【科研进展】白明研究组合作揭示远缘物种具有更相似表型和基因型不一定是因为趋同演化

  近日,中国科学院动物研究所白明研究组、浙江大学张国捷团队联合深圳华大生命科学研究院、中国科学院昆明动物研究所、哥本哈根大学等中外多个课题组,公布了对有袋类哺乳动物的物种辐射性大爆发过程的研究结果。该结果重建了有袋类物种的演化关系,并揭示了物种快速分化过程中,一些随机事件有可能会导致远缘物种具有相似表型的现象,解释了利用形态和分子数据在构建物种树经常出现冲突的发生机制。

  早在19世纪,达尔文就在他的旷世著作《物种起源》中提出现在地球上的所有物种最初都是从同一种原始生命演化而来,即共同祖先理论。由这个共同祖先不断分叉演化形成现在物种类群的历程即构成了生命之树,从简单的单细胞生物到复杂的生命体,每个物种都可以找到它的最近缘物种和最近共同祖先。以人类为例,人类约在700万年前与黑猩猩从共同祖先古猿分化形成,古猿类和旧世界猴在约2800万年前拥有相同的祖先,最早的灵长类物种祖先可以追溯至8000万年前,而目前地球上的哺乳动物在约两亿多年前都有共同祖先。重构正确的物种关系树是演化生物学研究和开展跨物种比较研究的基础,对我们推理各种生物学现象的起源过程至关重要。

  DNA是绝大多数生物的遗传蓝图,按照达尔文提出的物种演化模型,物种间DNA序列的差异可以反映出物种的分化历程,即DNA序列越相似的物种在生命之树上就更接近。同时,表型由DNA来决定,理论上携带相同表型的物种演化关系也就越接近。依据这样的推论,形态数据和DNA数据都可以用来构建物种树。但实际上,DNA数据与形态特征在推断物种演化历程上经常出现相互矛盾的结果。自80年代以来,利用DNA数据重构物种演化历程逐渐成为主流,但仍缺乏研究来解释为什么会存在这样的矛盾,为什么形态信息经常会得到不可靠的物种关系树。

  分子树和与形态树的矛盾经常发生在经历过物种快速分化的类群里。不完全的谱系分选(incomplete lineage sorting)就是一种可以导致上述情况出现的原因。多个物种在极短的时间内从一个共同祖先里分化出来,使得某些祖先基因的多态性在随后的物种分化历程中被随机分选到分化出的不同物种里,从而使得部分分化后形成的多个物种随机保留了相同的基因型。以人、黑猩猩和大猩猩为例。我们知道,相较于大猩猩,人与黑猩猩的亲缘关系更近。如图所示,三者共同祖先的群体具有较高的遗传多样性,大猩猩在第一次物种分化后形成,随着时间的推移,大猩猩的群体最终固定了蓝色的基因型。人和黑猩猩的共同祖先群体继承了橙色和蓝色两种基因型,然而在第二次物种分化的时候,人可能最终随机固定了和大猩猩一样的蓝色的基因型,黑猩猩最终随机固定了橙色的基因型。这样一来,我们就会观察到人的一些基因组序列跟大猩猩更相似,而跟黑猩猩差异更大。尽管黑猩猩是与人最近缘的物种,在人的基因组里约超过15%的基因组区域,是跟大猩猩更相似的。这种不完全的谱系分选现象在许多经历过物种大爆发的类群里均出现过,比如各种哺乳动物类群、鸟类、昆虫、鱼类等,但这种现象对性状的演化是否存在影响一直没有研究。

  为了研究不完全的谱系分选对物种形态和性状演化的影响,研究团队利用有袋类动物开展研究。之前的一些研究指出现存有袋类物种起源的过程经历了物种大爆发,导致了长期以来对有袋类物种早期演化关系存在争议。而这一争议主要围绕着南美有袋类微兽目(Microbiotheria)的演化地位。小山猴是该目唯一的现存物种,其作为南美洲的有袋类动物,却在骨骼、生殖器官和大脑结构等诸多方面与澳洲的有袋类动物更相似,尤其是袋鼠、考拉等双门齿目动物。正是由于这种形态的相似性,早前基于形态特征推定的演化关系认为小山猴应该和双门齿目的袋鼠和考拉更近缘,进而推测美洲小山猴应起源于澳洲。然而,本研究利用小山猴和其他有袋类动物的全基因组数据,表明小山猴应该是澳洲所有有袋类动物的姐妹群,也就是它和是澳洲有袋类有共同祖先但不属于澳洲有袋类。进一步的分析揭示,有袋类基因组有超过50%区域构建出的分子树跟真实的物种分化过程不一致,即小山猴反而跟某些澳洲有袋类之间的相似度要大于澳洲有袋类之间的相似度。早前观察的那些与真实物种发生过程不符的性状特征很可能是由于物种快速分化的过程不完全的谱系分选导致的。

  这些有冲突的基因组区域包含了上百个与神经系统、免疫系统、骨骼形态等相关的基因,它们可能与现今物种性状特征与物种发生历程之间的矛盾有关。研究推测,不完全的谱系分选所引发的祖先多态性的随机固定可能会偶然地导致两个亲缘关系较远的物种继承相同的祖先基因型,如果不同的祖先基因型会产生不同的形态特征,那么这样一来,就可能会导致远缘物种具有更加相似的表型。为了验证上述猜想,研究人员利用博物馆馆藏标本确定了小山猴的肱骨弯曲形态、脊柱棘突高度、门牙形态都是跟双门齿目的袋鼠和考拉更为相似。随后,研究团队再利用比较基因组学分析手段筛选候选基因,采用基因编辑技术对受不完全的谱系分选影响的基因建立小鼠实验模型。通过实验小鼠和野生小鼠的骨骼性状扫描结果的比较,研究人员证实了受不完全的谱系分选影响的基因型替换确实产生了符合预期的表型结果。

  物种性状的演化被认为是物种长期适应环境的结果:突变产生新的基因与新的性状,新基因通过繁殖扩散开来,有利于生存与繁殖的性状及其基因会被自然选择保留下来。在远缘物种中出现相同的性状,过去往往会用趋同演化来解释这样现象。然而,这一研究则揭示不同类群间相同性状的出现也可能是随机遗传了祖先性状引起的。同时,这一研究还证明,仅依靠部分基因、部分性状的溯源来构建物种关系树是不可靠的,全基因组数据才是重构物种发生历程的金标准。通过全基因组数据可以充分揭示不完全的谱系分选作为一种可能的机制来解释基因组物种树和表型变异之间冲突的现象。此外,本研究还综合了古气候地理,物种分化、形态、DNA等多方面证据来佐证有袋类物种演化进程。

  此外,近年来,测序技术的发展将基因组学研究带入了完美参考基因组的新时代。但本研究是基于二代测序技术的基因组完成的,这也提示我们不要过分追求新技术,而忽视了科学问题的重要性。

  该成果已于2022年4月20日以题目为“Incomplete lineage sorting and phenotypic evolution in marsupials”的论文在线发表于国际顶级学术期刊《细胞》(Cell)杂志,深圳华大生命科学研究院冯少鸿博士和中国科学院动物研究所白明研究员为论文共同第一作者,论文通讯作者张国捷教授近日以讲席教授身份加盟浙江大学医学院。冯少鸿博士现任浙江大学“百人计划”研究员。

  文章链接:
  https://t.cn/A66DMTtT

阅读原文:https://t.cn/A6X7FBSs

【64岁的王石为追求小30岁的田朴珺,炒掉了6个贴身秘书】
还表示他对田小姐的忠贞不二。当田朴珺想要买一辆200万豪车时,王石却死活不答应,只同意给她买辆20万的。但田朴珺太喜欢那款新车了,于是就用自己的钱,提回了那辆让她情有独钟的车。

2002年,因为外出拍广告,田朴珺逃了十天课,结果被中央戏剧学院勒令退学。后来,王晶拍摄《神勇铁金刚》时,让田朴珺去试戏,去之前明确告诉她:“只是让你试戏,至于能不能演上我的电影,就看你的能力了。”

成功选上后,她跟着王晶拍了一个多月,仅仅演了一个衣着清凉的龙套女,不过也学会了广东话。后来,田朴珺在陈可辛监制的《三更2之饺子》中,与梁家辉的那场至今看来都极其出位的戏,让她受到关注。但接连演了几部戏后,田朴珺的日子依然过得窘迫,连宫保鸡丁都吃不起,只能吃35港币一份的豆腐盖饭。

无奈,她只能进入地产行业寻求人生突破,在这个行业辛苦打拼6年后,田朴珺做出人生中最大的一个决定,去纽约电影学院镀金,恰恰是这个决定,让她与在波士顿大学进修的王石得缘结识。

王石对田朴珺一见倾心,就邀请她共进烛光晚餐,而田朴珺似乎也对这位长者颇有好感,于是欣然赴约。为了确定田朴珺不是图他的钱,王石在晚餐结束后,就佯装忘带钱,田朴珺见状,爽快地买了单。

连续吃了四顿饭后,王石始终让田朴珺结账,而田朴珺也都毫不犹豫地掏钱买单。直到第五顿饭,王石才终于买了单,并诚意十足地向田朴珺做出表白。

王石送给田朴珺一条价值不菲的定制款钻石项链,还跟她说:“如果我们能够在一起,你要什么我都答应,还保证让你当上5家上市影视公司的老板!”

王石掷地有声的一席话,确实产生了振聋发聩的效果,被他真情打动的田朴珺,娇羞地点着头,从那天开始,她正式成为“王的女人”。没和田朴珺在一起前,王石曾有过6位贴身秘书,为了打消她的疑虑,王石把这6个人都给辞了。没过半年,王石就和田朴珺领了证。

有一回,某品牌出了一款新车型,田朴珺只看了一眼,就深深喜欢上了。于是,她就告诉王石,自己想换车,就换这辆200万的车。

曾说过“你要什么我都答应”的王石,此番却明确拒绝了她。王石认为,车就是一件代步工具,没必要买什么豪车,20万的车就足以满足所有的出行需求。

田朴珺却不这样认为,她觉得遇到一样自己喜欢的东西,只要能力允许,就不要为以后留下遗憾。当然,她并没有说服王石,最后,只能自掏腰包将车提回家。

当然,即便王石没有满足田朴珺的买车要求,但这些年,他对她在事业乃至人生上的影响,却是她以前想都不敢想的。又如何会因为买车这等小事和王石心存计较呢?

2018年,有记者问田朴珺:“如果王石是个没钱的普通人,你会嫁给他吗?”田朴珺就说:“我和他是真爱,与物质无关。而且我还是一个颜控,如果不喜欢一个人,根本不可能和他发展恋情。”

这句话的言外之意,是在说王石颜值高么?只是这种说法,很难不让人陷入沉思啊,也许只有“萝卜白菜各有所爱”才能让田朴珺的说法,听上去稍微有那么点逻辑自洽的意思。

最近,有网友晒出一组王石和田朴珺甜蜜相携、大秀恩爱的照片。年逾古稀的王石,身材管理不错,从背后看颇有壮年小伙子的韵致,看来常年的登山训练和规律的健身训练,让他受益不浅。但头顶稀疏的发量,还是暴露了年龄,再是保养得宜,也逃不过“岁月不饶人”的铁律。

网上流行一则视频,拍的是王石夫妇与老友聚餐的画面。视频中,王石偶遇褚时健夫人马静芬,他还不时地称呼老人“姐姐”。后来,田朴珺入镜,见到王石口中的姐姐,马上开心地打招呼说:“奶奶好,好久不见!”

其实,以田朴珺40岁的年龄,称呼一个耄耋老人奶奶,也属正常,但如此称呼,却将王石与她的关系推入尴尬之地。

面对这份忘年恋,多数人都觉得这是青春与资源的对对碰,各取所需罢了,其实,往深层想,王石之所以选择田朴珺,就是因为在她身上,他发现了自己当年的勃勃欲望与莫大野心,田朴珺,就是年轻时的自己。

当年,他身处别人的掌控,如今,他成了主导力量,在新的婚姻关系中,王石彻底颠覆他在上段婚姻中的状态,他成了高高在上的资源提供方。

那些年,王石绝对压抑过,他需要通过一段新的关系修复过往,更需要从中得到一种宣泄,同时,他还能在田朴珺身上找到当初在商界东荡西除的自己。 https://t.cn/R2Wxnht

#新浪看点##财经##今日看盘##股票##投资##A股##今日关注#

【股期走势背离 资金提前布局猪周期拐点】

在猪价下跌背景下,养殖企业正面临着另一种煎熬。眼看着豆粕、玉米等饲料价格上涨,四川养殖户朱先生和当地的许多同行一样,为自家养的猪换了“食谱”。“我们现在自己配饲料,我每天用4吨料,一个月能省6000-7000元。”

中国证券报记者日前采访了多家养殖户、多位市场分析人士,对当前生猪市场养殖利润、市场供需、拐点预期等情况进行调查,了解到当前养殖企业处于亏损状态,而市场规模化有上升趋势。分析人士认为,生猪养殖板块股票与生猪期货价格的背离走势值得关注。

“改食谱”不少见

近日中国证券报记者采访多家养殖户、资深市场研究人士了解到,像朱先生这样为养殖的生猪“改食谱”现象,在中小养殖规模的企业当中,已经不是稀罕事了。

朱先生告诉中国证券报记者,现在养猪基本处于赔本阶段,养得越多亏损越多。现在他养猪每天消耗的饲料在4吨左右,今年玉米、豆粕价格一路上涨,比去年同期多出几百元(每吨)。饲料是养殖成本中的大头,现在猪价不理想,因此不得不想办法降低成本。“我们现在很多养殖场都用自配料,每天每吨料能省下50-60元。”

中国证券报记者又联系到江西一家养殖企业,该企业平时养殖规模在400-500头左右,现在仅仅维持100多头的存栏。该企业负责人王先生说,饲料占养猪成本的四成左右,今年饲料价格大涨,猪价又一直下跌。“我是从外面采购小猪来养,现在总体养殖成本平摊下来大概在7-8元/斤,但我们这的生猪收购价已经跌到每斤6元,养一头猪要亏400多元。”据卓创资讯统计,截至4月13日,三元生猪出栏均价12.46元/公斤,环比上涨1.32%,同比下降46.02%。

豆粕是生猪养殖的主要原料,其次是玉米,今年两者价格均上涨。文华财经数据显示,截至4月13日收盘,大连商品交易所豆粕、玉米期货主力合约价格分别报3905元/吨、2917元/吨,今年以来的涨幅分别达到20.45%、9.17%。

根据相关上市公司2021年的业绩预告或业绩快报,正邦科技、温氏股份、新希望等多家上市猪企2021年均处亏损状态。

“清明节过后,受终端需求疲软影响,多地屠宰企业开工率降低,多压价收购;同时,规模养殖集团积极出栏,共同导致二季度以来猪价下降,但由于局部地区散户出栏受限,猪价降幅有限。”卓创资讯分析师马丽媛对中国证券报记者表示。

规模化水平明显提升

朱先生表示,去年以来,身边一些小规模的养殖户陆续退出市场,而大型企业无论在成本采购、养殖技术方面都更有优势,行业规模化明显提升。

“2018年6月开启了本轮猪周期,至2022年上半年历时约4年,时间跨度与以往猪周期相似。不同的是,以往猪周期价格波动多在10-20元/公斤,但本轮猪周期最高价涨至近42元/公斤。在高价刺激下,资金实力雄厚的规模养殖集团积极扩张,后期猪价的持续回落又让散户及中小场快速退出,加速了国内生猪养殖规模化进程。”马丽媛说。

从当前猪价走势看,从去年12月中旬开始,猪价处于持续的下跌状态,不过今年3月以来猪价环比降幅出现收敛甚至小幅反弹。市场人士介绍,今年3月3日-4日、3月10日以及4月2日-3日,国家陆续完成了三轮收储,加上部分地区疫情影响了生猪出栏调运,猪价在3月初一度出现小幅反弹。但清明假期过后,猪价再度走弱。

“近期上市猪企陆续公布了3月份生猪出栏数据,市场对当前生猪去产能进度产生了一定疑虑。”光大期货生猪分析师吕品对中国证券报记者表示,虽然头部企业生猪月度出栏量表现不错,但多数上市猪企公布的3月销售量均在百万头以下。“目前市场仍然处于2006年以来的第四轮猪周期的底部,规模较大的猪企纷纷加大生猪出栏力度,生猪产能去化速度不及预期,疫情背景下消费端未见明显起色等诸多因素均将本轮猪周期的运行时间拉长。”

资金“抢跑”

伴随前期猪价调整,一些聪明资金早已对新的周期拐点带来的投资机会提前“埋伏”。

今年以来,A股生猪养殖板块走出了一波相对独立的行情。Wind数据显示,截至4月13日收盘,申万生猪养殖指数今年以来累计上涨7.82%。若从本轮反弹起点去年8月份算起,该指数涨幅超40%。

猪肉股走势与生猪价格出现背离。文华财经数据显示,截至4月13日收盘,大连商品交易所生猪期货主力合约今年以来累计下跌17.5%,去年8月以来的跌幅达28%。

“尽管当前市场整体情绪低迷,但从能繁母猪产能兑现的角度来看,当前本来就是能繁母猪高峰期的兑现时间,价格必然偏低。随着生猪整体预期出栏量的下降,价格重心仍然有较大可能出现上移,实现触底反转。”中信建投期货生猪行业高级分析师魏鑫对中国证券报记者表示。

“随着天气转热,4-6月份需求下降,预计2022年二季度生猪价格仍可能偏低,本轮猪周期拐点或出现在今年三季度。”马丽媛说。

“今年以来,生猪概念股价格整体上行。股票市场反映的是行业未来发展预期,还有对应公司的估值评价。资金通过产能基础对公司下半年盈利作出改善预期,但是现货价格延续弱势,预期和现实之间出现明显‘劈叉’的情况。股市资金需要提前判断,进行中长期的投资,而现货市场仅针对当下的供需状况进行判断,二者走势产生明显分化。”美尔雅期货生猪行业研究员张瑞昊表示。

市场人士进一步指出,猪价底部反弹也常常是市场资金撤离、猪肉股价格回落的开始,追求“短平快”的资金甚至会在猪价反弹之前就撤出。


发布     👍 0 举报 写留言 🖊   
✋热门推荐
  • 她用细致周到的服务感染着每一位客户;以务实的态度、实干的精神、过硬的能力,赢得了客户的赞许!2022年疫情期间,她积极协调技术部门,为远赴乌兹别克斯坦施工的海外
  • 其实我们就是把你挡在去医院的路上健康每个女人,幸福每个家庭事实证明今天不养生,明天养医生伊曼儿不能包治百病,但妇科问题能调理❗我一直都在[太开心]#带你认识伊曼
  • 这时候的宋引章心气已经高到了一定程度,不仅是得到了柯相公的褒奖,另一边还有两个优质男人爱着自己,俗话说就是飘了,不过当她得知赵盼儿和顾千帆都要订婚以后,瞬间
  • 哦还有,这个主治跟我们说:我们组教授的脾气很不好,你们要做好挨骂的准备哦,Ta会当着病人的面骂你的。一下楼才发现自己想多了,卧槽这体感简直就是三伏天啊…不管了,
  • 更多变美记交流#纹绣[话题]##艺相形象设计[话题]##半永久[话题]##眉毛[话题]##纹眉[话题]##野生雾眉[话题]##半永久纹眉[话题]##雾眉[话题]
  • )#微博贴纸##天气即天意##就这一刻#最近疫情加上下雨☔️天,外出的人很少,街道冷清清的,逛超市看到了可爱的人参果,感叹现在的种植技术真是厉害啊,看到花店鲜艳
  •   勇于先行 当好示范   形成更多可复制可推广的绵阳经验   中国(绵阳)科技城是国家创新驱动版图上的重要一块,建设国家科技创新先行示范区,意味着要承担更大
  • 所以最终,你说喜欢一个人,其实是喜欢在某些维度变得更好的自己,这样没错吧。也所以谈恋爱,其实是在跟另外一个自己谈,另外一个相似却在不同维度各有千秋的自己,希望大
  • 今天下楼搬行李,我大致是可以搬得动的,但是我中途停了一下,然后一个小学妹就主动过来说要帮忙,她问我是不是要回家了,我说是的。还说以前自己搬行李的时候很希望有一个
  • 19日晚的比赛,同为全华班的两队都希望能够在对手身上找到转机的机会。刘智宇介绍了广州队的备战情况:这样的赛程对每个队都不容易,现在队内有一些伤病,大家方向一致,
  • 叫声软糯随便撸,现在还比较瘦因为之前口炎的原因,但是拔完牙后已经成了妥妥的干饭王啦!后面几针的费用我也都交过了~希望你:南京有独立住房,不考虑学生,家里封窗,能
  • 到了8楼,冲到打卡机面前显示是9:00(我们是9:01算迟到)然后,一下就识别到了,赶上了最后不到一分钟的卡、、、、[酷]感觉今天真的是老天必须要我打上这个卡。
  •   联系方式:15573058222(陈)  平江县小城微爱志愿者协会  平江县小城微爱志愿者协会成立于2015年2月,现有志愿者175人,主要服务于山区留守儿
  • 8、八字带偏财的女命在她们看来物质比爱情重要,但是与正财女不同的是偏财女更加没有底线,只要有钱就能驱使她们,同时在恋爱中偏财女对金钱的要求比正财女更高。她们对于
  • 希望能被善待,因为总被生活这样的重锤,慢慢的就不再有希望了】#北漂到底漂哭了多少人# 人生就是这样吧,每个人都有每个人的不容易。我只想特别谢谢一直以来无条件帮助
  • PP上是“發”字,这个大家都懂啦~上一条po图博下面的意见我都看了,有一些与我设计理念相违背的建议肯定是不会改的啦,提的最多的是关于眼睛高光的颜色和嘴巴形状,这
  • #快消品培训##赢销力##营销##王冠群#能做大的老板与做不大的老板的区别:能做大的老板都是认为别人有能力,每天思考如何整合与使用这些有能力的人,让他们帮自己
  • 其实天很蓝,阴云总要散;其实海不宽,彼岸连此岸;其实梦很浅,万物皆自然;其实泪也甜,当你心如愿太阳都没办法做到让所有人喜欢,我说它温柔,你说它刺眼。 其实天很蓝
  • #标记我一下[超话]# 《薄荷印记》特签幸运鹅名单汇总,同步更新ing 初荣:tb卡2s,pxx卡1s 盼源:pxx卡3s tb卡2s 文轩:tb卡2s,p
  • 希望你高考能取得好成绩,也希望你在以后的日子里可以平安喜乐,得偿所愿,愿所得皆所期,所失亦无碍,愿你一生温暖纯良,不舍爱与自由,永远温柔,永远热泪盈眶,永远欧皇