12669T)分支被命名为GN.5(XBB.1.5.73.5)，主要来自秘鲁与加麻大。
HD.1(XBB.1.5.93.1)得到阶位S:K356T(A22629C)的分支被命名为HD.1.1，来自多米尼加共和国。
nt:T17124C 分支的 nt:T10204C 子分支
FT.1(XBB.1.5.39.1)进行拆分，在XBB.1.5.39的ORF1a:S538L(C1878T)分支上，获得S:I197V(A22151G)的为拆分后的FT.1；同一分支上获得S:K1045N(G24697T), nt:A21390G的被命名为FT.2(XBB.1.5.39.2)，主要来自大漂亮。
XBB.1.5.39得到热门趋同S:Q52H(G21718T)的分支被命名为FT.3(XBB.1.5.39.3)；后续获得热门趋同S:T478R(C22995G)附带S:D1168H(G25064C), nt:C6628T, nt:A18366G的分支被命名为FT.3.1，该分支还有继续获得趋同S:A348S(G22604T)的后代，也是一个连续抓到版本答案的赌怪，主要来自北美。
XBB.1.5.39得到S:E180Q(G22100C)的分支被命名为FT.4(XBB.1.5.39.4)，与XBB.1.16携带的减益S:E180V(A22101T)不同，S:E180Q在XBB.1.5的骨架上，按照Bloom与Neher老师的预计能略微提升适应性。主要来自杈国。
XBB.1.16家族 23B '大角星/Arcturus'
XBB.1.16得到趋同S:E554K(G23222A)的分支被命名为XBB.1.16.17，源自印度，在纽村扩散。说起来印度最近公开的测序不多，在INSACOG上看到的毒株分布状况，BA.2*又开始回潮了，不知这是测序质量不行呢，还是又养出蛊了。
本期附赠XBB.1.9家族种子选手图谱。其中FL.2.3.1、FL.2.4、FL.4.2、FL.13.1、FL.13.2、FL.16、EG.4.2、EG.5.1.1、HK.1、HK.2、HK.3、HK.4、HK.5都是田园株，大部分都在天梯榜的前列。
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查理斯和FY、皮鞋连麦解说利雅得大师赛的时候，FY展示逆天记忆力，弹幕狂呼TI8波高决策者找到了：
天命：LGD2:0OG，EG2:0碾压9Pandas。
查猪：啊？EG这么猛吗？
天命：还好被我们偷袭了呀。
查猪：不能是我们上来把他们打晕了吗？
天命：人家不是食物中毒吗？
查猪：那是身体不行，那还是他自己的问题。不是，你不会不知道我们18年LGD打那个长沙MDL，我们那个小组赛打完之后我肚子就没好过了吧。
天命：肠胃这么差吗？
皮鞋：你比赛打不好怪肠胃你个B。
查猪：那个比赛我们冠军啊，什么打不好？你在说什么B话？
皮鞋：那跟肠胃有什么关系呢你打不好？
查猪：娃少带我们出去吃什么长沙本地什么那种路边摊，说什么最地道的味道，我吃了个什么鱿鱼粉，我吃完回去无限喷，然后第二天整个人直接瘫痪了，无限喷射。
查猪：然后我们还是败者组我靠，我们要从败者组打上去，要打什么七轮还是八轮，然后我每天只喝一碗粥，除了躺在那边就是在上面打，要么就是在厕所。我跟个尸体一样，我踏马整天躺在那边。
Fy：我怎么记得是在上海打的那个比赛啊。
查猪：哎呀，徐林森的记忆是这样的，别人的比赛名字都叫长沙MDL Major了，你给我来一句在上海打的。上海那个是DAC，兄弟，我们拿的是亚军。
Fy：被那个三冰干了是吧？
查猪：对啊，那71在那边做俯卧撑啊。哎，没事，森哥你这个记忆力可以理解。你在LGD的时候，还有在上海夺过冠的比赛吗？
天命：你们LGD不是夺了很多冠吗？
查猪：额...没有很多，就两个。森哥的记忆力可能真的有问题吧。
Fy：可能是个小比赛吧，打EHOME的那个小比赛吧可能。
查猪：你说的是你在LGD的时候打过的比赛吗？
Fy：你也在啊，哦，我在小象，不好意思。
查猪：肯定没有我啊。
Fy：你在RNG是吧？
查猪：不是，我在EHOME，兄弟。森哥，你这个记忆力吃点核桃吧，真的。
Fy：没有，我们打的EHOME呀。
查猪：不是，你在小象，我怎么可能在RNG啊？你吃点核桃吧，森哥！
皮鞋：森哥说实话，记忆力真的很差好吧。
查猪：森哥记忆力差就算了，还整天造谣。你记错了也不怪你，森哥。
Fy：打的决赛有点多，老是忘。不是，四号位都是这样的，兄弟。你要打好四号位，四号位就要想很多事情，然后就会遗忘很多事情。
天命：森哥你真的想了很多事情吗？
查猪：那你为什么打起来不说话森哥。
Fy：我打起来怎么不说话了？
查猪：国土说你不说话呀。
Fy：你说亚运会吗？是这样的，你知道吗......
查猪：应该是不能细说的，你不用说亚运会呀，你平时打的时候话也不多呀森哥。
Fy：平时我话不是最多的吗？你在说什么啊？
天命：你话是最多的吗？
查猪：你话是最多的吗？不可思议！森哥，你是不是把你内心世界的那个想法给算进去了？
Fy：我只报关键信息，懂不？重要决策就我来下。
皮鞋：：哈哈哈哈哈哈。
Fy：不是，皮鞋你在笑什么啊？你打起来就跟个SB一样。我是三国诸葛亮，你为什么有脸在笑啊？
皮鞋：别别别，森哥，我的问题！
Fy：皮鞋每次打完就捂个脸“这样打这样打不就行了吗？”、“你这个点往这里走，这个点往那里走”，打起来的时候B话听不见一句。打起来就说“完了，这里又有眼”。
皮鞋：森哥，就别说了好吧，能不能别扯以前好吧。
天命：这边有个弹幕说，波高的决策者找到了。重要决策，那个决策是很重要吧？
Fy：这是决策吗？
天命：不知道呀，这不是决策吗？那不是反打吗？
Fy：这是临场判断吧只能属于是，这并不是一个预谋策划的一波反打。
天命：LGD2:0OG，EG2:0碾压9Pandas。
查猪：啊？EG这么猛吗？
天命：还好被我们偷袭了呀。
查猪：不能是我们上来把他们打晕了吗？
天命：人家不是食物中毒吗？
查猪：那是身体不行，那还是他自己的问题。不是，你不会不知道我们18年LGD打那个长沙MDL，我们那个小组赛打完之后我肚子就没好过了吧。
天命：肠胃这么差吗？
皮鞋：你比赛打不好怪肠胃你个B。
查猪：那个比赛我们冠军啊，什么打不好？你在说什么B话？
皮鞋：那跟肠胃有什么关系呢你打不好？
查猪：娃少带我们出去吃什么长沙本地什么那种路边摊，说什么最地道的味道，我吃了个什么鱿鱼粉，我吃完回去无限喷，然后第二天整个人直接瘫痪了，无限喷射。
查猪：然后我们还是败者组我靠，我们要从败者组打上去，要打什么七轮还是八轮，然后我每天只喝一碗粥，除了躺在那边就是在上面打，要么就是在厕所。我跟个尸体一样，我踏马整天躺在那边。
Fy：我怎么记得是在上海打的那个比赛啊。
查猪：哎呀，徐林森的记忆是这样的，别人的比赛名字都叫长沙MDL Major了，你给我来一句在上海打的。上海那个是DAC，兄弟，我们拿的是亚军。
Fy：被那个三冰干了是吧？
查猪：对啊，那71在那边做俯卧撑啊。哎，没事，森哥你这个记忆力可以理解。你在LGD的时候，还有在上海夺过冠的比赛吗？
天命：你们LGD不是夺了很多冠吗？
查猪：额...没有很多，就两个。森哥的记忆力可能真的有问题吧。
Fy：可能是个小比赛吧，打EHOME的那个小比赛吧可能。
查猪：你说的是你在LGD的时候打过的比赛吗？
Fy：你也在啊，哦，我在小象，不好意思。
查猪：肯定没有我啊。
Fy：你在RNG是吧？
查猪：不是，我在EHOME，兄弟。森哥，你这个记忆力吃点核桃吧，真的。
Fy：没有，我们打的EHOME呀。
查猪：不是，你在小象，我怎么可能在RNG啊？你吃点核桃吧，森哥！
皮鞋：森哥说实话，记忆力真的很差好吧。
查猪：森哥记忆力差就算了，还整天造谣。你记错了也不怪你，森哥。
Fy：打的决赛有点多，老是忘。不是，四号位都是这样的，兄弟。你要打好四号位，四号位就要想很多事情，然后就会遗忘很多事情。
天命：森哥你真的想了很多事情吗？
查猪：那你为什么打起来不说话森哥。
Fy：我打起来怎么不说话了？
查猪：国土说你不说话呀。
Fy：你说亚运会吗？是这样的，你知道吗......
查猪：应该是不能细说的，你不用说亚运会呀，你平时打的时候话也不多呀森哥。
Fy：平时我话不是最多的吗？你在说什么啊？
天命：你话是最多的吗？
查猪：你话是最多的吗？不可思议！森哥，你是不是把你内心世界的那个想法给算进去了？
Fy：我只报关键信息，懂不？重要决策就我来下。
皮鞋：：哈哈哈哈哈哈。
Fy：不是，皮鞋你在笑什么啊？你打起来就跟个SB一样。我是三国诸葛亮，你为什么有脸在笑啊？
皮鞋：别别别，森哥，我的问题！
Fy：皮鞋每次打完就捂个脸“这样打这样打不就行了吗？”、“你这个点往这里走，这个点往那里走”，打起来的时候B话听不见一句。打起来就说“完了，这里又有眼”。
皮鞋：森哥，就别说了好吧，能不能别扯以前好吧。
天命：这边有个弹幕说，波高的决策者找到了。重要决策，那个决策是很重要吧？
Fy：这是决策吗？
天命：不知道呀，这不是决策吗？那不是反打吗？
Fy：这是临场判断吧只能属于是，这并不是一个预谋策划的一波反打。
[测焦] 有一段时间没放天梯榜了，这次换一种方式，仿写一下巴塞尔变种报告，设置数档阶位，搞个回顾+预测。
最近全球不断减少的测序中不断冒出一些修炼已久的老妖怪，不过大多数看着吓人，实则难以在XBB的统治下翻出太大的浪花。如果将来出现类似O株改朝换代的事件，这些老妖怪们需要突破疫苗以及突破感染的免疫背景下的中和抗体，很可能需要在RBD上变得像O株，换句话说这里应该存在一个“基础阶位”。
这样的基础阶位应该包括K417N(G22813T)或K417T(A22812C, G22813T)，Q498R(A23055G)，N501Y(A23063T)，Y505H(T23075C)，D614G(A23403G)，H655Y(C23525T)，P681H(C23604A)或P681R(C23604G)，如今不知在哪里读条憋大招的老妖怪们，要想推翻O株的统治，这些基础阶位大概是不可或缺的，这些基础阶位能够增加稳定性、酶切效率、复制能力、传播力、hACE2受体结合亲合力、膜融合能力等。
图1 为曾经的毒王在基础阶位上的比较，近期偶尔冒出来的长期养蛊跃迁分支基本上都带有这些了。比如今天刚提交的一款AY.24的跃迁提名，具备与参照株140以上的差异(Divergence，综合突变、删除、插入等的数据，目前流行的分支与参照株的差异大约在90-110之间)。
图2 为这款德尔塔跃迁的具体变异参数，蓝色高亮为AY.24本身携带的突变，紫色下划线为在原有定义上该换的突变，粉色高亮为回复突变，橙色高亮为增加的与O株趋同的“基础阶位”，绿色高亮为其它已知的免疫逃逸增幅。可以看到这个长期养蛊弄出来的Delta跃迁已经具备了一定突破当前免疫背景的条件。
不过需要注意的是，与此前的版本不同，进入O株时代，此前已经摸透一些特性的单个突变造成的效果已经无法跟一些特定的组合相比，比如“基础阶位”上的498R+501Y，能够顶替681R的679K+681H，至今未能搞明白的371F+373P+375F，以及可能锁死了某些通路的764K+796Y+954H+969K等等。有的时候也不是纯粹堆积阶位就一定能成为毒王的，还要考虑适应性的问题。
接下来是O株之间的比较，可以说O株五兄贵各有个的绝活。当然O株的起源比较复杂，个人比较倾向于被测序抓到的这5个分支来自不同的养蛊+溢出/回溢+重组事件。
图3 为BA.1-BA.5的主要不同点，其中69-70删除为经典的S基因脱靶(SGTF)突变，376T比376A理论上受体结合亲合力更强，D405N、F486V、Q493R这几个突变都是通过牺牲受体结合亲合力换取免疫逃逸，G496S理论上是减益。
现在主流的毒株基本上是BA.2的后代以及重组，BA.2虽然在免疫逃逸、受体结合、复制效率、内生传染力、变异速率、膜融合能力等各项指标中都不是最突出的，但是(马后炮)它也是最没有明显短板的，大概也是能传播这么久的原因吧，虽然现在市面上的都是忒修斯的BA.2了。
随后便是BA.2基础上的十二天阶，这个大家应该很熟悉了。
图4 为仍在流行的毒株之间的天阶比对，增加一个具有显著免疫逃逸能力的非RBD位点144。
那么在当前XBB普遍流行的背景下，新的天阶逐渐显露出来，这将会是下一个版本可能出现的热门趋同演化的突变，此前也做过一定的分析了，以下预测主要参照曹老师和Bloom老师的相关论文。
图5 为XBB基础上的天阶，主流分支之间的比对，在RBD阶位的基础上增加一些通过Murrell老师统计学验证的增幅位点。在这些高阶的后代里，EG.5.1是第二款具有国际竞争力的田园株(第一款是FY.3)，也是目前的毒王，不过它的位置可能会受到FL.1.5.1的挑战。难以理解的是就算这样，XBB.1.9到现在为止都没有获得Nextstrain系统23C主枝的提升。此外GK.1、FE.1、FY.4.1等也需要注意。
现在这么多的阶位，刚加冕的毒王也就在XBB的基础上增加5-6阶的样子，谁都不知道这些阶位能不能够填满，填满了又会成什么样子，总之对于益生菌来说，都是机会。
#AnythingButCovid##新冠变种扩散跟踪##CovidDiversity##好日子在后头呢#
最近全球不断减少的测序中不断冒出一些修炼已久的老妖怪，不过大多数看着吓人，实则难以在XBB的统治下翻出太大的浪花。如果将来出现类似O株改朝换代的事件，这些老妖怪们需要突破疫苗以及突破感染的免疫背景下的中和抗体，很可能需要在RBD上变得像O株，换句话说这里应该存在一个“基础阶位”。
这样的基础阶位应该包括K417N(G22813T)或K417T(A22812C, G22813T)，Q498R(A23055G)，N501Y(A23063T)，Y505H(T23075C)，D614G(A23403G)，H655Y(C23525T)，P681H(C23604A)或P681R(C23604G)，如今不知在哪里读条憋大招的老妖怪们，要想推翻O株的统治，这些基础阶位大概是不可或缺的，这些基础阶位能够增加稳定性、酶切效率、复制能力、传播力、hACE2受体结合亲合力、膜融合能力等。
图1 为曾经的毒王在基础阶位上的比较，近期偶尔冒出来的长期养蛊跃迁分支基本上都带有这些了。比如今天刚提交的一款AY.24的跃迁提名，具备与参照株140以上的差异(Divergence，综合突变、删除、插入等的数据，目前流行的分支与参照株的差异大约在90-110之间)。
图2 为这款德尔塔跃迁的具体变异参数，蓝色高亮为AY.24本身携带的突变，紫色下划线为在原有定义上该换的突变，粉色高亮为回复突变，橙色高亮为增加的与O株趋同的“基础阶位”，绿色高亮为其它已知的免疫逃逸增幅。可以看到这个长期养蛊弄出来的Delta跃迁已经具备了一定突破当前免疫背景的条件。
不过需要注意的是，与此前的版本不同，进入O株时代，此前已经摸透一些特性的单个突变造成的效果已经无法跟一些特定的组合相比，比如“基础阶位”上的498R+501Y，能够顶替681R的679K+681H，至今未能搞明白的371F+373P+375F，以及可能锁死了某些通路的764K+796Y+954H+969K等等。有的时候也不是纯粹堆积阶位就一定能成为毒王的，还要考虑适应性的问题。
接下来是O株之间的比较，可以说O株五兄贵各有个的绝活。当然O株的起源比较复杂，个人比较倾向于被测序抓到的这5个分支来自不同的养蛊+溢出/回溢+重组事件。
图3 为BA.1-BA.5的主要不同点，其中69-70删除为经典的S基因脱靶(SGTF)突变，376T比376A理论上受体结合亲合力更强，D405N、F486V、Q493R这几个突变都是通过牺牲受体结合亲合力换取免疫逃逸，G496S理论上是减益。
现在主流的毒株基本上是BA.2的后代以及重组，BA.2虽然在免疫逃逸、受体结合、复制效率、内生传染力、变异速率、膜融合能力等各项指标中都不是最突出的，但是(马后炮)它也是最没有明显短板的，大概也是能传播这么久的原因吧，虽然现在市面上的都是忒修斯的BA.2了。
随后便是BA.2基础上的十二天阶，这个大家应该很熟悉了。
图4 为仍在流行的毒株之间的天阶比对，增加一个具有显著免疫逃逸能力的非RBD位点144。
那么在当前XBB普遍流行的背景下，新的天阶逐渐显露出来，这将会是下一个版本可能出现的热门趋同演化的突变，此前也做过一定的分析了，以下预测主要参照曹老师和Bloom老师的相关论文。
图5 为XBB基础上的天阶，主流分支之间的比对，在RBD阶位的基础上增加一些通过Murrell老师统计学验证的增幅位点。在这些高阶的后代里，EG.5.1是第二款具有国际竞争力的田园株(第一款是FY.3)，也是目前的毒王，不过它的位置可能会受到FL.1.5.1的挑战。难以理解的是就算这样，XBB.1.9到现在为止都没有获得Nextstrain系统23C主枝的提升。此外GK.1、FE.1、FY.4.1等也需要注意。
现在这么多的阶位，刚加冕的毒王也就在XBB的基础上增加5-6阶的样子，谁都不知道这些阶位能不能够填满，填满了又会成什么样子，总之对于益生菌来说，都是机会。
#AnythingButCovid##新冠变种扩散跟踪##CovidDiversity##好日子在后头呢#
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