【首个高质量染色体级别簸箕柳基因组发布】簸箕柳,原产我国的当年开花小灌木,杨树的姊妹种,具有速生丰产、轮伐期短、个体较小,易于繁殖等特点,是重要的生物质能源和造林用材树种。
近日,《园艺研究》在线发表了南京林业大学教授尹佟明课题组完成的高质量染色体级别的簸箕柳参考基因组。
论文第一作者、南京林业大学博士韦素云告诉《中国科学报》,他们在该项研究中综合利用了三代PacBio测序和Hi-C技术。新组装的簸箕柳基因组大小为356 Mb,Contig N50为263908bp,是2014年完成的参考基因组的65倍,注释了36937个蛋白编码基因,95.29%的簸箕柳基因组序列能够挂载到19条染色体上。新组装的簸箕柳具有更高的连续性和完整性,将更有助于杨柳科物种比较基因组的研究,并为木本植物研究提供了高质量的基因组资源。
杨属和柳属是杨柳科的姐妹属。通过对比,研究人员发现,杨树和柳树起源于同一个祖先,在共同经历了一次杨柳科特有的全基因组复制事件之后,染色体的裂变和融合导致了杨柳姊妹属的分化。而杨柳基因组上不同的Ka/Ks突变率表明,柳树基因组受到了更强的纯化选择压力,这可能是导致柳树的基因数量小于杨树的重要因素。https://t.cn/A6wKplQN
近日,《园艺研究》在线发表了南京林业大学教授尹佟明课题组完成的高质量染色体级别的簸箕柳参考基因组。
论文第一作者、南京林业大学博士韦素云告诉《中国科学报》,他们在该项研究中综合利用了三代PacBio测序和Hi-C技术。新组装的簸箕柳基因组大小为356 Mb,Contig N50为263908bp,是2014年完成的参考基因组的65倍,注释了36937个蛋白编码基因,95.29%的簸箕柳基因组序列能够挂载到19条染色体上。新组装的簸箕柳具有更高的连续性和完整性,将更有助于杨柳科物种比较基因组的研究,并为木本植物研究提供了高质量的基因组资源。
杨属和柳属是杨柳科的姐妹属。通过对比,研究人员发现,杨树和柳树起源于同一个祖先,在共同经历了一次杨柳科特有的全基因组复制事件之后,染色体的裂变和融合导致了杨柳姊妹属的分化。而杨柳基因组上不同的Ka/Ks突变率表明,柳树基因组受到了更强的纯化选择压力,这可能是导致柳树的基因数量小于杨树的重要因素。https://t.cn/A6wKplQN
N号房事件 老师猥亵学生 红黄蓝幼儿园 轧狗至死车主不道歉反而骂人 妻子和丈夫吵架吵不过丈夫拿两个女儿和一个狗狗出气 各地伤医事件 还有很久以前的 滴滴奸杀事件 还有各种各样黑暗丑陋的社会事件 我记不起来了 也是真的不想记起来 有的人是不是没妈啊 我真的坚信美好的人占多数 并且始终热爱美好 真的真的拜托 这个世界能不能 对那些弱小的无助的无辜的每一个个体都友好一点。
#国际舆论批评美政客污名化中国#“我们可没把H1N1叫北美流感”,美国政客将新冠病毒称为“中国病毒”,遭到世卫组织驳斥。病毒命名不得与个体、种族、地域相联系,而美政客却恶意为之,其心可诛。己所不欲勿施于人,当前美国也在遭受疫情侵袭,奉劝某些政客别再借机“甩锅”,专心为美国人民和世界人民做点实事吧。 #辽宁团团在行动#
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