这是今天要分享的 拍得不太好看,但是我懒得再拍一次了[二哈]
①第一篇是川端康成的十六岁的日记,打动我的那句话是,这是孤寂的笑声……读到这句话我下定了要抄下来的决心,读到后面,我正在沐浴,心里感到一阵寂寥,我就知道抄对了
没有其他修饰词,只是单单的独白,所以格外打动人心。
②第二篇是夏日终曲里面,午后小憩时埃利奥听到的声音,他在后面说,就像多年以后,夜半时分,我听到从科德角隐约传来汽笛声时的感受。这句话把我一下子拽到多年以后,明明眼前看着一样的场景,加上了时空的距离,我的心里也加上了一段回忆。
③我也把然后我拥抱了你这首诗抄了一遍,因为我见到了焰火的另一个名字,火之花束。说到火之花束,在日语里粉丝的当用汉字是,春雨。

大家好,我是你们的科普达人小V,上一期我们主要讲细胞凋亡TUNEL的检测方法和实验操作注意点,这次我们来唠一唠凋亡检测的另一个大头——Annexin V法流式凋亡检测。
我们先来回忆一下上期中讲的Annexin V凋亡检测原理:

凋亡早期,细胞膜上的磷脂酰丝氨酸(PS)会从膜内翻到膜外,这是凋亡的一个典型特征,细胞凋亡处于早期阶段时,仅有PS外翻,而细胞膜仍然完整,随着凋亡进程的推移,细胞除了PS外翻以外,细胞膜通透性会改变,可以简单的理解成凋亡后期,细胞膜有穿孔的现象。

接下来我们再来看一下试剂,我们以最常见的Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒为例,试剂盒内一般都是3个组分:两个染料,再加一个为Annexin V标记提供钙离子环境的Binding Buffer。Annexin V本质是一个在钙离子环境下,能够与磷脂酰丝氨酸高度特异性结合的膜联蛋白,通过在该蛋白上标记的荧光基团,我们就可以标记凋亡细胞了,然后再搭配只能够进入受损细胞膜的核酸染料,就可以达到区分各阶段细胞的目的了。

我们将细胞分为三类:一是无PS外翻,也没有细胞膜破裂的健康细胞(两个染料都染不上),二是处于早期凋亡,有PS外翻但是细胞膜完好的细胞(可以染上Annexin V-FITC,不能够染上PI),三是处于晚期凋亡阶段,既存在PS外翻,也存在细胞膜破裂的晚期凋亡细胞(两种染料均可染上),第四类较为特殊,不做赘述,它是无PS外翻但是细胞膜受损的细胞,一般认为这是坏死细胞(可以染上PI,但是无法染上Annexin V-FITC)。
染完色后通过流式细胞仪,我们就能够对细胞群体进行定量和分析了。

以上就是Annexin V法检测凋亡的原理,怎么样是不是超简单~接下来我们来看一下这个实验本身,如何顺利的攻克这个检测呢?

硬核技术一:
细胞收集与染色——如何规范化操作?
Annexin V法的检测主体是流式细胞仪,因此样品必须处理成悬浮细胞的形式才可以上机检测。如果是细胞样品,悬浮细胞直接计数,贴壁细胞使用不含EDTA的胰酶消化成细胞悬液后进行后续操作;如果样本是组织,那么需要将其消化成细胞悬液才可以进行后续的实验步骤。
染色操作就非常的简单了,可以概括成以下几步:
(1) 细胞收集,PBS洗涤
(2) Binding Buffer重悬
(3) 染色
(4) 流式检测
一般建议大家收集105个细胞进入洗涤、染色步骤,洗涤时用预冷的PBS洗两遍,然后将PBS吸干净,用Binding Buffer重悬后进行染色,染色时两种染料各加5 µl,避光染色10 min即可终止。
这里要特别提醒一下大家,染色时间不建议延长,避免造成假阳性影响实验结果分析。

硬核技术二:
实验设计——我该拿这么多对照组怎么办?
流式的对照一直很令人头疼,今天小V就来为大家解答一下疑惑。
流式上机除了实验组的双染组之外,还需要添加一系列的对照,用于仪器荧光补偿的调整和后续的数据分析。我们可以将这些对照分为3类。
(1) 空白对照:不进行标记的裸细胞,一般选用待测实验组细胞。目的是看经处理后,细胞本身物理状态是否有变化,也用以进行细胞选群和阴性细胞大致位置的确定。
(2) 阴性对照:双染的不处理正常细胞,目的是排除细胞自身凋亡以及因操作过程带来的凋亡和坏死。另外,健康细胞分界线确定建议用这个对照,因为双染健康细胞相对于不染健康细胞会存在一定的荧光偏移。
(3) 单标组:单一染料标记的实验组细胞(有凋亡细胞)。这一个组别主要是用来进行荧光补偿的调节。流式检测中,荧光信号除了接收通道以外,还可能被另一通道接收到,影响该通道的数据,因此需要进行“补偿调节”,扣除该染料对其他荧光通道的影响。单标组有几种染料就应该做几管,所使用样本应该是该染料检测时,细胞能够有明显区分度的样本。

硬核技术三:
数据分析——救救孩子,怎么搞分析啊?
流式数据的分析是这个实验的重中之重了,我们应该如何操作,才能够得到漂亮的图呢?
首先,我们来认识一下流式分析的检测原理:流式细胞仪通道中一个个的样本流过,仪器会给它一个激发光,这个样本给出的发射光被流式的不同通道所接收,反映在图上就是下图所示的一个个小点(smooth图不以小点的形式显示),这边需要强调的是,流式通道一个个通过去的样品,不一定全是细胞,体系内的细胞碎片,各种小分子杂质只要能够被流式检测到,反映在图谱上,就是一个点。所以严格来说,流式图谱中的点,每个点代表的是一个事件。一般分析我们建议上机时至少采集10000个事件,我们认为这个是能够满足统计学样本分析量的基本要求的。

凋亡数据分析有三个重要步骤:画门、调补偿、画十字门。

1、画门
流式分析给出的第一个图谱,是FSC-SSC物理图谱(图a),这边是小V做的一个凋亡细胞样品,使用 Vazyme #A211 Annexin V-FITC/PI染色,上机分析。首先得到的是图a的FSC-SSC物理图谱,这是之后所有分析的基础。

横纵坐标轴FSC(前向角散射)和SSC(侧向角散射)分别代表了细胞大小和细胞颗粒度,通过这个图谱,我们能根据细胞大小、颗粒度做一个分类。这个分类有两个作用,一是如果两种细胞群在一起,细胞有明显的形态区别,可以做初步的分类,另一个重要作用是可以区分细胞与细胞碎片,如图a所示,我们能够看到很明显的两个群,右上方一群,左下角有一群大小和颗粒度都非常低的事件群体,这一群与右上群体具有明显区分度的事件,被判定为细胞碎片,是必须在后续分析中排除出去的。
为什么一定要出去细胞碎片再进行后续分析呢?
大家可以看图b和图d,图b是图a中所有事件全部划入后续分析得到的结果,图d是把图c中的细胞碎片排除以后进行分析得到的结果。很明显图d的分群比图b优秀太多,细胞碎片真的是一个及其影响分群的东西。
小V要专门另起一行来跟大家强调一下:细胞碎片,请尽力把它排除出你的分析范围!!!
好了,告一段落,搞定了基础的FSC-SSC图谱,成功选到了我们要分析的细胞,也就是做好了第一步:画门。我们接下来应该做什么呢?

2、调补偿

现在的流式细胞仪,调补偿的方法各有不同,有直接上机的时候跑个单染管,仪器自动给你调整好的,也有仪器万事不管,你自己跑完所有样本,回头吭哧吭哧自己做调节的。前者我们就不讲了,我们来讲一讲后者。
首先,必须调节补偿,细胞被激发出来的荧光除了被你设置的那个接收通道接收以外,还有一部分光会逸散到其他通道当中。用FITC作为例子,大家可以看下边这个表格:目标接收通道FL1只能接收到80 %的光,还有20 %散布在其他通道,FL2通道高达10 %,因此不扣除这部分荧光,对你数据分析的影响是非常大的。这个扣除某一荧光素误入到其他荧光通道中的信号的操作,就叫做“调节荧光补偿”。
实验中用到几种荧光,就要准备几种单染管!!

唠完前边这些理论内容,我们来说点实在的。在凋亡实验中,我们如何来调节荧光补偿呢?
这边小V推荐大家拿到原始数据以后,用Flowjo V10进行荧光补偿的调节,软件自动,不用发愁~这个操作分为3步
(1) 在FSC-SSC图中,选出待分析细胞群,一定尽量扔掉细胞碎片!
(2) 打开Flowjo的补偿调节界面,按需选择样品、阴性、阳性。Positive一般软件会自动选择,大家不用在意,请重点关注Sample和Negative,Sample是你的单染管,Negative指的是不含该染料的体系,一般统一用不染色的对照组就行了。
(3) 请点击Apply to Group按钮,选中对应的数据组,简单模式的你的补偿就已经OK了~

3、画十字门

最后呢我们来唠一下关于结果怎么看的那些事儿~
 
我们通过十字门,将细胞分为了四个象限(见图4),分别对应了四种不同的染色情况,左下象限是两个染料都没染到的健康细胞,右下是染上了Annexin V-FITC,没染上PI的早期凋亡细胞,右上象限我们一般情况下把它判定为晚期凋亡细胞(FITC和PI都能染上),但实际情况中,右上象限也是包括了一部分坏死细胞的,但是比例比较小,一般是忽略掉的。左上象限是坏死细胞(不经凋亡,因此没有PS外翻,但是细胞坏死后细胞膜损坏,因此核酸染料可以进入)。
讲完了结果的四个象限划分,我们回到四个象限本身,这个十字门该怎么画呢?
这边小V给到大家一个最优的画法~大家可以掏出你调节好补偿的数据,找出两个单染组,然后根据单染组的分群大致画出横纵坐标轴的荧光强度分界,然后在双染的数据中以这两个分界为基准,结合数据的实际分群情况进行微调,就是属于你数据的十字门了~这边也是强调一下,需要一起分析的数据们,都必须用统一的十字门哟!

最后,有几个点需要补充说明一下,也是大家经常遇到的一些问题:
1. 我的细胞贴壁非常的厉害,不含EDTA胰酶我都得消化个15、20分钟,怎么办?
遇到这种情况,小V建议你两害相权取其轻,Binding Buffer里最重要的组分是钙离子,建议大家用不含EDTA的胰酶是因为EDTA螯合剂会把钙离子扯下来,降低Annexin V的标记效率。但是如果消化要花费15分钟甚至更久,会引入很多机械性损伤,对于数据分析有很大的影响。所以这种时候用含EDTA的胰酶也是可以的,但是后续一定要洗涤干净。

2. 我能不能延长染色时间啊?我觉得10分钟染色,好像染得不够多啊?
不可以的哦,10分钟是最优化的染色时间,染色时间过长的情况下会产生假阳性,不利于真实的实验结果分析。

3. 我的细胞因为种种原因,就是没办法好好分群,我该怎么画门呢?
这里首先要同情一下这位同学,然后要告诉大家,遇到这种情况,可做一个健康细胞双染(同一份健康细胞,加染料与不加染料,其本底荧光值会有偏移,因此这边必须进行双染),健康细胞肯定是染不上染料的,那么你就得到了一团在左下角的细胞,以一团细胞的边界为标准画十字门,然后统一用这个十字门就可以了。

4. 我这边没有流式,我该在哪里停止实验啊?
收集好细胞后,经PBS洗涤并用Binding Buffer重悬,放置在冰上去平台处染色然后上机即可。中间时间不宜过长,否则细胞状态容易变差。

友情提醒:如果细胞本身凋亡就非常多,那么转移过程可能导致细胞状态急速变差。因此需要根据细胞本身特性和药物处理后细胞状态进行综合判断,建议针对不同实验条件开展优化。

好啦~今天的课小V就讲到这里了,如果大家在实验方面有任何疑问, 欢迎随时咨询小V,或直接联系您身边的诺唯赞人,我们将努力为您提供更优质的产品和服务!最后,祝福大家实验顺当结果好,细胞超乖不作妖!

北游记(17):罗伯斯角
罗伯斯角(也译作洛沃斯角)和罗伯斯角里的罗伯斯角州立自然保护区(Point Lobos State Natural Reserve)被誉为加利福尼亚几百个州立公园的“皇冠上的明珠”。这里实际上有两个海洋保护区,译成中文都是罗伯斯角国家海洋保护区,但英文却有一字之差:一个是Marine Reserve, 另一个是Marine Reservation Area。罗伯斯角附近的海域被认为是蒙特雷半岛和加利福尼亚海岸水肺潜水的最佳地点之一。
罗伯斯角位于卡梅尔海滨村的南部和大苏尔以北之间。这里有很多步道伸向各个角落,但多数沿海边延伸,也有一些海滩。因此这里足够你花上一天时间来细细品味。世界各地的游客慕名而来。每年有超过一百万游客光顾,使得这块总共只有13平方英里,备有150个停车场的小公园不堪重负。多数游客只好把车泊在一号公路旁。这对于体质好的人来说问题不大。但我们尤其是老太太要徒步走遍里面所有景点就太难了。据说州公园管理局正在考虑限制人数,凡欲参观者需提前预订。
我们在一号公路旁泊好车,决定先挑最近的一个景点 – 捕鲸湾看看,剩下的景点以后找机会再来。景区里给人第一印象是红松又粗又密,到处可见到几人合抱那么粗的树居然连根一起倒地。使我想起在大兴安岭时,几棵不过一人合抱那么粗的松树就被当成特殊景点,一来说明中国人口多,对自然资源的利用已经达到极限。另一方面,美国人口本来就少,还特别注重保护自己的资源,木材矿产尽量进口,所以到处都是原始森林。
海岸边上风景如画,吸引了无数摄影爱好者大显身手。不过,捕鲸湾海域长满海草,这给人一种不太舒服的感觉。有一群水肺潜水爱好者从水中冒出水面,正在水中休息,真心佩服他们的耐寒能力。


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