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金斯瑞密码子优化方法获发明专利授权

金斯瑞自主研发的“密码子优化”方法于2022年2月25日获国家知识产权局发明专利授权，该方法是一项基因优化技术，用于优化在宿主中表达蛋白质的核酸序列，以达到足够高的蛋白表达水平。该方法适于任何表达系统中的核酸序列，这也意味着金斯瑞在基因合成技术领域的领先地位。

该方法中涉及的计算机算法充分考虑到蛋白表达不同阶段可能遇到的多种复杂因素，如：密码子适应性、mRNA结构以及转录和翻译过程中不同的顺式元件，利用了群体遗传学和免疫学理论，通过对野生型或重组基因序列的优化，来提高在原核或哺乳动物表达系统中蛋白表达量，并已成功运用到数万条基因的表达中。

基于该专利中的原理开发的GenSmart™ Codon Optimization密码子优化软件，是一款免费的，便捷的在线工具，受到了众多研究者和科学家的欢迎，自2020年至今被著名期刊引用超4500次，同时也被Nature的综述推荐。

与市面上提供的其他密码子优化工具相比，GenSmart™ Codon Optimization更方便获取，界面更友好。所有的关键因素都已经整合进算法，只需填写基本的信息（比如序列和宿主），即可完成一键优化。

#蛋白质#
蛋白质合成是指生物按照从脱氧核糖核酸 （DNA）转录得到的信使核糖核酸（mRNA）上的遗传信息合成蛋白质的过程。蛋白质生物合成亦称为翻译（Translation），即把mRNA分子中碱基排列顺序转变为蛋白质或多肽链中的氨基酸排列顺序过程。
这是基因表达的第二步，产生基因产物蛋白质的最后阶段。不同的组织细胞具有不同的生理功能，是因为它们表达不同的基因，产生具有特殊功能的蛋白质，参与蛋白质生物合成的成份至少有200种，其主要体是由mRNA、tRNA、核糖核蛋白体以及有关的酶和蛋白质因子共同组成。
合成过程
原核生物与真核生物的蛋白质合成过程中有很多的区别，真核生物此过程更复杂，下面着重介绍原核生物蛋白质合成的过程，并指出真核生物与其不同之处。蛋白质生物合成可分为五个阶段，氨基酸的活化、多肽链合成的起始、肽链的延长、肽链的终止和释放、蛋白质合成后的加工修饰。
直接模板
翻译模板
protein biosynthesis
不同mRNA序列的分子大小和碱基排列顺序各不相同，但都具有5ˊ-端非翻译区、开放阅读框架区、和3ˊ-端非翻译区；真核生物的mRNA的5ˊ-端还有帽子结构、3ˊ-端有长度不一的多聚腺苷酸（polyA）尾。帽子结构能与帽子结合，在翻译时参与mRNA在核糖体上的定位结合，启动蛋白质生物的合成；帽子结构和ployA尾的作用还有稳定RNA；开放阅读框架区与编码蛋白质的基因序列相对应。
遗传密码表
在mRNA的开放式阅读框架区，以每3个相邻的核苷酸为一组，代表一种氨基酸或其他信息，这种三联体形势称为密码子（codon）。通常的开放式阅读框架区包含500个以上的密码子。
遗传密码的特点
一方向性：密码子及组成密码子的各碱基在mRNA序列中的排列具有方向性（direction），翻译时的阅读方向只能是5ˊ→3ˊ。
二连续性：mRNA序列上的各个密码子及密码子的各碱基是连续排列的，密码子及密码子的各个碱基之间没有间隔，每个碱基只读一次，不重叠阅读。
三简并性：一种氨基酸可具有两个或两个以上的密码子为其编码。遗传密码表中显示，每个氨基酸都有2,3,4或6个密码子为其编码（除甲硫氨酸只有一个外），但每种密码子只对应一个氨基酸，或对应终止信息。
四通用性：生物界的所有生物，几乎都通用这一套密码子表
五摆动性：tRNA的最后一位，和mRNA的对应不完全，导致了简并性

生存报告day2
1⃣️早上五点就醒了，看着天亮的[困]之前老在dy上刷到trt的风景，好看到我怀疑是p的，到了这边见到了实物真的挺好看的，如果在高层codon的话视野应该刚好[可怜]
2⃣️感觉到这边之后变丑了一点[抓狂]靠ins特效拯救一下
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现在才七点半 我好困好困好困好困啊啊啊[困][困]