每日一问1：UAAU四联核苷酸为什么可以增强大肠杆菌中转录终止的效率？
通常，终止密码子有UAA，UAG和UGA三种，如图1所示而大肠杆菌偏爱UAA终止子，特别是在其后加上U，形成UAAU四联核苷酸后，转录终止的效率会进一步增强。
文献（PMID：7828587）指出，由于终止子有3种，加上其后一位的碱基组成，共有3×4=12种组合，即UAAN，UAGN，UGAN，N代表任意核糖核苷酸。对于UAAN和UGAN，N对转录终止效率的影响效果为U＞G＞A≈C，这两者属于大肠杆菌较为常见的终止序列；而对UAGN来说，N对转录终止效率的影响效果为G＞U≈A＞C，但是UAG终止子在大肠杆菌中较为少见。UGAN对效率影响的变化范围可达到30倍，而UAAN和UAGN的变化范围为10倍。UAAU（80）属于强终止序列，UGAC（0.07）为弱终止序列。
那么这背后的机制又是什么呢？在沃森的分子生物学第七版中找到，转录终止的方式根据是否依赖于Rho因子分为两种，即Rho-dependent和Rho-independent两种。
Rho因子在其中的作用有很多种模型，如①Rho因子可以推动RNA聚合酶与DNA-RNA杂合体相对运动从而引起终止②Rho因子通过使RNA脱离RNA聚合酶引起终止③Rho因子引起RNA聚合酶构象变化引起终止。目前的研究认为第三种至少是转录终止机制的一个重要组成部分，具体细节不在这里赘述。
而不依赖于Rho因子的终止方式，或许可以解释UAAU是强终止序列的原因。这种方式的终止结构由两部分组成，如图2所示：一段反向重复序列，约20个核苷酸；后面跟着8个A-T碱基对。8个A-T碱基对。前者可以形成一个发夹结构，在空间上阻断了转录的继续进行；后者因为是由DNA序列中的A转录出RNA中的U，而A-U碱基对是作用力最弱的碱基方式，作用力较弱也有利于RNA链的脱离，从而使转录终止。
整个转录终止的过程可以如图3所示。

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