【科研进展】白明研究组合作揭示远缘物种具有更相似表型和基因型不一定是因为趋同演化

  近日,中国科学院动物研究所白明研究组、浙江大学张国捷团队联合深圳华大生命科学研究院、中国科学院昆明动物研究所、哥本哈根大学等中外多个课题组,公布了对有袋类哺乳动物的物种辐射性大爆发过程的研究结果。该结果重建了有袋类物种的演化关系,并揭示了物种快速分化过程中,一些随机事件有可能会导致远缘物种具有相似表型的现象,解释了利用形态和分子数据在构建物种树经常出现冲突的发生机制。

  早在19世纪,达尔文就在他的旷世著作《物种起源》中提出现在地球上的所有物种最初都是从同一种原始生命演化而来,即共同祖先理论。由这个共同祖先不断分叉演化形成现在物种类群的历程即构成了生命之树,从简单的单细胞生物到复杂的生命体,每个物种都可以找到它的最近缘物种和最近共同祖先。以人类为例,人类约在700万年前与黑猩猩从共同祖先古猿分化形成,古猿类和旧世界猴在约2800万年前拥有相同的祖先,最早的灵长类物种祖先可以追溯至8000万年前,而目前地球上的哺乳动物在约两亿多年前都有共同祖先。重构正确的物种关系树是演化生物学研究和开展跨物种比较研究的基础,对我们推理各种生物学现象的起源过程至关重要。

  DNA是绝大多数生物的遗传蓝图,按照达尔文提出的物种演化模型,物种间DNA序列的差异可以反映出物种的分化历程,即DNA序列越相似的物种在生命之树上就更接近。同时,表型由DNA来决定,理论上携带相同表型的物种演化关系也就越接近。依据这样的推论,形态数据和DNA数据都可以用来构建物种树。但实际上,DNA数据与形态特征在推断物种演化历程上经常出现相互矛盾的结果。自80年代以来,利用DNA数据重构物种演化历程逐渐成为主流,但仍缺乏研究来解释为什么会存在这样的矛盾,为什么形态信息经常会得到不可靠的物种关系树。

  分子树和与形态树的矛盾经常发生在经历过物种快速分化的类群里。不完全的谱系分选(incomplete lineage sorting)就是一种可以导致上述情况出现的原因。多个物种在极短的时间内从一个共同祖先里分化出来,使得某些祖先基因的多态性在随后的物种分化历程中被随机分选到分化出的不同物种里,从而使得部分分化后形成的多个物种随机保留了相同的基因型。以人、黑猩猩和大猩猩为例。我们知道,相较于大猩猩,人与黑猩猩的亲缘关系更近。如图所示,三者共同祖先的群体具有较高的遗传多样性,大猩猩在第一次物种分化后形成,随着时间的推移,大猩猩的群体最终固定了蓝色的基因型。人和黑猩猩的共同祖先群体继承了橙色和蓝色两种基因型,然而在第二次物种分化的时候,人可能最终随机固定了和大猩猩一样的蓝色的基因型,黑猩猩最终随机固定了橙色的基因型。这样一来,我们就会观察到人的一些基因组序列跟大猩猩更相似,而跟黑猩猩差异更大。尽管黑猩猩是与人最近缘的物种,在人的基因组里约超过15%的基因组区域,是跟大猩猩更相似的。这种不完全的谱系分选现象在许多经历过物种大爆发的类群里均出现过,比如各种哺乳动物类群、鸟类、昆虫、鱼类等,但这种现象对性状的演化是否存在影响一直没有研究。

  为了研究不完全的谱系分选对物种形态和性状演化的影响,研究团队利用有袋类动物开展研究。之前的一些研究指出现存有袋类物种起源的过程经历了物种大爆发,导致了长期以来对有袋类物种早期演化关系存在争议。而这一争议主要围绕着南美有袋类微兽目(Microbiotheria)的演化地位。小山猴是该目唯一的现存物种,其作为南美洲的有袋类动物,却在骨骼、生殖器官和大脑结构等诸多方面与澳洲的有袋类动物更相似,尤其是袋鼠、考拉等双门齿目动物。正是由于这种形态的相似性,早前基于形态特征推定的演化关系认为小山猴应该和双门齿目的袋鼠和考拉更近缘,进而推测美洲小山猴应起源于澳洲。然而,本研究利用小山猴和其他有袋类动物的全基因组数据,表明小山猴应该是澳洲所有有袋类动物的姐妹群,也就是它和是澳洲有袋类有共同祖先但不属于澳洲有袋类。进一步的分析揭示,有袋类基因组有超过50%区域构建出的分子树跟真实的物种分化过程不一致,即小山猴反而跟某些澳洲有袋类之间的相似度要大于澳洲有袋类之间的相似度。早前观察的那些与真实物种发生过程不符的性状特征很可能是由于物种快速分化的过程不完全的谱系分选导致的。

  这些有冲突的基因组区域包含了上百个与神经系统、免疫系统、骨骼形态等相关的基因,它们可能与现今物种性状特征与物种发生历程之间的矛盾有关。研究推测,不完全的谱系分选所引发的祖先多态性的随机固定可能会偶然地导致两个亲缘关系较远的物种继承相同的祖先基因型,如果不同的祖先基因型会产生不同的形态特征,那么这样一来,就可能会导致远缘物种具有更加相似的表型。为了验证上述猜想,研究人员利用博物馆馆藏标本确定了小山猴的肱骨弯曲形态、脊柱棘突高度、门牙形态都是跟双门齿目的袋鼠和考拉更为相似。随后,研究团队再利用比较基因组学分析手段筛选候选基因,采用基因编辑技术对受不完全的谱系分选影响的基因建立小鼠实验模型。通过实验小鼠和野生小鼠的骨骼性状扫描结果的比较,研究人员证实了受不完全的谱系分选影响的基因型替换确实产生了符合预期的表型结果。

  物种性状的演化被认为是物种长期适应环境的结果:突变产生新的基因与新的性状,新基因通过繁殖扩散开来,有利于生存与繁殖的性状及其基因会被自然选择保留下来。在远缘物种中出现相同的性状,过去往往会用趋同演化来解释这样现象。然而,这一研究则揭示不同类群间相同性状的出现也可能是随机遗传了祖先性状引起的。同时,这一研究还证明,仅依靠部分基因、部分性状的溯源来构建物种关系树是不可靠的,全基因组数据才是重构物种发生历程的金标准。通过全基因组数据可以充分揭示不完全的谱系分选作为一种可能的机制来解释基因组物种树和表型变异之间冲突的现象。此外,本研究还综合了古气候地理,物种分化、形态、DNA等多方面证据来佐证有袋类物种演化进程。

  此外,近年来,测序技术的发展将基因组学研究带入了完美参考基因组的新时代。但本研究是基于二代测序技术的基因组完成的,这也提示我们不要过分追求新技术,而忽视了科学问题的重要性。

  该成果已于2022年4月20日以题目为“Incomplete lineage sorting and phenotypic evolution in marsupials”的论文在线发表于国际顶级学术期刊《细胞》(Cell)杂志,深圳华大生命科学研究院冯少鸿博士和中国科学院动物研究所白明研究员为论文共同第一作者,论文通讯作者张国捷教授近日以讲席教授身份加盟浙江大学医学院。冯少鸿博士现任浙江大学“百人计划”研究员。

  文章链接:
  https://t.cn/A66DMTtT

阅读原文:https://t.cn/A6X7FBSs

#赌王何鸿燊遗产争夺案宣判#
2022年4月19日何超贤“败诉”
2022年4日20日赌王何鸿燊长房被“推上热搜”
这是我第一次参与热搜…开贴留念…

黎婉华女士的后代虽然“败诉”了,但赌王何鸿燊却被骂上了“热搜”…渣男…凤凰男…不绝于耳…[允悲][允悲][允悲]

赌王对原配一脉太“狠”了点…有点“赶尽杀绝”…我也忍不住了,趁着网友们的“大军”…也附和一起骂骂赌王这个现代程世美…渣男…[允悲]

10月20号,王珞丹被法院列为了被行执人,执行标的为30.96万元,这是怎么回事?
据新闻报道,王珞丹案是一起建筑合同纠纷。原告称,王珞丹在昌平地区购买别墅用于装修。在未取得相关许可证的情况下,王珞丹父亲王卫星代表原告将工程承包给原告。
双方于2012年12月5日签订合同,原告按约定完成合同,工程总价156万余元。王珞丹陆续支付了55万元,至今仍欠款100多万元。
法院认定房屋是在没有相关许可证的情况下改建的,因此合同无效。判决生效后十日内,王珞丹支付原告工程款309600元。
00-1010虽然近年来没有好的作品出现在王珞丹,但它曾经拥有非常好的资源,非常受欢迎。怎么连100万装修款都拿不出来?拖了快十年了,被列为执行人。
今年,在王珞丹从公众视线中消失很长一段时间后,他带着热搜回来了。今天是因为欠条成了执行人。6月因为“退”上了热搜。
当时王珞丹在回复网友评论中说自己要退出娱乐圈了,这直接让她冲上了热搜。
在网友纷纷表示震惊的时候,工作室迅速发文称,“你想变美,那就赶紧看剧本吧。”王珞丹的话遭到了反驳。
经过这一系列操作,网友质疑:这是自导自演的炒作。而且,这种炒作手段也太拙劣了。虽然这个操作让她获得了热度和流量,但是她的名声也受到了影响。
但毕竟,王珞丹的炒作主要是因为她近年来并不红。早在去年八月,当王珞丹就发表了一则动态:“不想当好演员了,太累了,就想红。”那时,她可能就开始想办法让自己回到公众的视线中。
作为一个演员,最重要的还是演戏,这也是王珞丹最开始坚持的信念。,是什么让她宁愿失去自己的名声也要得到所有人的关注?不是因为不流行。不努力,娱乐圈就不会有这样的人。为什么王珞丹不受欢迎?她可以说是娱乐圈起点很高的人了。
出道两年后,女角色米莱,这个敢爱敢恨的有钱人在《奋斗》中成了名人。后来,他主演了许多电视剧,获得了最佳新人,提名白玉兰,并被评为“四小花旦”之一。
这样的演艺经历,演技也不错,本来应该如日中天的她,却遇上了一个人。
此人也是演员,两人在剧中合作过。当这个女演员也火起来的时候,大家才发现这两个人怎么这么像。这位女演员是白百何
王珞丹和白百何长相相似,年龄相同,直率敢说的性格也类似,就连最重要的戏路,两人都差不多。娱乐圈有两个同质化严重的演员,自然会有竞争。观众也会有选择。
这个时候白百何突然因为一部电影红了,《失恋33天》,然后就有了他演的什么火。在大屏幕上获得了非常明亮的效果。
这个时候,王珞丹的资源突然不如白百何,只能被彻底压制。网友不禁感叹:“有王,何必白活?”
除了与别人撞类型,王珞丹本身的性格也是她不火的一个因素。本来王珞丹就不喜欢炒作,在综艺节目里也不经常刷脸。她对自己感兴趣。
的要求就是做个好演员,演好每一部戏。不管所接的戏是好是烂,王珞丹在剧中的演技都是合格的。但是对于演技之外的要求,王珞丹就不会答应了。曾经的一部戏中,制作方要求她和男主角炒作恋情来为电视剧造势,王珞丹也拒绝了。
再加上她本来的性格过于耿直,经常在活动中说话不经大脑,得罪了不少人。
在拍摄了电视剧版《杜拉拉升职记》后,有记者问她和原版徐静蕾塑造的杜拉拉有什么不同时,她想都没想就回答道:“除了年龄没有什么不同。”这让比她年长几岁的徐静蕾十分不快,最后也是以王珞丹私下道歉才结束了此事。
不喜欢炒作加上说话爱得罪人,王珞丹的不火也似乎在情理之中了。
如今,王珞丹也改变了自己的想法,为了翻红也开始炒作,但是想到的方法却不怎么管用,直接败坏了自己的口碑。再加上这次的被执行人案,想必大众对她的看法更加难以挽回了。
目前,王珞丹与王传君的合作的电影《不老奇事》准备上映了,主要讲一位拥有超能力的男科学家和一位女电影明星的旷世爱情。不知道这次王珞丹的风波会不会影响到这部电影的上映。
王珞丹参演的电视剧《私奔的外婆》也刚刚结束拍摄,这部电视剧是与闫妮、姚晨合作的,阵容十分强大。王珞丹在剧里的戏份还会保留多少?这部剧能否如期上映呢?
明星比起大多数其他行业从业者,都可以说是高收入群体,他们每天需要担心的东西就是自己红还是不红。不管是红与不红,他们赚钱的脚步都不会停下。
这样的高收入下,还去拖欠打工人的辛苦钱,并且一拖就是9年。不管背后到底有什么隐情,这样不解决事情只会装死的样子实属不好看。
如果不是这次法院的判决,王珞丹是不是还会继续拖下去?你是怎么看的呢?


发布     👍 0 举报 写留言 🖊   
✋热门推荐
  • #原创[超话]##诗歌[超话]#叛离即刻终末的世界里触进隅隈撕扯掉最后的深浅不一黑白渐褪成空我想在这百里叛逃我想叛逃在破碎未追赶上雨滴前脚步渐缓里躺在滴答声中深
  •   即便这次破“7”了,未来随着国内经济企稳、美元指数回调再配合一些工具的使用,再涨回到“6”区间也是必然的事情。  国是直通车:“又不是只有人民币在贬值”确实
  • 好像都有哈哈哈但回想真正被张凌赫吸引 是在一个睡不着的夜晚 点开了他的一段采访 游刃有余的回答主持人的问题 还有大方的承认自己帅和对数学的天赋 当时觉得很搞笑
  • 想问一下这样的情况算不守信用吗[淚]好久没写东西了 简单写写8⃣️今天(10.15 是周六 但是一点周六的体验感都没有[抓狂][抓狂] 问就是大早上被叫去开班会
  • #白鹿[超话]##白鹿我说予你听##白鹿0923生日快乐#爱自拍的女鹅,愿你每天都开开心心,快快乐乐,祝你昭昭如愿,岁岁平安,自成人间绝色,远胜万缕清风,祝你拥
  • [泪]去酒店铺货,去超市谈摆位,找婚庆公司、、花了不少钱,酒没有卖出去几瓶,除了自己朋友办酒席用了一些[泪]现在还剩下500多件没有处理,租了库房都放了三年了,
  • 男二也很好,我曾经带着偏见看他,可我没想到他是这么好,他尊重十一娘,也信任侯爷,他实在是为十一娘做了很多,也是真心为两人高兴。琥珀我一开始也不太喜欢,最后也没
  • 10.31(周一)1978年10月31日,全国知识青年上山下乡工作会议在北京开幕,特别推荐连环画《知青模范邢燕子》。1981年11月,国务院知青办并入国家劳动总
  • 所以女人们看完以后学会别去比较,比较后痛苦的绝对不是别人只会是你自己,你心乱,你可能失去两个你生命中最珍贵的男人,一个你现任老公一个你蓝颜知己,得一知己死而无憾
  • #服装生意##[挤眼]拼夕夕互助[超话]##京东互助群[超话]# 要pdd互,回任何,拼多多助力,可以吗,看的到我吗,求求不要屏蔽了 也许当初他在你眼里是那么
  • 鹿哥这两天被骂成渣男听了好伤心,都说《一鹿伴晗》能说出做到的有几个,看看现在的明星权利榜单差了这么多,难道鹿晗谈个恋爱就不再是鹿晗了吗?不管怎么样都会支持你做
  • 在很多人看来,作为一个耐克保安,其命运,其潮鞋人生,大势已定,无从Adidas改变,亦AJ无所成就。在很多人看来,作为一个耐克保安,其命运,其潮鞋人生,大势已定
  • 侍者答仍然出于己手,不过偶得《茶经》一部,男子迫不及待地索来一阅,看到最后一页边角不易发觉处写着一句话:知晓你不过喜爱我泡的茶,既不能常伴左右,就将此法公诸天下
  • 据韩联社此前报道,韩国警察厅厅长尹熙根11月1日承认警方在日前发生的首尔梨泰院踩踏事故中处置不力,并向国民致歉。韩联社报道称,据警察厅11月1日公开的资料,警方
  • #芭蓓欧[超话]# 敲黑板⚠️敲黑板⚠️你们的林昕回来了‼️‼️这个微信好久不见[好的]来跟宝贝们汇报近两个月的工作[好的]近两个月来考察并且实践了更完美的项目
  • 我作为一个从小在农村长大的人,看了这个视频真的想乐,估计这个主播抱着十几个西红柿随便找块地,就说西红柿是新摘下来的。我作为一个从小在农村长大的人,看了这个视频真
  • 后来在我们楼后面的排水沟里发现了一只小狗,她出不来我们又进不去,我就只能每天从食堂拿点吃的喂他,喂了两周多终于对我有点信任了,准备过几天把他抓上来,结果框框一阵
  • ——崔护《题都城南庄》.人生的旅程就是这样,用大把时间迷茫,在几个瞬间成长。 深夜 对于别人来说可能是月亮悬空的时间点而已,但对我来说我会写下那些酸酸的小作文,
  • 其实这个时候的马思纯已经不是那会儿还没有出名时的素颜纯欲感了,反而这张还带了点那种娇俏的俏皮味道!以及这张……头包脸的发型,还有这个清纯到不能再清纯的脸啊!
  • 鲜灰对比,就是画面上的色彩,有鲜色和灰色,可以增强元素之间的对比。外派去国外的摄影师,听说去的地方条件不行所以特意买了很多好吃的,结果好不容易带了一箱好吃的过去