【家蚕育种有了数字“字典”】有没有一部“字典”，可以让基因组图谱科学家根据需求，有针对性地对家蚕育种进行设计？
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室主任代方银团队（以下简称研究团队）把这一梦想变成了现实。他们完成家蚕大规模种质资源基因组解析（“千蚕基因组”），绘就家蚕超级泛基因组图谱。该研究在世界上率先实现家蚕基因库数字化，创建“数字家蚕”，对深化功能基因组研究和推进家蚕模式化、开启家蚕设计育种具有重大推动作用。相关研究成果https://t.cn/A6otxfC6日前在线发表于《自然-通讯》。
最大的长读长泛基因组
白白胖胖的春蚕吐丝作茧，这一神奇的小昆虫见证了我国数千年的丝绸文化。
上世纪八九十年代以来，茧丝相关性能已经没有明显提升，高产、超高产新品种培育陷入停滞状态，培育品种性能与生存能力不协调，严重限制了蚕桑产业效益的进一步提升。
破局的关键在育种。培育高产、优质、高抗、具有特殊性能的高价值蚕品种是家蚕育种的重要方向。对控制这些性状的优异基因进行规模化挖掘，成为家蚕遗传学研究的重点，也是难点。
“由于此前家蚕参考基因组来自单一品系，所能提供的变异信息十分有限，难以支撑规模化、高通量挖掘育种优良基因，直接阻碍了家蚕分子育种工作的推进。”代方银说。
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室教授童晓玲介绍，研究团队对1078份蚕种质资源进行了测序，其中包括47个野桑蚕、205个家蚕地方种、194个实用种和632个突变体。在对家蚕和野桑蚕进行二代、三代测序后，研究团队绘制了一个高精度家蚕泛基因组图谱，囊括了目前最全面的家蚕和野桑蚕基因组信息，构建了家蚕首张高分辨率的长读长泛基因组。
值得一提的是，课题组公布的蚕泛基因组由545个长读长测序的样本构成，是迄今动植物中规模最大的长读长泛基因组，被称为蚕超级泛基因组。
“数字家蚕”让研究变得高效
家蚕超级泛基因组图谱涵盖了蚕的所有遗传信息，通过这张图科学家可以直接对接表型和基因组密码。如果说以前鉴定特定性状的基因或其因果变异犹如“大海捞针”，现在可谓是“瓮中捉鳖”——超级泛基因组提供了“精细网格化”的“坐标”指导，对于行家里手来说像是“查字典”。
该研究完成了基因组测序的家蚕材料涵盖全世界家蚕代表性种质资源的90%以上，这些材料含有丰富的表型多样性，包括不同茧丝产量质量、抗病抗逆、体形体色等。“获得这些极为丰富的资源的完整基因组信息，意味着构建了‘家蚕数字基因库’，实现了家蚕这个物种遗传信息的数字化——‘数字家蚕’。”代方银告诉《中国科学报》。
他表示，“数字家蚕”类似于一部家蚕遗传多样性字典，对接了表型与序列。通过比较特定表型的存在和缺失的基因组（比较基因组分析），可以快速、精准地找到负责相关表型的基因组序列。
比如，之前克隆一个控制重要性状的基因，往往要对基因组重测序，并与参考基因组比对，这需要花费3至5年时间。当控制性状的基因组变异位于基因的调控区域或是一些复杂的大片段结构变异，就很难再深入研究下去。
中国工程院院士向仲怀表示，运用家蚕超级泛基因组图谱，科研人员将开启家蚕功能基因组研究和分子育种研究的新篇章。
比如，可以高效率、高通量对接基因型和表型，即精细解析控制性状的遗传基础；针对基因组全区域进行研究，不局限于占基因组不到3%的基因编码区；对基因组里大片段结构变异进行研究，包括基因重复、大片段插入、缺失、倒位，以及染色体断裂、融合等。
有望实现“超级蚕”育种计划
利用家蚕超级泛基因组进行研究，会有哪些重要的科学发现？
童晓玲表示，家蚕经历驯化和改良后，其重要经济性状包括茧丝产量、质量，蚕的抗病抗逆、温顺耐拥挤等性状得到大幅提升，但因缺乏对这些性状产生原因的认识，无法将所有优异性状聚于同一个家蚕品种。
研究团队鉴定到468个驯化相关基因和198个改良相关基因，其中新鉴定的驯化相关基因和改良相关基因分别为264个和185个。同时，研究团队阐明了中国实用种和日本实用种杂交产生最突出杂种优势种的遗传基础，这些发现将推动“超级蚕”育种计划的实现。
茧丝产量和质量（丝纤度等）是家蚕重要的经济性状，但是目前科研界对家蚕茧丝产量和质量的关键控制基因仍认识不清。超级泛基因组能精准高效地揭示这两个代表性性状的控制基因，为家蚕分子育种提供直接靶标。
不仅如此，家蚕超级泛基因组还会给考古界、生物界带来影响。
研究团队比较千余个蚕的基因组信息，最终揭示了家蚕起源于黄河中下游地区。这与考古学发现，如山西夏县出土的半颗蚕茧、石雕蚕蛹等不谋而合。
家蚕含有丰富的表型多样性突变体，是研究生物多样性的理想模式生物，经过各国蚕学家长期研究，至今仅鉴定出50余个性状控制基因，大部分性状控制基因仍然未知。而应用家蚕超级泛基因组，能够轻松确定广受关注的昆虫警戒色和胚胎滞育的关键基因、精细的基因组变异特征。
这就难怪一位论文审稿专家激动地表示：“该研究揭示了蚕完整泛基因组，会让家蚕研究人员睁大眼睛、高兴得跳起来。”https://t.cn/A6ocvOZH
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室主任代方银团队（以下简称研究团队）把这一梦想变成了现实。他们完成家蚕大规模种质资源基因组解析（“千蚕基因组”），绘就家蚕超级泛基因组图谱。该研究在世界上率先实现家蚕基因库数字化，创建“数字家蚕”，对深化功能基因组研究和推进家蚕模式化、开启家蚕设计育种具有重大推动作用。相关研究成果https://t.cn/A6otxfC6日前在线发表于《自然-通讯》。
最大的长读长泛基因组
白白胖胖的春蚕吐丝作茧，这一神奇的小昆虫见证了我国数千年的丝绸文化。
上世纪八九十年代以来，茧丝相关性能已经没有明显提升，高产、超高产新品种培育陷入停滞状态，培育品种性能与生存能力不协调，严重限制了蚕桑产业效益的进一步提升。
破局的关键在育种。培育高产、优质、高抗、具有特殊性能的高价值蚕品种是家蚕育种的重要方向。对控制这些性状的优异基因进行规模化挖掘，成为家蚕遗传学研究的重点，也是难点。
“由于此前家蚕参考基因组来自单一品系，所能提供的变异信息十分有限，难以支撑规模化、高通量挖掘育种优良基因，直接阻碍了家蚕分子育种工作的推进。”代方银说。
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室教授童晓玲介绍，研究团队对1078份蚕种质资源进行了测序，其中包括47个野桑蚕、205个家蚕地方种、194个实用种和632个突变体。在对家蚕和野桑蚕进行二代、三代测序后，研究团队绘制了一个高精度家蚕泛基因组图谱，囊括了目前最全面的家蚕和野桑蚕基因组信息，构建了家蚕首张高分辨率的长读长泛基因组。
值得一提的是，课题组公布的蚕泛基因组由545个长读长测序的样本构成，是迄今动植物中规模最大的长读长泛基因组，被称为蚕超级泛基因组。
“数字家蚕”让研究变得高效
家蚕超级泛基因组图谱涵盖了蚕的所有遗传信息，通过这张图科学家可以直接对接表型和基因组密码。如果说以前鉴定特定性状的基因或其因果变异犹如“大海捞针”，现在可谓是“瓮中捉鳖”——超级泛基因组提供了“精细网格化”的“坐标”指导，对于行家里手来说像是“查字典”。
该研究完成了基因组测序的家蚕材料涵盖全世界家蚕代表性种质资源的90%以上，这些材料含有丰富的表型多样性，包括不同茧丝产量质量、抗病抗逆、体形体色等。“获得这些极为丰富的资源的完整基因组信息，意味着构建了‘家蚕数字基因库’，实现了家蚕这个物种遗传信息的数字化——‘数字家蚕’。”代方银告诉《中国科学报》。
他表示，“数字家蚕”类似于一部家蚕遗传多样性字典，对接了表型与序列。通过比较特定表型的存在和缺失的基因组（比较基因组分析），可以快速、精准地找到负责相关表型的基因组序列。
比如，之前克隆一个控制重要性状的基因，往往要对基因组重测序，并与参考基因组比对，这需要花费3至5年时间。当控制性状的基因组变异位于基因的调控区域或是一些复杂的大片段结构变异，就很难再深入研究下去。
中国工程院院士向仲怀表示，运用家蚕超级泛基因组图谱，科研人员将开启家蚕功能基因组研究和分子育种研究的新篇章。
比如，可以高效率、高通量对接基因型和表型，即精细解析控制性状的遗传基础；针对基因组全区域进行研究，不局限于占基因组不到3%的基因编码区；对基因组里大片段结构变异进行研究，包括基因重复、大片段插入、缺失、倒位，以及染色体断裂、融合等。
有望实现“超级蚕”育种计划
利用家蚕超级泛基因组进行研究，会有哪些重要的科学发现？
童晓玲表示，家蚕经历驯化和改良后，其重要经济性状包括茧丝产量、质量，蚕的抗病抗逆、温顺耐拥挤等性状得到大幅提升，但因缺乏对这些性状产生原因的认识，无法将所有优异性状聚于同一个家蚕品种。
研究团队鉴定到468个驯化相关基因和198个改良相关基因，其中新鉴定的驯化相关基因和改良相关基因分别为264个和185个。同时，研究团队阐明了中国实用种和日本实用种杂交产生最突出杂种优势种的遗传基础，这些发现将推动“超级蚕”育种计划的实现。
茧丝产量和质量（丝纤度等）是家蚕重要的经济性状，但是目前科研界对家蚕茧丝产量和质量的关键控制基因仍认识不清。超级泛基因组能精准高效地揭示这两个代表性性状的控制基因，为家蚕分子育种提供直接靶标。
不仅如此，家蚕超级泛基因组还会给考古界、生物界带来影响。
研究团队比较千余个蚕的基因组信息，最终揭示了家蚕起源于黄河中下游地区。这与考古学发现，如山西夏县出土的半颗蚕茧、石雕蚕蛹等不谋而合。
家蚕含有丰富的表型多样性突变体，是研究生物多样性的理想模式生物，经过各国蚕学家长期研究，至今仅鉴定出50余个性状控制基因，大部分性状控制基因仍然未知。而应用家蚕超级泛基因组，能够轻松确定广受关注的昆虫警戒色和胚胎滞育的关键基因、精细的基因组变异特征。
这就难怪一位论文审稿专家激动地表示：“该研究揭示了蚕完整泛基因组，会让家蚕研究人员睁大眼睛、高兴得跳起来。”https://t.cn/A6ocvOZH
吉林长春哪家医院中医治膀胱癌效果好？ 膀胱癌是指发生在膀胱黏膜上的恶性肿瘤。是泌尿系统最常见的恶性肿瘤，也是全身十大常见肿瘤之一。占我国泌尿生殖系肿瘤发病率的第一位，而在西方其发病率仅次于前列腺癌，居第2位。那么吉林长春哪家医院中医治膀胱癌效果好？
近些年来吉林东方中医院中医肿瘤科受到很多人的认可，在吉林周边地区乃至全国享有盛名，在众多东北人心中也同样是最好的，越来越多的人选择到吉林东方中医院中医肿瘤科看病，很多患者都是慕名而来。
吉林长春哪家医院中医治膀胱癌效果好？吉林东方中医院中医肿瘤科广纳医学人才，拥有专业的医疗精英团队，积极进行专业学术交流，并先后与多家知名医院取得合作，拥有对各种癌症疾病的临床诊疗具有丰富经验的高水平医疗护理团队。吉林东方中医院中医肿瘤科崔蓝主任具有扎实的理论功底和娴熟的医疗技术，擅长诊治肝癌，胃癌、乳腺癌、肠癌等疑难顽疾，针对不同患者的不同病症，制定规范化的诊疗方案，真正做到：专门的病、专门的医生、专业的诊疗。
吉林长春哪家医院中医治膀胱癌效果好？吉林东方中医院中医肿瘤科用高、精、尖的癌症肿瘤检测、治疗系统化医疗设备进行诊疗，有效评估患者病情，发现患者病因，指导临床治疗方案;规避了临床上肿瘤病错诊误诊漏诊现象。
吉林长春哪家医院中医治膀胱癌效果好？吉林东方中医院中医肿瘤科崔蓝主任利用天然中草药，一人一方，调节体内平衡，抑杀癌细胞，提高免疫细胞活性，增强免疫功能，抑制癌细胞蔓延，减轻患者临床痛苦提高生活质量，延长生命。 https://t.cn/A6ocvKVw
近些年来吉林东方中医院中医肿瘤科受到很多人的认可，在吉林周边地区乃至全国享有盛名，在众多东北人心中也同样是最好的，越来越多的人选择到吉林东方中医院中医肿瘤科看病，很多患者都是慕名而来。
吉林长春哪家医院中医治膀胱癌效果好？吉林东方中医院中医肿瘤科广纳医学人才，拥有专业的医疗精英团队，积极进行专业学术交流，并先后与多家知名医院取得合作，拥有对各种癌症疾病的临床诊疗具有丰富经验的高水平医疗护理团队。吉林东方中医院中医肿瘤科崔蓝主任具有扎实的理论功底和娴熟的医疗技术，擅长诊治肝癌，胃癌、乳腺癌、肠癌等疑难顽疾，针对不同患者的不同病症，制定规范化的诊疗方案，真正做到：专门的病、专门的医生、专业的诊疗。
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吉林长春哪家医院中医治膀胱癌效果好？吉林东方中医院中医肿瘤科崔蓝主任利用天然中草药，一人一方，调节体内平衡，抑杀癌细胞，提高免疫细胞活性，增强免疫功能，抑制癌细胞蔓延，减轻患者临床痛苦提高生活质量，延长生命。 https://t.cn/A6ocvKVw
【川普称其前任私藏"数百万份"白宫文件 国家档案馆反驳】
在前总统川普指称他的三位前任保留了“数百万份”白宫文件后，负责保存美国政府档案的国家档案馆周二反驳了这些说法。
川普正面临司法部的刑事调查，涉及他2021年1月卸任时从白宫带走的十余箱文件，以及他是否试图阻挠调查。联邦调查局（FBI）在8月份对川普海湖庄园住所的突袭中，查获了大约1.1万份文件，其中100份被标记为机密。
周日，在亚利桑那州的一次集会上，川普指责三位前总统——老布什、小布什和克林顿——带走了数百万份文件，并把它们存放在不安全的地方，包括一家中餐馆、一家保龄球馆和一家汽车经销店。
周二，国家档案和记录管理局(NARA)发布声明，没有点名川普，但表示已经掌握了他指称的三位前总统的所有记录。川普周日还重申了对前总统奥巴马不当留存白宫文件的说法，这些说法也曾遭到国家档案馆的反驳。
国家档案馆表示，这些前总统的记录曾被转移到未来总统图书馆附近的临时设施。
声明说：“所有这些临时设施都符合严格的档案和安全标准，全部由NARA员工管理和配备人员。”
国家档案馆补充说：“那些表明或暗示前总统或其代表在卸任后拥有这些总统记录，或这些记录被保存在不符合标准的设施内的报道是虚假和有误导性的。”
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在前总统川普指称他的三位前任保留了“数百万份”白宫文件后，负责保存美国政府档案的国家档案馆周二反驳了这些说法。
川普正面临司法部的刑事调查，涉及他2021年1月卸任时从白宫带走的十余箱文件，以及他是否试图阻挠调查。联邦调查局（FBI）在8月份对川普海湖庄园住所的突袭中，查获了大约1.1万份文件，其中100份被标记为机密。
周日，在亚利桑那州的一次集会上，川普指责三位前总统——老布什、小布什和克林顿——带走了数百万份文件，并把它们存放在不安全的地方，包括一家中餐馆、一家保龄球馆和一家汽车经销店。
周二，国家档案和记录管理局(NARA)发布声明，没有点名川普，但表示已经掌握了他指称的三位前总统的所有记录。川普周日还重申了对前总统奥巴马不当留存白宫文件的说法，这些说法也曾遭到国家档案馆的反驳。
国家档案馆表示，这些前总统的记录曾被转移到未来总统图书馆附近的临时设施。
声明说：“所有这些临时设施都符合严格的档案和安全标准，全部由NARA员工管理和配备人员。”
国家档案馆补充说：“那些表明或暗示前总统或其代表在卸任后拥有这些总统记录，或这些记录被保存在不符合标准的设施内的报道是虚假和有误导性的。”
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