#肺癌##分子检测新技术#王洁：肺癌分子检测新技术的现状和挑战

肺癌新技术新八点临床应用的问题和挑战
1、新的分子检测技术如NGS的质控标准及流程需标准化、流程化、以克服假阴性和假阳性
2、NGS检测到基因变异（测序深度、CUT-OFF值等）与临床疗效的相关性尚需进一步明确
3、寄语组学的大数据分析需要临床医生、生物信息专家、基础科学家同力合作，以确定潜在靶点的临床意义，并尽早实现临床转化
4、除基因组外，寄语转录组和蛋白质组的功能性八点尚需开发、验证
5、基于肿瘤微环境的分子八点急需明确并进一步验证等。

视频：https://t.cn/Rp6zWA8

#2017国际罕见病大会# 通过介绍自己实验室发展的历史，杨博士谈到，她所在的实验室在以前的几十年内都只使用核型分析这一方法进行遗传病诊断，近年来才开始利用MLPA和NGS这些新兴技术，从而可以进行诸如表现型-基因型相关性分析、药物基因组学等用于疾病诊断与治疗。但她们不仅仅满足得到研究数据，更要把它应用于临床，在一年时间内，她们通过搜集2000多名患儿的数据，发现患儿存在并不小的基因异常阳性率，因此在NICU患儿中，许多有基因异常的以前都被忽略了。而现在就能够早期进行分子诊断，从而进行早期干预。

#什么是镶嵌型胚胎# What，镶嵌型胚胎?
 自从次世代基因定序 (Next generationsequencing, NGS) 方法问世后，使胚胎的着床前基因筛检检查(preimplantation genetic screening, PGS)，多了一项强大的工具。次世代基因定序由于有更高的分辨率，除了可以分辨染色体正常 (整倍体, euploid) 及染色体异常 (非整倍体, aneuploid) 的胚胎，还可以分辨出镶嵌型 (mosaic) 的胚胎。

何谓镶嵌型胚胎?
 一颗胚胎是由许多细胞共同组成，有时候不是每一颗细胞的染色体都正常，这种由正常和异常细胞混合组成的胚胎，就称为镶嵌型胚胎。根据研究，囊胚期的胚胎约 21% 是镶嵌型胚胎，这样的胚胎植入后会有甚么结果，在 7 月份的 Fertility and Sterility 这本期刊中，有一篇文章有深入的探讨。

作者收集了来自四家生殖医学中心，总共 143 个镶嵌型囊胚  (mosaic blastocyst)  的植入结果，对照组则是 1,045 个整倍体囊胚  (euploid blastocyst)  的植入成果。统计后发现，镶嵌型囊胚和整倍体囊胚的植入结果比较起来，着床率较低  (53% vs. 70%)，流产率较高 (25% vs 10%)，持续着床率较低 (40% vs 63%)。可见镶嵌型胚胎虽然可以怀孕，但是比较容易流产。

更深入的统计分析发现，若是镶嵌型胚胎的异常比例在 40~80% 之间，和异常比例在 20~40% 的镶嵌型胚胎比较起来，着床率 (33%) 和持续着床率 (22%) 较低，流产率 (33%) 较高。此外，若是镶嵌型胚胎影响的染色体超过 3，持续着床的机率低到只有 10%。而影响的染色体是 1 或 2 的话，持续着床的机率分别还有 46% 和 45%。
由此可见，镶嵌型的胚胎还是可以怀孕，怀孕的结果和异常比例以及影响的染色体数目有关，影响得越少怀孕的结果越好。因此，植入还是优先选择染色体正常的胚胎植入，若是没有染色体正常的胚胎，再选择镶嵌型的胚胎植入，还是可以得到不错的怀孕结果。

藉由NGS（新一代基因测序技术）平台来排除镶嵌型胚胎再植入染色体套数正常的胚胎，怀孕率较植入由aCGH平台判读为染色体套数正常的胚胎还要高。藉由NGS平台，可以再更精准的挑选出排除镶嵌型的正常胚胎，让怀孕率更上一层楼。